RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540647.5

ULK1-204, Transcript of unc-51 like autophagy activating kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ULK1, Length 1,211 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1-204ENST00000540647 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.73■■■■■ 5.39
ULK1-204ENST00000540647 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.47■■■■■ 4.55
ULK1-204ENST00000540647 ABCC9O60706 1549 aa43.41■■■■■ 4.54
ULK1-204ENST00000540647 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.36■■■■■ 4.21
ULK1-204ENST00000540647 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.28■■■■■ 4.2
ULK1-204ENST00000540647 NACADO15069 1562 aa41.14■■■■■ 4.18
ULK1-204ENST00000540647 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.64■■■■■ 4.1
ULK1-204ENST00000540647 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
ULK1-204ENST00000540647 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.57■■■■■ 4.09
ULK1-204ENST00000540647 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
ULK1-204ENST00000540647 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.26■■■■■ 4.04
ULK1-204ENST00000540647 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.21■■■■■ 4.03
ULK1-204ENST00000540647 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.11■■■■■ 4.01
ULK1-204ENST00000540647 SCRIBQ14160 1630 aa39.73■■■■□ 3.95
ULK1-204ENST00000540647 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.58■■■■□ 3.93
ULK1-204ENST00000540647 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.14■■■■□ 3.86
ULK1-204ENST00000540647 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
ULK1-204ENST00000540647 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.07■■■■□ 3.85
ULK1-204ENST00000540647 NCAPD3P42695 1498 aa38.03■■■■□ 3.68
ULK1-204ENST00000540647 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.96■■■■□ 3.67
ULK1-204ENST00000540647 SMARCA4P51532 1647 aa37.9■■■■□ 3.66
ULK1-204ENST00000540647 SMARCA2P51531 1590 aa37.81■■■■□ 3.64
ULK1-204ENST00000540647 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
ULK1-204ENST00000540647 HMGXB3Q12766 1538 aa37.68■■■■□ 3.62
ULK1-204ENST00000540647 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.59■■■■□ 3.61
ULK1-204ENST00000540647 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.55■■■■□ 3.6
ULK1-204ENST00000540647 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.51■■■■□ 3.59
ULK1-204ENST00000540647 ERCC6Q03468 1493 aa37.47■■■■□ 3.59
ULK1-204ENST00000540647 NESP48681 1621 aa37.35■■■■□ 3.57
ULK1-204ENST00000540647 CUX2O14529 1486 aa37.26■■■■□ 3.55
ULK1-204ENST00000540647 WIZO95785 1651 aa37.08■■■■□ 3.53
ULK1-204ENST00000540647 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.07■■■■□ 3.52
ULK1-204ENST00000540647 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.06■■■■□ 3.52
ULK1-204ENST00000540647 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.95■■■■□ 3.51
ULK1-204ENST00000540647 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.93■■■■□ 3.5
ULK1-204ENST00000540647 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
ULK1-204ENST00000540647 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
ULK1-204ENST00000540647 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.74■■■■□ 3.47
ULK1-204ENST00000540647 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
ULK1-204ENST00000540647 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.56■■■■□ 3.44
ULK1-204ENST00000540647 CFTRP13569 1480 aa36.51■■■■□ 3.44
ULK1-204ENST00000540647 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.48■■■■□ 3.43
ULK1-204ENST00000540647 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.47■■■■□ 3.43
ULK1-204ENST00000540647 WDR62O43379 1518 aa36.4■■■■□ 3.42
ULK1-204ENST00000540647 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.3■■■■□ 3.4
ULK1-204ENST00000540647 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
ULK1-204ENST00000540647 PRDM2Q13029 1718 aa35.94■■■■□ 3.34
ULK1-204ENST00000540647 TOPBP1Q92547 1522 aa35.78■■■■□ 3.32
ULK1-204ENST00000540647 OSCARQ8IYS5 282 aa35.76■■■■□ 3.32
ULK1-204ENST00000540647 ABCC8Q09428 1581 aa35.76■■■■□ 3.31
ULK1-204ENST00000540647 IFT140Q96RY7 1462 aa35.74■■■■□ 3.31
ULK1-204ENST00000540647 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
ULK1-204ENST00000540647 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
ULK1-204ENST00000540647 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.64■■■■□ 3.3
ULK1-204ENST00000540647 TRIM41Q8WV44 630 aa35.6■■■■□ 3.29
ULK1-204ENST00000540647 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
ULK1-204ENST00000540647 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.42■■■■□ 3.262e-8■■■■□ 21.3
ULK1-204ENST00000540647 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
ULK1-204ENST00000540647 SOGA1O94964 1423 aa35.38■■■■□ 3.25
ULK1-204ENST00000540647 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
ULK1-204ENST00000540647 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.35■■■■□ 3.25
ULK1-204ENST00000540647 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
ULK1-204ENST00000540647 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.27■■■■□ 3.24
ULK1-204ENST00000540647 CUX1P39880 1505 aa35.26■■■■□ 3.23
ULK1-204ENST00000540647 FBLN2P98095 1184 aa35.25■■■■□ 3.23
ULK1-204ENST00000540647 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.06■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.06■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.06■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 CHD1O14646 1710 aa35.03■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 ARHGEF11O15085 1522 aa35.02■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 WDR97A6NE52 1622 aa35.02■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.02■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
ULK1-204ENST00000540647 GRIN2BQ13224 1484 aa34.98■■■■□ 3.19
ULK1-204ENST00000540647 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.93■■■■□ 3.18
ULK1-204ENST00000540647 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
ULK1-204ENST00000540647 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.9■■■■□ 3.18
ULK1-204ENST00000540647 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.86■■■■□ 3.17
ULK1-204ENST00000540647 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.85■■■■□ 3.17
ULK1-204ENST00000540647 SYNJ2O15056 1496 aa34.82■■■■□ 3.16
ULK1-204ENST00000540647 SYNJ1O43426 1573 aa34.73■■■■□ 3.15
ULK1-204ENST00000540647 TOP2BQ02880 1626 aa34.73■■■■□ 3.15
ULK1-204ENST00000540647 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.71■■■■□ 3.15
ULK1-204ENST00000540647 PBRM1Q86U86 1689 aa34.7■■■■□ 3.15
ULK1-204ENST00000540647 ARAP1Q96P48 1450 aa34.7■■■■□ 3.15
ULK1-204ENST00000540647 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.7■■■■□ 3.14
ULK1-204ENST00000540647 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.68■■■■□ 3.14
ULK1-204ENST00000540647 GRIN2AQ12879 1464 aa34.51■■■■□ 3.11
ULK1-204ENST00000540647 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.47■■■■□ 3.11
ULK1-204ENST00000540647 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ULK1-204ENST00000540647 ADAMTS12P58397 1594 aa34.45■■■■□ 3.1
ULK1-204ENST00000540647 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.42■■■■□ 3.1
ULK1-204ENST00000540647 NUP160Q12769 1436 aa34.38■■■■□ 3.09
ULK1-204ENST00000540647 CEP170Q5SW79 1584 aa34.32■■■■□ 3.09
ULK1-204ENST00000540647 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.21■■■■□ 3.07
ULK1-204ENST00000540647 KIF27Q86VH2 1401 aa34.17■■■■□ 3.06
ULK1-204ENST00000540647 JPH4Q96JJ6 628 aa34.17■■■■□ 3.06
ULK1-204ENST00000540647 IGF1RP08069 1367 aa34.16■■■■□ 3.06
ULK1-204ENST00000540647 SHROOM2Q13796 1616 aa34.1■■■■□ 3.05
ULK1-204ENST00000540647 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms