RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541586.5

CCM2-218, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCM2, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-218ENST00000541586 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.82■■■■■ 7.97
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CCM2-218ENST00000541586 ABCC9O60706 1549 aa55.46■■■■■ 6.47
CCM2-218ENST00000541586 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.3■■■■■ 6.28
CCM2-218ENST00000541586 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.12■■■■■ 6.25
CCM2-218ENST00000541586 NACADO15069 1562 aa53.6■■■■■ 6.17
CCM2-218ENST00000541586 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.52■■■■■ 6.16
CCM2-218ENST00000541586 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.5■■■■■ 6.15
CCM2-218ENST00000541586 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.42■■■■■ 6.14
CCM2-218ENST00000541586 SCRIBQ14160 1630 aa52.41■■■■■ 5.98
CCM2-218ENST00000541586 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.27■■■■■ 5.96
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CCM2-218ENST00000541586 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.03■■■■■ 5.92
CCM2-218ENST00000541586 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.85■■■■■ 5.89
CCM2-218ENST00000541586 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.52■■■■■ 5.68
CCM2-218ENST00000541586 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.45■■■■■ 5.67
CCM2-218ENST00000541586 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.27■■■■■ 5.64
CCM2-218ENST00000541586 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.16■■■■■ 5.62
CCM2-218ENST00000541586 SMARCA4P51532 1647 aa50.1■■■■■ 5.61
CCM2-218ENST00000541586 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.08■■■■■ 5.61
CCM2-218ENST00000541586 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.03■■■■■ 5.6
CCM2-218ENST00000541586 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.76■■■■■ 5.56
CCM2-218ENST00000541586 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.69■■■■■ 5.54
CCM2-218ENST00000541586 SMARCA2P51531 1590 aa49.6■■■■■ 5.53
CCM2-218ENST00000541586 WIZO95785 1651 aa49.54■■■■■ 5.52
CCM2-218ENST00000541586 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.5■■■■■ 5.51
CCM2-218ENST00000541586 NCAPD3P42695 1498 aa49.49■■■■■ 5.51
CCM2-218ENST00000541586 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
CCM2-218ENST00000541586 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.35■■■■■ 5.49
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CCM2-218ENST00000541586 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.96■■■■■ 5.43
CCM2-218ENST00000541586 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.51■■■■■ 5.36
CCM2-218ENST00000541586 NESP48681 1621 aa48.21■■■■■ 5.31
CCM2-218ENST00000541586 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.18■■■■■ 5.3
CCM2-218ENST00000541586 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.03■■■■■ 5.28
CCM2-218ENST00000541586 CFTRP13569 1480 aa48■■■■■ 5.27
CCM2-218ENST00000541586 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.79■■■■■ 5.24
CCM2-218ENST00000541586 ERCC6Q03468 1493 aa47.73■■■■■ 5.23
CCM2-218ENST00000541586 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.62■■■■■ 5.21
CCM2-218ENST00000541586 PRDM2Q13029 1718 aa47.55■■■■■ 5.2
CCM2-218ENST00000541586 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.54■■■■■ 5.2
CCM2-218ENST00000541586 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.46■■■■■ 5.19
CCM2-218ENST00000541586 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.2■■■■■ 5.15
CCM2-218ENST00000541586 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.16■■■■■ 5.14
CCM2-218ENST00000541586 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
CCM2-218ENST00000541586 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
CCM2-218ENST00000541586 ABCC8Q09428 1581 aa47.01■■■■■ 5.12
CCM2-218ENST00000541586 WDR62O43379 1518 aa46.96■■■■■ 5.11
CCM2-218ENST00000541586 TOPBP1Q92547 1522 aa46.92■■■■■ 5.1
CCM2-218ENST00000541586 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.1
CCM2-218ENST00000541586 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.87■■■■■ 5.09
CCM2-218ENST00000541586 CUX1P39880 1505 aa46.87■■■■■ 5.09
CCM2-218ENST00000541586 CUX2O14529 1486 aa46.76■■■■■ 5.08
CCM2-218ENST00000541586 SYNJ1O43426 1573 aa46.7■■■■■ 5.07
CCM2-218ENST00000541586 TOP2BQ02880 1626 aa46.62■■■■■ 5.05
CCM2-218ENST00000541586 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.61■■■■■ 5.05
CCM2-218ENST00000541586 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
CCM2-218ENST00000541586 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.55■■■■■ 5.04
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CCM2-218ENST00000541586 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.47■■■■■ 5.03
CCM2-218ENST00000541586 IFT140Q96RY7 1462 aa46.4■■■■■ 5.02
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CCM2-218ENST00000541586 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.13■■■■■ 4.98
CCM2-218ENST00000541586 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.12■■■■■ 4.977e-7■■■■■ 33.7
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CCM2-218ENST00000541586 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
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CCM2-218ENST00000541586 KIF27Q86VH2 1401 aa45.86■■■■■ 4.93
CCM2-218ENST00000541586 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.82■■■■■ 4.93
CCM2-218ENST00000541586 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.78■■■■■ 4.92
CCM2-218ENST00000541586 GRIN2BQ13224 1484 aa45.77■■■■■ 4.92
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CCM2-218ENST00000541586 PBRM1Q86U86 1689 aa45.66■■■■■ 4.9
CCM2-218ENST00000541586 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.63■■■■■ 4.9
CCM2-218ENST00000541586 IGF1RP08069 1367 aa45.62■■■■■ 4.89
CCM2-218ENST00000541586 FBLN2P98095 1184 aa45.6■■■■■ 4.89
CCM2-218ENST00000541586 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.57■■■■■ 4.89
CCM2-218ENST00000541586 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
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CCM2-218ENST00000541586 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.46■■■■■ 4.87
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CCM2-218ENST00000541586 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.39■■■■■ 4.86
CCM2-218ENST00000541586 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.39■■■■■ 4.86
CCM2-218ENST00000541586 SYNJ2O15056 1496 aa45.36■■■■■ 4.85
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CCM2-218ENST00000541586 CUL7Q14999 1698 aa45.28■■■■■ 4.84
CCM2-218ENST00000541586 CHD1O14646 1710 aa45.25■■■■■ 4.83
CCM2-218ENST00000541586 OSCARQ8IYS5 282 aa45.2■■■■■ 4.83
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CCM2-218ENST00000541586 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.17■■■■■ 4.82
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CCM2-218ENST00000541586 PRXQ9BXM0 1461 aa45.13■■■■■ 4.81
CCM2-218ENST00000541586 CEP170Q5SW79 1584 aa44.91■■■■■ 4.78
CCM2-218ENST00000541586 NUP160Q12769 1436 aa44.9■■■■■ 4.78
CCM2-218ENST00000541586 KIF21BO75037 1637 aa44.86■■■■■ 4.77
CCM2-218ENST00000541586 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
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