Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCND1P24385 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCND1P24385 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND1P24385 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCND1P24385 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND1P24385 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCND1P24385 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND1P24385 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCND1P24385 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCND1P24385 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCND1P24385 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND1P24385 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCND1P24385 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND1P24385 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCND1P24385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND1P24385 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCND1P24385 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCND1P24385 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND1P24385 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND1P24385 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND1P24385 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCND1P24385 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND1P24385 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND1P24385 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCND1P24385 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCND1P24385 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCND1P24385 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND1P24385 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND1P24385 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND1P24385 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND1P24385 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCND1P24385 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND1P24385 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND1P24385 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND1P24385 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCND1P24385 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND1P24385 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND1P24385 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCND1P24385 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND1P24385 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND1P24385 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCND1P24385 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND1P24385 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND1P24385 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND1P24385 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCND1P24385 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCND1P24385 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND1P24385 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCND1P24385 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND1P24385 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND1P24385 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCND1P24385 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCND1P24385 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND1P24385 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND1P24385 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND1P24385 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND1P24385 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND1P24385 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND1P24385 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND1P24385 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND1P24385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND1P24385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND1P24385 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCND1P24385 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND1P24385 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND1P24385 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCND1P24385 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCND1P24385 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCND1P24385 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCND1P24385 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCND1P24385 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND1P24385 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND1P24385 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND1P24385 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCND1P24385 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCND1P24385 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCND1P24385 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCND1P24385 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND1P24385 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND1P24385 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND1P24385 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND1P24385 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCND1P24385 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCND1P24385 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND1P24385 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND1P24385 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCND1P24385 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND1P24385 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCND1P24385 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND1P24385 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND1P24385 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND1P24385 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCND1P24385 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCND1P24385 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms