Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-219ENST00000534717 574 ntTSL 316.11■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-213ENST00000473074 943 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 514.64□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-8■■■■■ 27
APOBEC3CQ9NRW3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 26.8
APOBEC3CQ9NRW3 MRPS21-202ENST00000614145 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 26.8
APOBEC3CQ9NRW3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.558e-8■■■■■ 26.8
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.98e-8■■■■■ 26.8
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.752e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-208ENST00000495834 820 ntTSL 212.57□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-209ENST00000535434 1587 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-207ENST00000493987 839 ntTSL 311.62□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 221.7■■□□□ 1.061e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 216.77■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 26.7
APOBEC3CQ9NRW3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.043e-6■■■■□ 26.4
APOBEC3CQ9NRW3 PSME4-208ENST00000481518 886 ntTSL 525.2■■□□□ 1.621e-7■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 420.7■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO2-205ENST00000587655 914 ntTSL 317.55■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 SBNO2-209ENST00000590998 562 ntTSL 415.72■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.42e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 220.15■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)19.1■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 KRT19-205ENST00000471565 654 ntTSL 218.4■□□□□ 0.542e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 KRT19-207ENST00000593096 728 ntTSL 317.11■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 KRT19-204ENST00000468880 868 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 TPI1-205ENST00000482209 328 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPK-205ENST00000376281 2928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.612e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX4-204ENST00000439422 554 ntTSL 33.28□□□□□ -1.882e-6■■■■□ 25.9
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01237-205ENST00000457686 586 ntTSL 416.47■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 415.13■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.25e-14■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.225e-14■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.235e-14■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 PPP1R8-205ENST00000486634 459 ntTSL 36.22□□□□□ -1.415e-14■■■■□ 25.5
APOBEC3CQ9NRW3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.299e-16■■■■□ 25.3
APOBEC3CQ9NRW3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.429e-16■■■■□ 25.3
APOBEC3CQ9NRW3 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 218.63■□□□□ 0.579e-16■■■■□ 25.3
APOBEC3CQ9NRW3 AES-209ENST00000587393 1082 ntTSL 217.06■□□□□ 0.329e-16■■■■□ 25.3
APOBEC3CQ9NRW3 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 52.49□□□□□ -2.019e-16■■■■□ 25.3
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 56.38□□□□□ -1.395e-16■■■■□ 25.2
APOBEC3CQ9NRW3 PABPC1-206ENST00000518293 608 ntTSL 33.27□□□□□ -1.895e-16■■■■□ 25.2
APOBEC3CQ9NRW3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.134e-6■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.164e-6■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 LAMP2-204ENST00000486593 1069 ntTSL 58.92□□□□□ -0.984e-6■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.284e-6■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 422.37■■□□□ 1.173e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-204ENST00000424608 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.79■■□□□ 1.083e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.033e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-207ENST00000452087 864 ntTSL 320.64■□□□□ 0.893e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 219.85■□□□□ 0.773e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.63e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 417.65■□□□□ 0.423e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 416.82■□□□□ 0.283e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-211ENST00000485798 938 ntTSL 316.5■□□□□ 0.233e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-218ENST00000515752 1809 ntTSL 515.46■□□□□ 0.073e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-208ENST00000507522 644 ntTSL 513.28□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 213.26□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 513.22□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-211ENST00000509564 630 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 313.22□□□□□ -0.293e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-203ENST00000503674 2426 ntTSL 213.07□□□□□ -0.323e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-216ENST00000514027 2209 ntTSL 212.15□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 210.02□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.93e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 NUDCD3-209ENST00000487118 314 ntTSL 38.93□□□□□ -0.983e-7■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.188e-11■■■■□ 25
APOBEC3CQ9NRW3 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.548e-11■■■■□ 25
Retrieved 100 of 4,302 protein–RNA pairs in 188.6 ms