RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.58■■■□□ 2.65
SIRT1-201ENST00000212015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SIRT1-201ENST00000212015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.95■■■□□ 2.39
SIRT1-201ENST00000212015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.71■■■□□ 2.35
SIRT1-201ENST00000212015 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.28■■■□□ 2.28
SIRT1-201ENST00000212015 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.77■■■□□ 2.2
SIRT1-201ENST00000212015 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SIRT1-201ENST00000212015 HRCP23327 699 aa28.73■■■□□ 2.19
SIRT1-201ENST00000212015 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SIRT1-201ENST00000212015 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.2■■■□□ 2.1
SIRT1-201ENST00000212015 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.19■■■□□ 2.1
SIRT1-201ENST00000212015 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
SIRT1-201ENST00000212015 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SIRT1-201ENST00000212015 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM41Q8WV44 630 aa27.51■■□□□ 1.99
SIRT1-201ENST00000212015 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SIRT1-201ENST00000212015 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.43■■□□□ 1.98
SIRT1-201ENST00000212015 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SIRT1-201ENST00000212015 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
SIRT1-201ENST00000212015 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
SIRT1-201ENST00000212015 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SIRT1-201ENST00000212015 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.95■■□□□ 1.91
SIRT1-201ENST00000212015 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
SIRT1-201ENST00000212015 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
SIRT1-201ENST00000212015 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SIRT1-201ENST00000212015 NEUROD1Q13562 356 aa26.7■■□□□ 1.87
SIRT1-201ENST00000212015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.68■■□□□ 1.86
SIRT1-201ENST00000212015 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SIRT1-201ENST00000212015 MYT1Q01538 1121 aa26.56■■□□□ 1.84
SIRT1-201ENST00000212015 APLP2Q06481 763 aa26.53■■□□□ 1.84
SIRT1-201ENST00000212015 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SIRT1-201ENST00000212015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SIRT1-201ENST00000212015 ITGAEP38570 1179 aa26.03■■□□□ 1.76
SIRT1-201ENST00000212015 ABCC9O60706 1549 aa26.02■■□□□ 1.76
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.02■■□□□ 1.76
SIRT1-201ENST00000212015 BCANQ96GW7 911 aa26.01■■□□□ 1.75
SIRT1-201ENST00000212015 MIER1Q8N108 512 aa25.93■■□□□ 1.74
SIRT1-201ENST00000212015 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.79■■□□□ 1.72
SIRT1-201ENST00000212015 NEFLP07196 543 aa25.78■■□□□ 1.72
SIRT1-201ENST00000212015 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SIRT1-201ENST00000212015 SCRIBQ14160 1630 aa25.7■■□□□ 1.71
SIRT1-201ENST00000212015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
SIRT1-201ENST00000212015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SIRT1-201ENST00000212015 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.51■■□□□ 1.67
SIRT1-201ENST00000212015 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SIRT1-201ENST00000212015 FKBP8Q14318 412 aa25.37■■□□□ 1.65
SIRT1-201ENST00000212015 CEP162Q5TB80 1403 aa25.24■■□□□ 1.63
SIRT1-201ENST00000212015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.22■■□□□ 1.63
SIRT1-201ENST00000212015 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SIRT1-201ENST00000212015 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SIRT1-201ENST00000212015 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SIRT1-201ENST00000212015 TRIM52Q96A61 297 aa25.2■■□□□ 1.63
SIRT1-201ENST00000212015 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SIRT1-201ENST00000212015 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
SIRT1-201ENST00000212015 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.09■■□□□ 1.61
SIRT1-201ENST00000212015 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.06■■□□□ 1.6
SIRT1-201ENST00000212015 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SIRT1-201ENST00000212015 ANP32CO43423 234 aa25■■□□□ 1.59
SIRT1-201ENST00000212015 SOGA1O94964 1423 aa24.98■■□□□ 1.59
SIRT1-201ENST00000212015 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.94■■□□□ 1.58
SIRT1-201ENST00000212015 BCL11AQ9H165 835 aa24.93■■□□□ 1.58
SIRT1-201ENST00000212015 KCNH8Q96L42 1107 aa24.91■■□□□ 1.58
SIRT1-201ENST00000212015 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SIRT1-201ENST00000212015 P3H3Q8IVL6 736 aa24.89■■□□□ 1.57
SIRT1-201ENST00000212015 CLIP1P30622 1438 aa24.87■■□□□ 1.57
SIRT1-201ENST00000212015 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.86■■□□□ 1.57
SIRT1-201ENST00000212015 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.85■■□□□ 1.57
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.82■■□□□ 1.56
SIRT1-201ENST00000212015 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
SIRT1-201ENST00000212015 ABCC8Q09428 1581 aa24.8■■□□□ 1.56
SIRT1-201ENST00000212015 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.79■■□□□ 1.56
SIRT1-201ENST00000212015 NBR1Q14596 966 aa24.71■■□□□ 1.55
SIRT1-201ENST00000212015 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.7■■□□□ 1.54
SIRT1-201ENST00000212015 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.69■■□□□ 1.54
SIRT1-201ENST00000212015 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA3Q08378 1498 aa24.66■■□□□ 1.54
SIRT1-201ENST00000212015 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SIRT1-201ENST00000212015 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.62■■□□□ 1.53
SIRT1-201ENST00000212015 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.61■■□□□ 1.53
SIRT1-201ENST00000212015 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SIRT1-201ENST00000212015 NACADO15069 1562 aa24.56■■□□□ 1.52
SIRT1-201ENST00000212015 WIZO95785 1651 aa24.54■■□□□ 1.52
SIRT1-201ENST00000212015 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SIRT1-201ENST00000212015 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SIRT1-201ENST00000212015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
SIRT1-201ENST00000212015 ARID3CA6NKF2 412 aa24.46■■□□□ 1.51
SIRT1-201ENST00000212015 TONSLQ96HA7 1378 aa24.44■■□□□ 1.5
SIRT1-201ENST00000212015 EEA1Q15075 1411 aa24.43■■□□□ 1.5
SIRT1-201ENST00000212015 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.37■■□□□ 1.49
SIRT1-201ENST00000212015 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.35■■□□□ 1.49
SIRT1-201ENST00000212015 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.35■■□□□ 1.49
SIRT1-201ENST00000212015 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SIRT1-201ENST00000212015 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SIRT1-201ENST00000212015 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
SIRT1-201ENST00000212015 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.33■■□□□ 1.48
SIRT1-201ENST00000212015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SIRT1-201ENST00000212015 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SIRT1-201ENST00000212015 MRS2Q9HD23 443 aa24.3■■□□□ 1.48
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