Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TTLL3-223ENST00000466245 616 ntTSL 311.16□□□□□ -0.626e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.716e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.746e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-212ENST00000611468 603 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.756e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 MECP2-202ENST00000369957 784 ntTSL 310.15□□□□□ -0.786e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 TTLL3-225ENST00000473661 3811 ntTSL 59.67□□□□□ -0.866e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.876e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.976e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 SEC16A-201ENST00000277537 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.066e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-220ENST00000631210 490 ntTSL 1 (best)7.94□□□□□ -1.146e-6■■□□□ 13.7
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PUM1Q14671 RSF1-207ENST00000529470 448 ntTSL 25.33□□□□□ -1.563e-11■■□□□ 13.6
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PUM1Q14671 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-6■■□□□ 13.6
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PUM1Q14671 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.917e-6■■□□□ 13.6
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PUM1Q14671 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.191e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -11e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 26.87□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-9■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.161e-9■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.181e-9■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.261e-9■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.651e-9■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 PSME1-203ENST00000470718 476 ntTSL 33.28□□□□□ -1.881e-6■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-7■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 510.79□□□□□ -0.682e-7■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.519e-16■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 MCM3-203ENST00000421471 1030 ntTSL 510.41□□□□□ -0.749e-16■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 DDX18-204ENST00000474694 1083 ntTSL 58.68□□□□□ -1.029e-7■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.369e-7■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.252e-12■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.242e-12■■□□□ 13.6
PUM1Q14671 PTP4A1-202ENST00000470661 479 ntTSL 27.2□□□□□ -1.262e-12■■□□□ 13.6
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