RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507785.2

MSX2-202, Transcript of msh homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSX2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX2-202ENST00000507785 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.14■■■■■ 8.5
MSX2-202ENST00000507785 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.6■■■■■ 7.29
MSX2-202ENST00000507785 ABCC9O60706 1549 aa59.22■■■■■ 7.07
MSX2-202ENST00000507785 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.99■■■■■ 6.71
MSX2-202ENST00000507785 NACADO15069 1562 aa56.95■■■■■ 6.71
MSX2-202ENST00000507785 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.78■■■■■ 6.68
MSX2-202ENST00000507785 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.76■■■■■ 6.68
MSX2-202ENST00000507785 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.64■■■■■ 6.66
MSX2-202ENST00000507785 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.41■■■■■ 6.62
MSX2-202ENST00000507785 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.81■■■■■ 6.53
MSX2-202ENST00000507785 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.34■■■■■ 6.45
MSX2-202ENST00000507785 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.31■■■■■ 6.44
MSX2-202ENST00000507785 SCRIBQ14160 1630 aa55.25■■■■■ 6.44
MSX2-202ENST00000507785 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.71■■■■■ 6.35
MSX2-202ENST00000507785 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.38■■■■■ 6.3
MSX2-202ENST00000507785 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.83■■■■■ 6.21
MSX2-202ENST00000507785 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.61■■■■■ 6.17
MSX2-202ENST00000507785 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.2■■■■■ 6.11
MSX2-202ENST00000507785 SMARCA4P51532 1647 aa52.88■■■■■ 6.06
MSX2-202ENST00000507785 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.8■■■■■ 6.04
MSX2-202ENST00000507785 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.58■■■■■ 6.01
MSX2-202ENST00000507785 NCAPD3P42695 1498 aa52.55■■■■■ 6
MSX2-202ENST00000507785 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.52■■■■■ 6
MSX2-202ENST00000507785 SMARCA2P51531 1590 aa52.5■■■■■ 5.99
MSX2-202ENST00000507785 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.4■■■■■ 5.98
MSX2-202ENST00000507785 HMGXB3Q12766 1538 aa52.3■■■■■ 5.96
MSX2-202ENST00000507785 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.11■■■■■ 5.93
MSX2-202ENST00000507785 WIZO95785 1651 aa51.97■■■■■ 5.91
MSX2-202ENST00000507785 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
MSX2-202ENST00000507785 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.4■■■■■ 5.82
MSX2-202ENST00000507785 NESP48681 1621 aa51.28■■■■■ 5.8
MSX2-202ENST00000507785 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.15■■■■■ 5.78
MSX2-202ENST00000507785 ERCC6Q03468 1493 aa50.99■■■■■ 5.75
MSX2-202ENST00000507785 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.99■■■■■ 5.75
MSX2-202ENST00000507785 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.79■■■■■ 5.72
MSX2-202ENST00000507785 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.77■■■■■ 5.72
MSX2-202ENST00000507785 CFTRP13569 1480 aa50.71■■■■■ 5.71
MSX2-202ENST00000507785 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.7■■■■■ 5.71
MSX2-202ENST00000507785 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.54■■■■■ 5.68
MSX2-202ENST00000507785 CUX2O14529 1486 aa50.51■■■■■ 5.68
MSX2-202ENST00000507785 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.5■■■■■ 5.67
MSX2-202ENST00000507785 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.41■■■■■ 5.66
MSX2-202ENST00000507785 PRDM2Q13029 1718 aa50.4■■■■■ 5.66
MSX2-202ENST00000507785 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.33■■■■■ 5.65
MSX2-202ENST00000507785 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.27■■■■■ 5.64
MSX2-202ENST00000507785 WDR62O43379 1518 aa50.14■■■■■ 5.62
MSX2-202ENST00000507785 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.94■■■■■ 5.58
MSX2-202ENST00000507785 TOPBP1Q92547 1522 aa49.63■■■■■ 5.54
MSX2-202ENST00000507785 ABCC8Q09428 1581 aa49.59■■■■■ 5.53
MSX2-202ENST00000507785 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.57■■■■■ 5.53
MSX2-202ENST00000507785 IFT140Q96RY7 1462 aa49.29■■■■■ 5.48
MSX2-202ENST00000507785 CUX1P39880 1505 aa49.28■■■■■ 5.48
MSX2-202ENST00000507785 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.2■■■■■ 5.47
MSX2-202ENST00000507785 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
MSX2-202ENST00000507785 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.09■■■■■ 5.45
MSX2-202ENST00000507785 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.07■■■■■ 5.45
MSX2-202ENST00000507785 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.99■■■■■ 5.43
MSX2-202ENST00000507785 SOGA1O94964 1423 aa48.97■■■■■ 5.43
MSX2-202ENST00000507785 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.93■■■■■ 5.42
MSX2-202ENST00000507785 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.92■■■■■ 5.42
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MSX2-202ENST00000507785 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.87■■■■■ 5.41
MSX2-202ENST00000507785 TOP2BQ02880 1626 aa48.86■■■■■ 5.41
MSX2-202ENST00000507785 SYNJ1O43426 1573 aa48.85■■■■■ 5.41
MSX2-202ENST00000507785 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.79■■■■■ 5.4
MSX2-202ENST00000507785 WDR97A6NE52 1622 aa48.74■■■■■ 5.39
MSX2-202ENST00000507785 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
MSX2-202ENST00000507785 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.62■■■■■ 5.37
MSX2-202ENST00000507785 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.46■■■■■ 5.35
MSX2-202ENST00000507785 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.42■■■■■ 5.34
MSX2-202ENST00000507785 GRIN2BQ13224 1484 aa48.41■■■■■ 5.34
MSX2-202ENST00000507785 PBRM1Q86U86 1689 aa48.37■■■■■ 5.33
MSX2-202ENST00000507785 OSCARQ8IYS5 282 aa48.35■■■■■ 5.33
MSX2-202ENST00000507785 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.35■■■■■ 5.33
MSX2-202ENST00000507785 CHD1O14646 1710 aa48.3■■■■■ 5.32
MSX2-202ENST00000507785 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
MSX2-202ENST00000507785 FBLN2P98095 1184 aa48.1■■■■■ 5.29
MSX2-202ENST00000507785 SYNJ2O15056 1496 aa48.1■■■■■ 5.29
MSX2-202ENST00000507785 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
MSX2-202ENST00000507785 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48■■■■■ 5.27
MSX2-202ENST00000507785 ADAMTS12P58397 1594 aa47.97■■■■■ 5.27
MSX2-202ENST00000507785 KIF27Q86VH2 1401 aa47.88■■■■■ 5.25
MSX2-202ENST00000507785 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.85■■■■■ 5.25
MSX2-202ENST00000507785 GRIN2AQ12879 1464 aa47.79■■■■■ 5.24
MSX2-202ENST00000507785 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.79■■■■■ 5.24
MSX2-202ENST00000507785 IGF1RP08069 1367 aa47.73■■■■■ 5.23
MSX2-202ENST00000507785 TRIM41Q8WV44 630 aa47.7■■■■■ 5.23
MSX2-202ENST00000507785 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.67■■■■■ 5.22
MSX2-202ENST00000507785 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.67■■■■■ 5.22
MSX2-202ENST00000507785 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.67■■■■■ 5.22
MSX2-202ENST00000507785 ARHGEF11O15085 1522 aa47.65■■■■■ 5.22
MSX2-202ENST00000507785 NUP160Q12769 1436 aa47.61■■■■■ 5.21
MSX2-202ENST00000507785 CUL7Q14999 1698 aa47.61■■■■■ 5.21
MSX2-202ENST00000507785 CEP170Q5SW79 1584 aa47.59■■■■■ 5.21
MSX2-202ENST00000507785 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.51■■■■■ 5.2
MSX2-202ENST00000507785 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.4■■■■■ 5.18
MSX2-202ENST00000507785 ARAP1Q96P48 1450 aa47.28■■■■■ 5.16
MSX2-202ENST00000507785 SHROOM2Q13796 1616 aa47.27■■■■■ 5.16
MSX2-202ENST00000507785 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.2■■■■■ 5.15
MSX2-202ENST00000507785 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.14■■■■■ 5.14
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