RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591871.1

TIMM13-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 13, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM13, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM13-202ENST00000591871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.84■■■■□ 3.97
TIMM13-202ENST00000591871 ABCC9O60706 1549 aa36.74■■■■□ 3.47
TIMM13-202ENST00000591871 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.93■■■■□ 3.34
TIMM13-202ENST00000591871 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.13■■■■□ 3.21
TIMM13-202ENST00000591871 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.62■■■■□ 3.13
TIMM13-202ENST00000591871 NACADO15069 1562 aa34.23■■■■□ 3.07
TIMM13-202ENST00000591871 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
TIMM13-202ENST00000591871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.06■■■■□ 3.04
TIMM13-202ENST00000591871 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.67■■■□□ 2.98
TIMM13-202ENST00000591871 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.61■■■□□ 2.97
TIMM13-202ENST00000591871 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.53■■■□□ 2.96
TIMM13-202ENST00000591871 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM13-202ENST00000591871 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.12■■■□□ 2.89
TIMM13-202ENST00000591871 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.09■■■□□ 2.89
TIMM13-202ENST00000591871 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
TIMM13-202ENST00000591871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
TIMM13-202ENST00000591871 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.84■■■□□ 2.85
TIMM13-202ENST00000591871 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.78■■■□□ 2.84
TIMM13-202ENST00000591871 SCRIBQ14160 1630 aa32.76■■■□□ 2.83
TIMM13-202ENST00000591871 CUX2O14529 1486 aa31.93■■■□□ 2.7
TIMM13-202ENST00000591871 ERCC6Q03468 1493 aa31.79■■■□□ 2.68
TIMM13-202ENST00000591871 NCAPD3P42695 1498 aa31.65■■■□□ 2.66
TIMM13-202ENST00000591871 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.45■■■□□ 2.62
TIMM13-202ENST00000591871 NESP48681 1621 aa31.35■■■□□ 2.61
TIMM13-202ENST00000591871 SMARCA2P51531 1590 aa31.3■■■□□ 2.6
TIMM13-202ENST00000591871 HMGXB3Q12766 1538 aa31.29■■■□□ 2.6
TIMM13-202ENST00000591871 SMARCA4P51532 1647 aa31.16■■■□□ 2.58
TIMM13-202ENST00000591871 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
TIMM13-202ENST00000591871 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
TIMM13-202ENST00000591871 TRIM41Q8WV44 630 aa31.07■■■□□ 2.56
TIMM13-202ENST00000591871 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.98■■■□□ 2.55
TIMM13-202ENST00000591871 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.54
TIMM13-202ENST00000591871 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.91■■■□□ 2.54
TIMM13-202ENST00000591871 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.88■■■□□ 2.53
TIMM13-202ENST00000591871 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.81■■■□□ 2.52
TIMM13-202ENST00000591871 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.68■■■□□ 2.5
TIMM13-202ENST00000591871 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.68■■■□□ 2.5
TIMM13-202ENST00000591871 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.65■■■□□ 2.5
TIMM13-202ENST00000591871 WDR62O43379 1518 aa30.56■■■□□ 2.48
TIMM13-202ENST00000591871 OSCARQ8IYS5 282 aa30.46■■■□□ 2.47
TIMM13-202ENST00000591871 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.38■■■□□ 2.45
TIMM13-202ENST00000591871 WIZO95785 1651 aa30.31■■■□□ 2.44
TIMM13-202ENST00000591871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.31■■■□□ 2.44
TIMM13-202ENST00000591871 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
TIMM13-202ENST00000591871 CFTRP13569 1480 aa30.16■■■□□ 2.42
TIMM13-202ENST00000591871 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
TIMM13-202ENST00000591871 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.98■■■□□ 2.39
TIMM13-202ENST00000591871 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.98■■■□□ 2.39
TIMM13-202ENST00000591871 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.98■■■□□ 2.39
TIMM13-202ENST00000591871 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
TIMM13-202ENST00000591871 ARHGEF11O15085 1522 aa29.87■■■□□ 2.37
TIMM13-202ENST00000591871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
TIMM13-202ENST00000591871 IFT140Q96RY7 1462 aa29.82■■■□□ 2.36
TIMM13-202ENST00000591871 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.8■■■□□ 2.36
TIMM13-202ENST00000591871 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
TIMM13-202ENST00000591871 TOPBP1Q92547 1522 aa29.64■■■□□ 2.34
TIMM13-202ENST00000591871 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.61■■■□□ 2.33
TIMM13-202ENST00000591871 PRDM2Q13029 1718 aa29.58■■■□□ 2.33
TIMM13-202ENST00000591871 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
TIMM13-202ENST00000591871 ABCC8Q09428 1581 aa29.54■■■□□ 2.32
TIMM13-202ENST00000591871 ARAP1Q96P48 1450 aa29.54■■■□□ 2.32
TIMM13-202ENST00000591871 FBLN2P98095 1184 aa29.52■■■□□ 2.32
TIMM13-202ENST00000591871 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
TIMM13-202ENST00000591871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.43■■■□□ 2.3
TIMM13-202ENST00000591871 CHD1O14646 1710 aa29.41■■■□□ 2.3
TIMM13-202ENST00000591871 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
TIMM13-202ENST00000591871 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
TIMM13-202ENST00000591871 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
TIMM13-202ENST00000591871 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TIMM13-202ENST00000591871 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TIMM13-202ENST00000591871 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.22■■■□□ 2.27
TIMM13-202ENST00000591871 SOGA1O94964 1423 aa29.2■■■□□ 2.26
TIMM13-202ENST00000591871 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TIMM13-202ENST00000591871 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.16■■■□□ 2.26
TIMM13-202ENST00000591871 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.14■■■□□ 2.25
TIMM13-202ENST00000591871 SYNJ1O43426 1573 aa29.08■■■□□ 2.25
TIMM13-202ENST00000591871 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
TIMM13-202ENST00000591871 WDR97A6NE52 1622 aa29.02■■■□□ 2.24
TIMM13-202ENST00000591871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.01■■■□□ 2.23
TIMM13-202ENST00000591871 GRIN2BQ13224 1484 aa28.99■■■□□ 2.23
TIMM13-202ENST00000591871 SYNJ2O15056 1496 aa28.97■■■□□ 2.23
TIMM13-202ENST00000591871 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.94■■■□□ 2.22
TIMM13-202ENST00000591871 CUX1P39880 1505 aa28.86■■■□□ 2.21
TIMM13-202ENST00000591871 PBRM1Q86U86 1689 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMM13-202ENST00000591871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.64■■■□□ 2.18
TIMM13-202ENST00000591871 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.64■■■□□ 2.18
TIMM13-202ENST00000591871 GRIN2AQ12879 1464 aa28.6■■■□□ 2.17
TIMM13-202ENST00000591871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.59■■■□□ 2.17
TIMM13-202ENST00000591871 CEP170Q5SW79 1584 aa28.55■■■□□ 2.16
TIMM13-202ENST00000591871 NUP160Q12769 1436 aa28.54■■■□□ 2.16
TIMM13-202ENST00000591871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
TIMM13-202ENST00000591871 ADAMTS12P58397 1594 aa28.44■■■□□ 2.14
TIMM13-202ENST00000591871 TOP2BQ02880 1626 aa28.43■■■□□ 2.14
TIMM13-202ENST00000591871 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM13-202ENST00000591871 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.42■■■□□ 2.14
TIMM13-202ENST00000591871 SHROOM2Q13796 1616 aa28.41■■■□□ 2.14
TIMM13-202ENST00000591871 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TIMM13-202ENST00000591871 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.35■■■□□ 2.13
TIMM13-202ENST00000591871 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.35■■■□□ 2.13
TIMM13-202ENST00000591871 JPH4Q96JJ6 628 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms