RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621428.1

AC243773.2-204, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC243773.2, Length 1,462 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC243773.2-204ENST00000621428 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.92■■■■■ 8.14
AC243773.2-204ENST00000621428 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.93■■■■■ 7.02
AC243773.2-204ENST00000621428 ABCC9O60706 1549 aa58.25■■■■■ 6.92
AC243773.2-204ENST00000621428 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.75■■■■■ 6.52
AC243773.2-204ENST00000621428 NACADO15069 1562 aa55.52■■■■■ 6.48
AC243773.2-204ENST00000621428 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.3■■■■■ 6.44
AC243773.2-204ENST00000621428 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.96■■■■■ 6.39
AC243773.2-204ENST00000621428 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.79■■■■■ 6.36
AC243773.2-204ENST00000621428 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.56■■■■■ 6.33
AC243773.2-204ENST00000621428 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.5■■■■■ 6.31
AC243773.2-204ENST00000621428 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.28■■■■■ 6.28
AC243773.2-204ENST00000621428 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.1■■■■■ 6.25
AC243773.2-204ENST00000621428 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.99■■■■■ 6.23
AC243773.2-204ENST00000621428 SCRIBQ14160 1630 aa53.73■■■■■ 6.19
AC243773.2-204ENST00000621428 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.45■■■■■ 6.15
AC243773.2-204ENST00000621428 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.73■■■■■ 6.03
AC243773.2-204ENST00000621428 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.68■■■■■ 6.02
AC243773.2-204ENST00000621428 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.4■■■■■ 5.98
AC243773.2-204ENST00000621428 SMARCA4P51532 1647 aa51.32■■■■■ 5.81
AC243773.2-204ENST00000621428 NCAPD3P42695 1498 aa51.21■■■■■ 5.79
AC243773.2-204ENST00000621428 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.16■■■■■ 5.78
AC243773.2-204ENST00000621428 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.15■■■■■ 5.78
AC243773.2-204ENST00000621428 SMARCA2P51531 1590 aa51.08■■■■■ 5.77
AC243773.2-204ENST00000621428 HMGXB3Q12766 1538 aa50.94■■■■■ 5.75
AC243773.2-204ENST00000621428 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.8■■■■■ 5.72
AC243773.2-204ENST00000621428 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.8■■■■■ 5.72
AC243773.2-204ENST00000621428 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.73■■■■■ 5.71
AC243773.2-204ENST00000621428 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.34■■■■■ 5.65
AC243773.2-204ENST00000621428 ERCC6Q03468 1493 aa50.26■■■■■ 5.64
AC243773.2-204ENST00000621428 WIZO95785 1651 aa50.25■■■■■ 5.63
AC243773.2-204ENST00000621428 NESP48681 1621 aa50.22■■■■■ 5.63
AC243773.2-204ENST00000621428 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50■■■■■ 5.59
AC243773.2-204ENST00000621428 CUX2O14529 1486 aa49.94■■■■■ 5.59
AC243773.2-204ENST00000621428 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.79■■■■■ 5.56
AC243773.2-204ENST00000621428 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.68■■■■■ 5.54
AC243773.2-204ENST00000621428 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.66■■■■■ 5.54
AC243773.2-204ENST00000621428 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
AC243773.2-204ENST00000621428 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.65■■■■■ 5.54
AC243773.2-204ENST00000621428 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.53
AC243773.2-204ENST00000621428 CFTRP13569 1480 aa49.27■■■■■ 5.48
AC243773.2-204ENST00000621428 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.21■■■■■ 5.47
AC243773.2-204ENST00000621428 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.16■■■■■ 5.46
AC243773.2-204ENST00000621428 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.15■■■■■ 5.46
AC243773.2-204ENST00000621428 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.11■■■■■ 5.45
AC243773.2-204ENST00000621428 WDR62O43379 1518 aa49.08■■■■■ 5.45
AC243773.2-204ENST00000621428 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.05■■■■■ 5.44
AC243773.2-204ENST00000621428 PRDM2Q13029 1718 aa48.94■■■■■ 5.43
AC243773.2-204ENST00000621428 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
AC243773.2-204ENST00000621428 TOPBP1Q92547 1522 aa48.3■■■■■ 5.32
AC243773.2-204ENST00000621428 ABCC8Q09428 1581 aa48.21■■■■■ 5.31
AC243773.2-204ENST00000621428 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.2■■■■■ 5.31
AC243773.2-204ENST00000621428 IFT140Q96RY7 1462 aa48.13■■■■■ 5.3
AC243773.2-204ENST00000621428 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.99■■■■■ 5.27
AC243773.2-204ENST00000621428 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
AC243773.2-204ENST00000621428 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.84■■■■■ 5.25
AC243773.2-204ENST00000621428 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
AC243773.2-204ENST00000621428 OSCARQ8IYS5 282 aa47.71■■■■■ 5.23
AC243773.2-204ENST00000621428 CUX1P39880 1505 aa47.71■■■■■ 5.23
AC243773.2-204ENST00000621428 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.64■■■■■ 5.22
AC243773.2-204ENST00000621428 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.64■■■■■ 5.22
AC243773.2-204ENST00000621428 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.62■■■■■ 5.21
AC243773.2-204ENST00000621428 SOGA1O94964 1423 aa47.6■■■■■ 5.21
AC243773.2-204ENST00000621428 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
AC243773.2-204ENST00000621428 WDR97A6NE52 1622 aa47.41■■■■■ 5.18
AC243773.2-204ENST00000621428 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.38■■■■■ 5.18
AC243773.2-204ENST00000621428 CHD1O14646 1710 aa47.35■■■■■ 5.17
AC243773.2-204ENST00000621428 SYNJ1O43426 1573 aa47.25■■■■■ 5.16
AC243773.2-204ENST00000621428 TRIM41Q8WV44 630 aa47.25■■■■■ 5.15
AC243773.2-204ENST00000621428 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.19■■■■■ 5.15
AC243773.2-204ENST00000621428 TOP2BQ02880 1626 aa47.16■■■■■ 5.14
AC243773.2-204ENST00000621428 FBLN2P98095 1184 aa47.16■■■■■ 5.14
AC243773.2-204ENST00000621428 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.14■■■■■ 5.14
AC243773.2-204ENST00000621428 GRIN2BQ13224 1484 aa47.14■■■■■ 5.14
AC243773.2-204ENST00000621428 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.13■■■■■ 5.14
AC243773.2-204ENST00000621428 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.1■■■■■ 5.13
AC243773.2-204ENST00000621428 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.1■■■■■ 5.13
AC243773.2-204ENST00000621428 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.1■■■■■ 5.13
AC243773.2-204ENST00000621428 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.1■■■■■ 5.13
AC243773.2-204ENST00000621428 PBRM1Q86U86 1689 aa47.07■■■■■ 5.13
AC243773.2-204ENST00000621428 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.07■■■■■ 5.13
AC243773.2-204ENST00000621428 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.04■■■■■ 5.12
AC243773.2-204ENST00000621428 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.02■■■■■ 5.12
AC243773.2-204ENST00000621428 ARHGEF11O15085 1522 aa47.01■■■■■ 5.12
AC243773.2-204ENST00000621428 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
AC243773.2-204ENST00000621428 SYNJ2O15056 1496 aa46.92■■■■■ 5.1
AC243773.2-204ENST00000621428 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.78■■■■■ 5.08
AC243773.2-204ENST00000621428 ADAMTS12P58397 1594 aa46.65■■■■■ 5.06
AC243773.2-204ENST00000621428 ARAP1Q96P48 1450 aa46.59■■■■■ 5.05
AC243773.2-204ENST00000621428 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.56■■■■■ 5.04
AC243773.2-204ENST00000621428 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.56■■■■■ 5.04
AC243773.2-204ENST00000621428 GRIN2AQ12879 1464 aa46.55■■■■■ 5.04
AC243773.2-204ENST00000621428 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.49■■■■■ 5.03
AC243773.2-204ENST00000621428 CEP170Q5SW79 1584 aa46.37■■■■■ 5.01
AC243773.2-204ENST00000621428 NUP160Q12769 1436 aa46.36■■■■■ 5.01
AC243773.2-204ENST00000621428 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.32■■■■■ 5.01
AC243773.2-204ENST00000621428 KIF27Q86VH2 1401 aa46.29■■■■■ 5
AC243773.2-204ENST00000621428 SHROOM2Q13796 1616 aa46.11■■■■■ 4.97
AC243773.2-204ENST00000621428 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.09■■■■■ 4.97
AC243773.2-204ENST00000621428 IGF1RP08069 1367 aa46.09■■■■■ 4.97
AC243773.2-204ENST00000621428 CUL7Q14999 1698 aa46.05■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms