Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNX4

WDR3, WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR3Q9UNX4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-206ENST00000441914 2418 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SCAPER-216ENST00000565970 2388 ntTSL 517.98■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LSS-209ENST00000484808 251 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 517.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 516.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SOCS7-204ENST00000617765 480 ntTSL 516.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-203ENST00000585512 562 ntTSL 416.76■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-207ENST00000587109 535 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-219ENST00000592323 550 ntTSL 416.45■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-220ENST00000592783 541 ntTSL 416.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 316.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-205ENST00000392483 581 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-209ENST00000587518 526 ntTSL 416.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-218ENST00000591740 585 ntTSL 415.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-212ENST00000588170 588 ntTSL 215.94■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C2-217ENST00000497706 1609 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 NTRK1-207ENST00000530298 3052 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-207ENST00000595185 760 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-211ENST00000588143 546 ntTSL 315.77■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-210ENST00000587958 560 ntTSL 215.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-208ENST00000587387 614 ntTSL 415.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 515.66■□□□□ 0.12e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EVI5-202ENST00000466778 321 ntTSL 315.52■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ACP2-213ENST00000534448 2170 ntTSL 515.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-204ENST00000409825 4739 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-209ENST00000484061 3085 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 215.04■□□□□ -02e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SCAPER-212ENST00000564590 2507 ntTSL 214.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 314.76□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RPGR-206ENST00000474584 2268 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-206ENST00000586782 843 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-210ENST00000552886 330 ntTSL 314.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)14.25□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 GRN-213ENST00000588237 558 ntTSL 513.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 SCAPER-215ENST00000565507 2627 ntTSL 513.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 APOPT1-205ENST00000474271 540 ntTSL 413.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.252e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EIF5A2-204ENST00000474417 457 ntTSL 313.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C2-208ENST00000452202 539 ntTSL 413.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MCM7-205ENST00000463722 1327 ntTSL 512.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TTC7A-211ENST00000491786 3615 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DCUN1D1-203ENST00000466812 461 ntTSL 212.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DPY19L3-201ENST00000342179 6015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 FIRRE-201ENST00000427391 2926 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RPGR-208ENST00000482855 2819 ntTSL 212.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 DPY19L3-211ENST00000592832 556 ntTSL 411.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 55.4
WDR3Q9UNX4 RPGR-203ENST00000378505 4767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 55.4
Retrieved 100 of 1,750 protein–RNA pairs in 22.7 ms