RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392369.6

RAN-202, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAN, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAN-202ENST00000392369 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.65■■■■■ 8.9
RAN-202ENST00000392369 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa62.38■■■■■ 7.58
RAN-202ENST00000392369 ABCC9O60706 1549 aa60.63■■■■■ 7.3
RAN-202ENST00000392369 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.05■■■■■ 7.04
RAN-202ENST00000392369 DCAF8L2P0C7V8 631 aa58.73■■■■■ 6.99
RAN-202ENST00000392369 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa58.44■■■■■ 6.95
RAN-202ENST00000392369 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.43■■■■■ 6.94
RAN-202ENST00000392369 NACADO15069 1562 aa58.42■■■■■ 6.94
RAN-202ENST00000392369 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.3■■■■■ 6.92
RAN-202ENST00000392369 UNC13AQ9UPW8 1703 aa57.41■■■■■ 6.78
RAN-202ENST00000392369 SCRIBQ14160 1630 aa57.1■■■■■ 6.73
RAN-202ENST00000392369 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.77■■■■■ 6.68
RAN-202ENST00000392369 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.63■■■■■ 6.66
RAN-202ENST00000392369 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa56.5■■■■■ 6.64
RAN-202ENST00000392369 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.31■■■■■ 6.45
RAN-202ENST00000392369 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP55.2■■■■■ 6.43
RAN-202ENST00000392369 CECR2Q9BXF3 1484 aa55■■■■■ 6.4
RAN-202ENST00000392369 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.93■■■■■ 6.38
RAN-202ENST00000392369 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.68■■■■■ 6.34
RAN-202ENST00000392369 SMARCA4P51532 1647 aa54.66■■■■■ 6.34
RAN-202ENST00000392369 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.52■■■■■ 6.32
RAN-202ENST00000392369 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.2■■■■■ 6.27
RAN-202ENST00000392369 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.09■■■■■ 6.25
RAN-202ENST00000392369 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.05■■■■■ 6.24
RAN-202ENST00000392369 SMARCA2P51531 1590 aa54.04■■■■■ 6.24
RAN-202ENST00000392369 WIZO95785 1651 aa54.02■■■■■ 6.24
RAN-202ENST00000392369 NCAPD3P42695 1498 aa53.88■■■■■ 6.22
RAN-202ENST00000392369 HMGXB3Q12766 1538 aa53.72■■■■■ 6.19
RAN-202ENST00000392369 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP53.7■■■■■ 6.19
RAN-202ENST00000392369 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.6■■■■■ 6.17
RAN-202ENST00000392369 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.41■■■■■ 6.14
RAN-202ENST00000392369 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.81■■■■■ 6.04
RAN-202ENST00000392369 NESP48681 1621 aa52.61■■■■■ 6.01
RAN-202ENST00000392369 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.47■■■■■ 5.99
RAN-202ENST00000392369 CADPSQ9ULU8 1353 aa52.38■■■■■ 5.98
RAN-202ENST00000392369 CFTRP13569 1480 aa52.27■■■■■ 5.96
RAN-202ENST00000392369 ERCC6Q03468 1493 aa52.17■■■■■ 5.94
RAN-202ENST00000392369 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa52.13■■■■■ 5.94
RAN-202ENST00000392369 PRDM2Q13029 1718 aa52.01■■■■■ 5.92
RAN-202ENST00000392369 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.98■■■■■ 5.91
RAN-202ENST00000392369 FANCD2Q9BXW9 1451 aa51.82■■■■■ 5.89
RAN-202ENST00000392369 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.82■■■■■ 5.89
RAN-202ENST00000392369 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.67■■■■■ 5.86
RAN-202ENST00000392369 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.52■■■■■ 5.84
RAN-202ENST00000392369 CUX2O14529 1486 aa51.49■■■■■ 5.83
RAN-202ENST00000392369 WDR62O43379 1518 aa51.41■■■■■ 5.82
RAN-202ENST00000392369 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP51.29■■■■■ 5.8
RAN-202ENST00000392369 ABCC8Q09428 1581 aa51.23■■■■■ 5.79
RAN-202ENST00000392369 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.11■■■■■ 5.77
RAN-202ENST00000392369 TOPBP1Q92547 1522 aa51.1■■■■■ 5.77
RAN-202ENST00000392369 CUX1P39880 1505 aa51.09■■■■■ 5.77
RAN-202ENST00000392369 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.06■■■■■ 5.762e-6■■□□□ 11.9
RAN-202ENST00000392369 SYNJ1O43426 1573 aa50.95■■■■■ 5.75
RAN-202ENST00000392369 TOP2BQ02880 1626 aa50.87■■■■■ 5.73
RAN-202ENST00000392369 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.86■■■■■ 5.73
RAN-202ENST00000392369 FGD5Q6ZNL6 1462 aa50.76■■■■■ 5.72
RAN-202ENST00000392369 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP50.73■■■■■ 5.71
RAN-202ENST00000392369 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa50.54■■■■■ 5.68
RAN-202ENST00000392369 CHIC1Q5VXU3 224 aa50.53■■■■■ 5.68
RAN-202ENST00000392369 IFT140Q96RY7 1462 aa50.52■■■■■ 5.68
RAN-202ENST00000392369 SOGA1O94964 1423 aa50.52■■■■■ 5.68
RAN-202ENST00000392369 TRIM41Q8WV44 630 aa50.51■■■■■ 5.68
RAN-202ENST00000392369 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP50.5■■■■■ 5.67
RAN-202ENST00000392369 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP50.38■■■■■ 5.66
RAN-202ENST00000392369 WDR97A6NE52 1622 aa50.31■■■■■ 5.64
RAN-202ENST00000392369 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP50.28■■■■■ 5.64
RAN-202ENST00000392369 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.27■■■■■ 5.64
RAN-202ENST00000392369 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP50.17■■■■■ 5.62
RAN-202ENST00000392369 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP50.11■■■■■ 5.614e-8■■■■■ 106.1
RAN-202ENST00000392369 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.02■■■■■ 5.6
RAN-202ENST00000392369 GAPVD1Q14C86 1478 aa49.96■■■■■ 5.59
RAN-202ENST00000392369 KIF27Q86VH2 1401 aa49.9■■■■■ 5.58
RAN-202ENST00000392369 PBRM1Q86U86 1689 aa49.86■■■■■ 5.57
RAN-202ENST00000392369 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.85■■■■■ 5.57
RAN-202ENST00000392369 GRIN2BQ13224 1484 aa49.8■■■■■ 5.56
RAN-202ENST00000392369 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.67■■■■■ 5.54
RAN-202ENST00000392369 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa49.66■■■■■ 5.54
RAN-202ENST00000392369 CHD1O14646 1710 aa49.65■■■■■ 5.54
RAN-202ENST00000392369 IGF1RP08069 1367 aa49.61■■■■■ 5.53
RAN-202ENST00000392369 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.56■■■■■ 5.52
RAN-202ENST00000392369 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
RAN-202ENST00000392369 EEA1Q15075 1411 aa49.51■■■■■ 5.52
RAN-202ENST00000392369 ADAMTS12P58397 1594 aa49.48■■■■■ 5.51
RAN-202ENST00000392369 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.44■■■■■ 5.51
RAN-202ENST00000392369 CUL7Q14999 1698 aa49.42■■■■■ 5.5
RAN-202ENST00000392369 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.39■■■■■ 5.5
RAN-202ENST00000392369 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.38■■■■■ 5.5
RAN-202ENST00000392369 SYNJ2O15056 1496 aa49.37■■■■■ 5.49
RAN-202ENST00000392369 FBLN2P98095 1184 aa49.34■■■■■ 5.49
RAN-202ENST00000392369 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa49.33■■■■■ 5.49
RAN-202ENST00000392369 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP49.29■■■■■ 5.48
RAN-202ENST00000392369 OSCARQ8IYS5 282 aa49.29■■■■■ 5.48
RAN-202ENST00000392369 PRXQ9BXM0 1461 aa49.19■■■■■ 5.47
RAN-202ENST00000392369 GRIN2AQ12879 1464 aa49.18■■■■■ 5.46
RAN-202ENST00000392369 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.14■■■■■ 5.46
RAN-202ENST00000392369 KIF21BO75037 1637 aa49■■■■■ 5.44
RAN-202ENST00000392369 CLASP1Q7Z460 1538 aa49■■■■■ 5.43
RAN-202ENST00000392369 CEP170Q5SW79 1584 aa48.95■■■■■ 5.43
RAN-202ENST00000392369 NUP160Q12769 1436 aa48.91■■■■■ 5.42
RAN-202ENST00000392369 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.88■■■■■ 5.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms