RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229329.6

CMAS-201, Transcript of cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMAS, Length 1,787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMAS-201ENST00000229329 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.76■■■■■ 8.12
CMAS-201ENST00000229329 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.71■■■■■ 6.83
CMAS-201ENST00000229329 ABCC9O60706 1549 aa55.76■■■■■ 6.52
CMAS-201ENST00000229329 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.01■■■■■ 6.4
CMAS-201ENST00000229329 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.81■■■■■ 6.36
CMAS-201ENST00000229329 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.27■■■■■ 6.28
CMAS-201ENST00000229329 NACADO15069 1562 aa54.06■■■■■ 6.24
CMAS-201ENST00000229329 MYO15BQ96JP2 1530 aa54■■■■■ 6.24
CMAS-201ENST00000229329 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.86■■■■■ 6.21
CMAS-201ENST00000229329 SCRIBQ14160 1630 aa53.09■■■■■ 6.09
CMAS-201ENST00000229329 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.05■■■■■ 6.08
CMAS-201ENST00000229329 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.74■■■■■ 6.03
CMAS-201ENST00000229329 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.44■■■■■ 5.99
CMAS-201ENST00000229329 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.35■■■■■ 5.97
CMAS-201ENST00000229329 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.29■■■■■ 5.8
CMAS-201ENST00000229329 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
CMAS-201ENST00000229329 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.82■■■■■ 5.73
CMAS-201ENST00000229329 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.8■■■■■ 5.72
CMAS-201ENST00000229329 SMARCA4P51532 1647 aa50.76■■■■■ 5.72
CMAS-201ENST00000229329 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.64■■■■■ 5.7
CMAS-201ENST00000229329 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.48■■■■■ 5.67
CMAS-201ENST00000229329 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.36■■■■■ 5.65
CMAS-201ENST00000229329 WIZO95785 1651 aa50.33■■■■■ 5.65
CMAS-201ENST00000229329 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.27■■■■■ 5.64
CMAS-201ENST00000229329 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.24■■■■■ 5.63
CMAS-201ENST00000229329 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.14■■■■■ 5.62
CMAS-201ENST00000229329 SMARCA2P51531 1590 aa50.09■■■■■ 5.61
CMAS-201ENST00000229329 NCAPD3P42695 1498 aa49.95■■■■■ 5.59
CMAS-201ENST00000229329 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.87■■■■■ 5.57
CMAS-201ENST00000229329 HMGXB3Q12766 1538 aa49.74■■■■■ 5.55
CMAS-201ENST00000229329 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.72■■■■■ 5.55
CMAS-201ENST00000229329 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.26■■■■■ 5.48
CMAS-201ENST00000229329 NESP48681 1621 aa48.64■■■■■ 5.38
CMAS-201ENST00000229329 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.62■■■■■ 5.37
CMAS-201ENST00000229329 CFTRP13569 1480 aa48.56■■■■■ 5.36
CMAS-201ENST00000229329 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.37■■■■■ 5.33
CMAS-201ENST00000229329 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.09■■■■■ 5.29
CMAS-201ENST00000229329 PRDM2Q13029 1718 aa48.08■■■■■ 5.29
CMAS-201ENST00000229329 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.07■■■■■ 5.29
CMAS-201ENST00000229329 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.94■■■■■ 5.26
CMAS-201ENST00000229329 ABCC8Q09428 1581 aa47.91■■■■■ 5.26
CMAS-201ENST00000229329 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.87■■■■■ 5.25
CMAS-201ENST00000229329 ERCC6Q03468 1493 aa47.86■■■■■ 5.25
CMAS-201ENST00000229329 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.7■■■■■ 5.23
CMAS-201ENST00000229329 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.67■■■■■ 5.22
CMAS-201ENST00000229329 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
CMAS-201ENST00000229329 CUX1P39880 1505 aa47.57■■■■■ 5.21
CMAS-201ENST00000229329 SYNJ1O43426 1573 aa47.55■■■■■ 5.2
CMAS-201ENST00000229329 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.54■■■■■ 5.2
CMAS-201ENST00000229329 TRIM41Q8WV44 630 aa47.47■■■■■ 5.19
CMAS-201ENST00000229329 TOPBP1Q92547 1522 aa47.44■■■■■ 5.19
CMAS-201ENST00000229329 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.44■■■■■ 5.18
CMAS-201ENST00000229329 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.4■■■■■ 5.18
CMAS-201ENST00000229329 TOP2BQ02880 1626 aa47.36■■■■■ 5.17
CMAS-201ENST00000229329 WDR62O43379 1518 aa47.32■■■■■ 5.17
CMAS-201ENST00000229329 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.31■■■■■ 5.16
CMAS-201ENST00000229329 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.21■■■■■ 5.15
CMAS-201ENST00000229329 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
CMAS-201ENST00000229329 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.05■■■■■ 5.12
CMAS-201ENST00000229329 CUX2O14529 1486 aa47.01■■■■■ 5.12
CMAS-201ENST00000229329 SOGA1O94964 1423 aa46.97■■■■■ 5.11
CMAS-201ENST00000229329 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
CMAS-201ENST00000229329 IFT140Q96RY7 1462 aa46.77■■■■■ 5.08
CMAS-201ENST00000229329 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.74■■■■■ 5.07
CMAS-201ENST00000229329 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.72■■■■■ 5.07
CMAS-201ENST00000229329 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
CMAS-201ENST00000229329 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
CMAS-201ENST00000229329 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.68■■■■■ 5.06
CMAS-201ENST00000229329 WDR97A6NE52 1622 aa46.64■■■■■ 5.06
CMAS-201ENST00000229329 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.57■■■■■ 5.05
CMAS-201ENST00000229329 KIF27Q86VH2 1401 aa46.53■■■■■ 5.04
CMAS-201ENST00000229329 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.43■■■■■ 5.02
CMAS-201ENST00000229329 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.43■■■■■ 5.02
CMAS-201ENST00000229329 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
CMAS-201ENST00000229329 IGF1RP08069 1367 aa46.3■■■■■ 5
CMAS-201ENST00000229329 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.29■■■■■ 5
CMAS-201ENST00000229329 EEA1Q15075 1411 aa46.29■■■■■ 5
CMAS-201ENST00000229329 GRIN2BQ13224 1484 aa46.2■■■■■ 4.99
CMAS-201ENST00000229329 PBRM1Q86U86 1689 aa46.18■■■■■ 4.98
CMAS-201ENST00000229329 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.14■■■■■ 4.98
CMAS-201ENST00000229329 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.13■■■■■ 4.97
CMAS-201ENST00000229329 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.08■■■■■ 4.97
CMAS-201ENST00000229329 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.02■■■■■ 4.96
CMAS-201ENST00000229329 PRXQ9BXM0 1461 aa45.97■■■■■ 4.95
CMAS-201ENST00000229329 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.93■■■■■ 4.94
CMAS-201ENST00000229329 ADAMTS12P58397 1594 aa45.91■■■■■ 4.94
CMAS-201ENST00000229329 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
CMAS-201ENST00000229329 CUL7Q14999 1698 aa45.89■■■■■ 4.94
CMAS-201ENST00000229329 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.88■■■■■ 4.94
CMAS-201ENST00000229329 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.88■■■■■ 4.94
CMAS-201ENST00000229329 FBLN2P98095 1184 aa45.85■■■■■ 4.93
CMAS-201ENST00000229329 KIF21BO75037 1637 aa45.79■■■■■ 4.92
CMAS-201ENST00000229329 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.78■■■■■ 4.92
CMAS-201ENST00000229329 SYNJ2O15056 1496 aa45.77■■■■■ 4.92
CMAS-201ENST00000229329 GOLGA3Q08378 1498 aa45.69■■■■■ 4.9
CMAS-201ENST00000229329 GRIN2AQ12879 1464 aa45.66■■■■■ 4.9
CMAS-201ENST00000229329 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.89
CMAS-201ENST00000229329 CHD1O14646 1710 aa45.57■■■■■ 4.89
CMAS-201ENST00000229329 CEP170Q5SW79 1584 aa45.42■■■■■ 4.86
CMAS-201ENST00000229329 NUP160Q12769 1436 aa45.37■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms