RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473661.5

TTLL3-225, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL3, Length 3,811 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-225ENST00000473661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.69■■□□□ 1.38
TTLL3-225ENST00000473661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.64■□□□□ 0.9
TTLL3-225ENST00000473661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.99■□□□□ 0.79
TTLL3-225ENST00000473661 ABCC9O60706 1549 aa19.87■□□□□ 0.77
TTLL3-225ENST00000473661 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TTLL3-225ENST00000473661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.53■□□□□ 0.72
TTLL3-225ENST00000473661 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.39■□□□□ 0.7
TTLL3-225ENST00000473661 NACADO15069 1562 aa19.36■□□□□ 0.69
TTLL3-225ENST00000473661 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.36■□□□□ 0.69
TTLL3-225ENST00000473661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.26■□□□□ 0.67
TTLL3-225ENST00000473661 SCRIBQ14160 1630 aa19.06■□□□□ 0.64
TTLL3-225ENST00000473661 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.1
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TTLL3-225ENST00000473661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.65■□□□□ 0.58
TTLL3-225ENST00000473661 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.54■□□□□ 0.56
TTLL3-225ENST00000473661 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.43■□□□□ 0.54
TTLL3-225ENST00000473661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TTLL3-225ENST00000473661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TTLL3-225ENST00000473661 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.28■□□□□ 0.52
TTLL3-225ENST00000473661 SMARCA4P51532 1647 aa18.21■□□□□ 0.51
TTLL3-225ENST00000473661 WIZO95785 1651 aa18.09■□□□□ 0.49
TTLL3-225ENST00000473661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TTLL3-225ENST00000473661 SMARCA2P51531 1590 aa18.02■□□□□ 0.47
TTLL3-225ENST00000473661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.01■□□□□ 0.47
TTLL3-225ENST00000473661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
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TTLL3-225ENST00000473661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TTLL3-225ENST00000473661 NCAPD3P42695 1498 aa17.88■□□□□ 0.45
TTLL3-225ENST00000473661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.87■□□□□ 0.45
TTLL3-225ENST00000473661 HMGXB3Q12766 1538 aa17.8■□□□□ 0.44
TTLL3-225ENST00000473661 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.79■□□□□ 0.44
TTLL3-225ENST00000473661 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.66■□□□□ 0.42
TTLL3-225ENST00000473661 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.63■□□□□ 0.41
TTLL3-225ENST00000473661 TRIM41Q8WV44 630 aa17.56■□□□□ 0.4
TTLL3-225ENST00000473661 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.49■□□□□ 0.39
TTLL3-225ENST00000473661 CFTRP13569 1480 aa17.44■□□□□ 0.38
TTLL3-225ENST00000473661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
TTLL3-225ENST00000473661 ABCC8Q09428 1581 aa17.34■□□□□ 0.37
TTLL3-225ENST00000473661 NESP48681 1621 aa17.32■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.29■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.29■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.27■□□□□ 0.36
TTLL3-225ENST00000473661 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
TTLL3-225ENST00000473661 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL3-225ENST00000473661 PRDM2Q13029 1718 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL3-225ENST00000473661 ERCC6Q03468 1493 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 SYNJ1O43426 1573 aa17.13■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 CUX1P39880 1505 aa17.1■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 TOP2BQ02880 1626 aa17.09■□□□□ 0.33
TTLL3-225ENST00000473661 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.06■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.03■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 SOGA1O94964 1423 aa17.03■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 TOPBP1Q92547 1522 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.02■□□□□ 0.32
TTLL3-225ENST00000473661 EEA1Q15075 1411 aa17.02■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.02■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.01■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.01■□□□□ 0.31
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TTLL3-225ENST00000473661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 KIF27Q86VH2 1401 aa16.96■□□□□ 0.31
TTLL3-225ENST00000473661 CUX2O14529 1486 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.93■□□□□ 0.3
TTLL3-225ENST00000473661 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.9■□□□□ 0.3
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TTLL3-225ENST00000473661 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 WDR62O43379 1518 aa16.83■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.82■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 IFT140Q96RY7 1462 aa16.78■□□□□ 0.28
TTLL3-225ENST00000473661 GOLGA3Q08378 1498 aa16.77■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 IGF1RP08069 1367 aa16.76■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.74■□□□□ 0.27
TTLL3-225ENST00000473661 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.263e-11■■■■■ 47.8
TTLL3-225ENST00000473661 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.68■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 PRXQ9BXM0 1461 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 KIF21BO75037 1637 aa16.67■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
TTLL3-225ENST00000473661 GRIN2BQ13224 1484 aa16.64■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 WDR97A6NE52 1622 aa16.62■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 FBLN2P98095 1184 aa16.61■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
TTLL3-225ENST00000473661 CEP162Q5TB80 1403 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 CUL7Q14999 1698 aa16.57■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.56■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 CLIP1P30622 1438 aa16.53■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.52■□□□□ 0.24
TTLL3-225ENST00000473661 PBRM1Q86U86 1689 aa16.5■□□□□ 0.23
TTLL3-225ENST00000473661 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
TTLL3-225ENST00000473661 ADAMTS12P58397 1594 aa16.45■□□□□ 0.22
TTLL3-225ENST00000473661 APLP2Q06481 763 aa16.44■□□□□ 0.22
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