RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400677.4

HMX1-201, Transcript of H6 family homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HMX1, Length 1,895 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1-201ENST00000400677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.96■■■■■ 7.35
HMX1-201ENST00000400677 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.32■■■■■ 6.13
HMX1-201ENST00000400677 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.23■■■■■ 5.79
HMX1-201ENST00000400677 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.43■■■■■ 5.66
HMX1-201ENST00000400677 ABCC9O60706 1549 aa50.38■■■■■ 5.66
HMX1-201ENST00000400677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.27■■■■■ 5.64
HMX1-201ENST00000400677 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.87■■■■■ 5.57
HMX1-201ENST00000400677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.62■■■■■ 5.53
HMX1-201ENST00000400677 NACADO15069 1562 aa49.6■■■■■ 5.53
HMX1-201ENST00000400677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.22■■■■■ 5.47
HMX1-201ENST00000400677 SCRIBQ14160 1630 aa48.97■■■■■ 5.43
HMX1-201ENST00000400677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.3■■■■■ 5.32
HMX1-201ENST00000400677 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.7■■■■■ 5.23
HMX1-201ENST00000400677 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.65■■■■■ 5.22
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HMX1-201ENST00000400677 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
HMX1-201ENST00000400677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
HMX1-201ENST00000400677 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.13■■■■■ 5.13
HMX1-201ENST00000400677 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.08■■■■■ 5.13
HMX1-201ENST00000400677 SMARCA4P51532 1647 aa46.94■■■■■ 5.1
HMX1-201ENST00000400677 WIZO95785 1651 aa46.75■■■■■ 5.07
HMX1-201ENST00000400677 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.36■■■■■ 5.01
HMX1-201ENST00000400677 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
HMX1-201ENST00000400677 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
HMX1-201ENST00000400677 SMARCA2P51531 1590 aa46.15■■■■■ 4.98
HMX1-201ENST00000400677 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.11■■■■■ 4.97
HMX1-201ENST00000400677 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
HMX1-201ENST00000400677 HMGXB3Q12766 1538 aa45.74■■■■■ 4.91
HMX1-201ENST00000400677 NCAPD3P42695 1498 aa45.72■■■■■ 4.91
HMX1-201ENST00000400677 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.71■■■■■ 4.91
HMX1-201ENST00000400677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.63■■■■■ 4.9
HMX1-201ENST00000400677 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.55■■■■■ 4.88
HMX1-201ENST00000400677 TRIM41Q8WV44 630 aa44.83■■■■■ 4.77
HMX1-201ENST00000400677 ABCC8Q09428 1581 aa44.78■■■■■ 4.76
HMX1-201ENST00000400677 CFTRP13569 1480 aa44.7■■■■■ 4.75
HMX1-201ENST00000400677 PRDM2Q13029 1718 aa44.65■■■■■ 4.74
HMX1-201ENST00000400677 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.53■■■■■ 4.72
HMX1-201ENST00000400677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
HMX1-201ENST00000400677 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.35■■■■■ 4.69
HMX1-201ENST00000400677 SYNJ1O43426 1573 aa44.34■■■■■ 4.69
HMX1-201ENST00000400677 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.27■■■■■ 4.68
HMX1-201ENST00000400677 NESP48681 1621 aa44.19■■■■■ 4.67
HMX1-201ENST00000400677 TOP2BQ02880 1626 aa44.18■■■■■ 4.66
HMX1-201ENST00000400677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.17■■■■■ 4.66
HMX1-201ENST00000400677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.09■■■■■ 4.65
HMX1-201ENST00000400677 CUX1P39880 1505 aa44.04■■■■■ 4.64
HMX1-201ENST00000400677 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
HMX1-201ENST00000400677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.87■■■■■ 4.61
HMX1-201ENST00000400677 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.86■■■■■ 4.61
HMX1-201ENST00000400677 SOGA1O94964 1423 aa43.86■■■■■ 4.61
HMX1-201ENST00000400677 EEA1Q15075 1411 aa43.82■■■■■ 4.61
HMX1-201ENST00000400677 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.77■■■■■ 4.6
HMX1-201ENST00000400677 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.77■■■■■ 4.6
HMX1-201ENST00000400677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.72■■■■■ 4.59
HMX1-201ENST00000400677 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.69■■■■■ 4.58
HMX1-201ENST00000400677 TOPBP1Q92547 1522 aa43.61■■■■■ 4.57
HMX1-201ENST00000400677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.59■■■■■ 4.57
HMX1-201ENST00000400677 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
HMX1-201ENST00000400677 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.49■■■■■ 4.55
HMX1-201ENST00000400677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
HMX1-201ENST00000400677 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.37■■■■■ 4.53
HMX1-201ENST00000400677 KIF27Q86VH2 1401 aa43.37■■■■■ 4.53
HMX1-201ENST00000400677 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.34■■■■■ 4.53
HMX1-201ENST00000400677 KIF21BO75037 1637 aa43.3■■■■■ 4.52
HMX1-201ENST00000400677 CUX2O14529 1486 aa43.27■■■■■ 4.52
HMX1-201ENST00000400677 ERCC6Q03468 1493 aa43.24■■■■■ 4.51
HMX1-201ENST00000400677 GOLGA3Q08378 1498 aa43.22■■■■■ 4.51
HMX1-201ENST00000400677 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.21■■■■■ 4.51
HMX1-201ENST00000400677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.2■■■■■ 4.51
HMX1-201ENST00000400677 WDR97A6NE52 1622 aa43.16■■■■■ 4.5
HMX1-201ENST00000400677 WDR62O43379 1518 aa43.14■■■■■ 4.5
HMX1-201ENST00000400677 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
HMX1-201ENST00000400677 PRXQ9BXM0 1461 aa43.03■■■■■ 4.48
HMX1-201ENST00000400677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.02■■■■■ 4.48
HMX1-201ENST00000400677 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43■■■■■ 4.47
HMX1-201ENST00000400677 TNIKQ9UKE5 1360 aa43■■■■■ 4.47
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HMX1-201ENST00000400677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.91■■■■■ 4.46
HMX1-201ENST00000400677 IGF1RP08069 1367 aa42.91■■■■■ 4.46
HMX1-201ENST00000400677 CEP162Q5TB80 1403 aa42.81■■■■■ 4.44
HMX1-201ENST00000400677 IFT140Q96RY7 1462 aa42.78■■■■■ 4.44
HMX1-201ENST00000400677 CUL7Q14999 1698 aa42.77■■■■■ 4.44
HMX1-201ENST00000400677 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
HMX1-201ENST00000400677 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.76■■■■■ 4.44
HMX1-201ENST00000400677 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.73■■■■■ 4.43
HMX1-201ENST00000400677 PBRM1Q86U86 1689 aa42.65■■■■■ 4.42
HMX1-201ENST00000400677 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
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HMX1-201ENST00000400677 CLIP1P30622 1438 aa42.49■■■■■ 4.39
HMX1-201ENST00000400677 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
HMX1-201ENST00000400677 GRIN2BQ13224 1484 aa42.44■■■■■ 4.39
HMX1-201ENST00000400677 ADAMTS12P58397 1594 aa42.36■■■■■ 4.37
HMX1-201ENST00000400677 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.32■■■■■ 4.37
HMX1-201ENST00000400677 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.29■■■■■ 4.36
HMX1-201ENST00000400677 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
HMX1-201ENST00000400677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.19■■■■■ 4.34
HMX1-201ENST00000400677 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.12■■■■■ 4.33
HMX1-201ENST00000400677 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.12■■■■■ 4.33
HMX1-201ENST00000400677 ARAP1Q96P48 1450 aa42.1■■■■■ 4.33
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