RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409990.7

WDSUB1-205, Transcript of WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene WDSUB1, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDSUB1-205ENST00000409990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.59■■■■■ 6.65
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WDSUB1-205ENST00000409990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.03■■■■■ 5.12
WDSUB1-205ENST00000409990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.73■■■■■ 5.07
WDSUB1-205ENST00000409990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.49■■■■■ 5.03
WDSUB1-205ENST00000409990 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
WDSUB1-205ENST00000409990 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.76■■■■■ 4.92
WDSUB1-205ENST00000409990 ABCC9O60706 1549 aa45.26■■■■■ 4.84
WDSUB1-205ENST00000409990 NACADO15069 1562 aa45.16■■■■■ 4.82
WDSUB1-205ENST00000409990 SCRIBQ14160 1630 aa45.06■■■■■ 4.8
WDSUB1-205ENST00000409990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.51■■■■■ 4.72
WDSUB1-205ENST00000409990 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.42■■■■■ 4.7
WDSUB1-205ENST00000409990 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.38■■■■■ 4.7
WDSUB1-205ENST00000409990 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.97■■■■■ 4.63
WDSUB1-205ENST00000409990 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.81■■■■■ 4.6
WDSUB1-205ENST00000409990 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.66■■■■■ 4.58
WDSUB1-205ENST00000409990 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
WDSUB1-205ENST00000409990 WIZO95785 1651 aa43.47■■■■■ 4.55
WDSUB1-205ENST00000409990 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.25■■■■■ 4.51
WDSUB1-205ENST00000409990 SMARCA4P51532 1647 aa43.24■■■■■ 4.51
WDSUB1-205ENST00000409990 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
WDSUB1-205ENST00000409990 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.99■■■■■ 4.47
WDSUB1-205ENST00000409990 TRIM41Q8WV44 630 aa42.93■■■■■ 4.46
WDSUB1-205ENST00000409990 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.82■■■■■ 4.45
WDSUB1-205ENST00000409990 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
WDSUB1-205ENST00000409990 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.67■■■■■ 4.42
WDSUB1-205ENST00000409990 SMARCA2P51531 1590 aa42.67■■■■■ 4.42
WDSUB1-205ENST00000409990 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.66■■■■■ 4.42
WDSUB1-205ENST00000409990 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.32■■■■■ 4.36
WDSUB1-205ENST00000409990 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
WDSUB1-205ENST00000409990 ABCC8Q09428 1581 aa42.11■■■■■ 4.33
WDSUB1-205ENST00000409990 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
WDSUB1-205ENST00000409990 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.96■■■■■ 4.31
WDSUB1-205ENST00000409990 NCAPD3P42695 1498 aa41.75■■■■■ 4.27
WDSUB1-205ENST00000409990 HMGXB3Q12766 1538 aa41.72■■■■■ 4.27
WDSUB1-205ENST00000409990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.26
WDSUB1-205ENST00000409990 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
WDSUB1-205ENST00000409990 HRCP23327 699 aa41.63■■■■■ 4.26
WDSUB1-205ENST00000409990 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.63■■■■■ 4.26
WDSUB1-205ENST00000409990 EEA1Q15075 1411 aa41.62■■■■■ 4.25
WDSUB1-205ENST00000409990 SOGA1O94964 1423 aa41.6■■■■■ 4.25
WDSUB1-205ENST00000409990 SYNJ1O43426 1573 aa41.48■■■■■ 4.23
WDSUB1-205ENST00000409990 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.39■■■■■ 4.22
WDSUB1-205ENST00000409990 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.39■■■■■ 4.22
WDSUB1-205ENST00000409990 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.25■■■■■ 4.19
WDSUB1-205ENST00000409990 TOP2BQ02880 1626 aa41.19■■■■■ 4.18
WDSUB1-205ENST00000409990 CFTRP13569 1480 aa41.14■■■■■ 4.18
WDSUB1-205ENST00000409990 GOLGA3Q08378 1498 aa41.12■■■■■ 4.17
WDSUB1-205ENST00000409990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.1■■■■■ 4.17
WDSUB1-205ENST00000409990 CEP162Q5TB80 1403 aa41.1■■■■■ 4.17
WDSUB1-205ENST00000409990 KIF21BO75037 1637 aa41.01■■■■■ 4.16
WDSUB1-205ENST00000409990 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.01■■■■■ 4.16
WDSUB1-205ENST00000409990 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
WDSUB1-205ENST00000409990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.94■■■■■ 4.14
WDSUB1-205ENST00000409990 CUX1P39880 1505 aa40.87■■■■■ 4.13
WDSUB1-205ENST00000409990 PRDM2Q13029 1718 aa40.82■■■■■ 4.12
WDSUB1-205ENST00000409990 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.78■■■■■ 4.12
WDSUB1-205ENST00000409990 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
WDSUB1-205ENST00000409990 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.67■■■■■ 4.1
WDSUB1-205ENST00000409990 PRXQ9BXM0 1461 aa40.56■■■■■ 4.08
WDSUB1-205ENST00000409990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.54■■■■■ 4.08
WDSUB1-205ENST00000409990 CLIP1P30622 1438 aa40.53■■■■■ 4.08
WDSUB1-205ENST00000409990 KIF27Q86VH2 1401 aa40.52■■■■■ 4.08
WDSUB1-205ENST00000409990 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
WDSUB1-205ENST00000409990 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.32■■■■■ 4.05
WDSUB1-205ENST00000409990 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.32■■■■■ 4.04
WDSUB1-205ENST00000409990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.24■■■■■ 4.03
WDSUB1-205ENST00000409990 CUX2O14529 1486 aa40.2■■■■■ 4.03
WDSUB1-205ENST00000409990 IGF1RP08069 1367 aa40.14■■■■■ 4.02
WDSUB1-205ENST00000409990 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
WDSUB1-205ENST00000409990 NESP48681 1621 aa40.11■■■■■ 4.01
WDSUB1-205ENST00000409990 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.11■■■■■ 4.01
WDSUB1-205ENST00000409990 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.08■■■■■ 4.01
WDSUB1-205ENST00000409990 ARAP1Q96P48 1450 aa40.01■■■■■ 4
WDSUB1-205ENST00000409990 TOPBP1Q92547 1522 aa40■■■■□ 3.99
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WDSUB1-205ENST00000409990 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.92■■■■□ 3.98
WDSUB1-205ENST00000409990 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.9■■■■□ 3.98
WDSUB1-205ENST00000409990 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
WDSUB1-205ENST00000409990 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
WDSUB1-205ENST00000409990 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.83■■■■□ 3.97
WDSUB1-205ENST00000409990 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.81■■■■□ 3.96
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WDSUB1-205ENST00000409990 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.78■■■■□ 3.96
WDSUB1-205ENST00000409990 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
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WDSUB1-205ENST00000409990 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.52■■■■□ 3.92
WDSUB1-205ENST00000409990 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
WDSUB1-205ENST00000409990 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.45■■■■□ 3.91
WDSUB1-205ENST00000409990 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP39.44■■■■□ 3.9
WDSUB1-205ENST00000409990 MAP3K1Q13233 1512 aa39.41■■■■□ 3.9
WDSUB1-205ENST00000409990 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.36■■■■□ 3.89
WDSUB1-205ENST00000409990 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
WDSUB1-205ENST00000409990 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.89
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WDSUB1-205ENST00000409990 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
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