Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCND1P24385 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCND1P24385 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CCND1P24385 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CCND1P24385 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CCND1P24385 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CCND1P24385 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCND1P24385 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCND1P24385 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCND1P24385 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CCND1P24385 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCND1P24385 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCND1P24385 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCND1P24385 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCND1P24385 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CCND1P24385 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCND1P24385 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCND1P24385 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCND1P24385 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCND1P24385 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCND1P24385 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCND1P24385 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCND1P24385 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCND1P24385 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCND1P24385 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCND1P24385 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCND1P24385 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCND1P24385 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCND1P24385 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCND1P24385 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCND1P24385 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCND1P24385 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCND1P24385 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCND1P24385 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCND1P24385 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCND1P24385 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCND1P24385 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCND1P24385 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCND1P24385 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCND1P24385 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCND1P24385 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCND1P24385 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCND1P24385 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCND1P24385 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCND1P24385 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCND1P24385 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCND1P24385 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCND1P24385 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCND1P24385 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCND1P24385 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCND1P24385 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCND1P24385 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCND1P24385 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCND1P24385 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCND1P24385 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCND1P24385 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCND1P24385 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCND1P24385 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCND1P24385 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCND1P24385 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCND1P24385 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCND1P24385 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCND1P24385 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCND1P24385 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCND1P24385 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCND1P24385 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCND1P24385 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCND1P24385 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCND1P24385 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCND1P24385 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCND1P24385 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCND1P24385 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCND1P24385 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCND1P24385 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCND1P24385 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCND1P24385 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCND1P24385 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND1P24385 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCND1P24385 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND1P24385 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCND1P24385 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND1P24385 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCND1P24385 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND1P24385 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND1P24385 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND1P24385 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND1P24385 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCND1P24385 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCND1P24385 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCND1P24385 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCND1P24385 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND1P24385 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCND1P24385 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCND1P24385 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCND1P24385 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCND1P24385 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCND1P24385 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCND1P24385 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCND1P24385 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCND1P24385 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms