RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615330.4

RASGEF1C-207, Transcript of RasGEF domain family member 1C, humanhuman

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Gene RASGEF1C, Length 2,268 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1C-207ENST00000615330 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.61■■■■■ 7.61
RASGEF1C-207ENST00000615330 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.24■■■■■ 6.27
RASGEF1C-207ENST00000615330 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
RASGEF1C-207ENST00000615330 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.28■■■■■ 5.96
RASGEF1C-207ENST00000615330 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.79■■■■■ 5.88
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCC9O60706 1549 aa51.72■■■■■ 5.87
RASGEF1C-207ENST00000615330 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.46■■■■■ 5.83
RASGEF1C-207ENST00000615330 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.71■■■■■ 5.71
RASGEF1C-207ENST00000615330 NACADO15069 1562 aa50.56■■■■■ 5.68
RASGEF1C-207ENST00000615330 SCRIBQ14160 1630 aa50.38■■■■■ 5.65
RASGEF1C-207ENST00000615330 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.16■■■■■ 5.62
RASGEF1C-207ENST00000615330 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.88■■■■■ 5.58
RASGEF1C-207ENST00000615330 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.32■■■■■ 5.49
RASGEF1C-207ENST00000615330 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49■■■■■ 5.43
RASGEF1C-207ENST00000615330 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.9■■■■■ 5.42
RASGEF1C-207ENST00000615330 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.79■■■■■ 5.4
RASGEF1C-207ENST00000615330 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.76■■■■■ 5.4
RASGEF1C-207ENST00000615330 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.54■■■■■ 5.36
RASGEF1C-207ENST00000615330 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.25■■■■■ 5.32
RASGEF1C-207ENST00000615330 WIZO95785 1651 aa48.18■■■■■ 5.3
RASGEF1C-207ENST00000615330 SMARCA4P51532 1647 aa48.09■■■■■ 5.29
RASGEF1C-207ENST00000615330 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.61■■■■■ 5.21
RASGEF1C-207ENST00000615330 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
RASGEF1C-207ENST00000615330 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.31■■■■■ 5.16
RASGEF1C-207ENST00000615330 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
RASGEF1C-207ENST00000615330 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.31■■■■■ 5.16
RASGEF1C-207ENST00000615330 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.15■■■■■ 5.14
RASGEF1C-207ENST00000615330 SMARCA2P51531 1590 aa47.12■■■■■ 5.13
RASGEF1C-207ENST00000615330 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
RASGEF1C-207ENST00000615330 NCAPD3P42695 1498 aa46.75■■■■■ 5.08
RASGEF1C-207ENST00000615330 TRIM41Q8WV44 630 aa46.67■■■■■ 5.06
RASGEF1C-207ENST00000615330 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.62■■■■■ 5.05
RASGEF1C-207ENST00000615330 HMGXB3Q12766 1538 aa46.61■■■■■ 5.05
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCC8Q09428 1581 aa46.38■■■■■ 5.01
RASGEF1C-207ENST00000615330 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.14■■■■■ 4.98
RASGEF1C-207ENST00000615330 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.07■■■■■ 4.97
RASGEF1C-207ENST00000615330 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.89■■■■■ 4.94
RASGEF1C-207ENST00000615330 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.87■■■■■ 4.936e-7■■■■■ 33.4
RASGEF1C-207ENST00000615330 CFTRP13569 1480 aa45.82■■■■■ 4.93
RASGEF1C-207ENST00000615330 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.75■■■■■ 4.91
RASGEF1C-207ENST00000615330 SYNJ1O43426 1573 aa45.72■■■■■ 4.91
RASGEF1C-207ENST00000615330 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.68■■■■■ 4.9
RASGEF1C-207ENST00000615330 SOGA1O94964 1423 aa45.55■■■■■ 4.88
RASGEF1C-207ENST00000615330 NESP48681 1621 aa45.49■■■■■ 4.87
RASGEF1C-207ENST00000615330 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.42■■■■■ 4.86
RASGEF1C-207ENST00000615330 PRDM2Q13029 1718 aa45.41■■■■■ 4.86
RASGEF1C-207ENST00000615330 TOP2BQ02880 1626 aa45.35■■■■■ 4.85
RASGEF1C-207ENST00000615330 CUX1P39880 1505 aa45.33■■■■■ 4.85
RASGEF1C-207ENST00000615330 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.24■■■■■ 4.83
RASGEF1C-207ENST00000615330 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.23■■■■■ 4.83
RASGEF1C-207ENST00000615330 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.11■■■■■ 4.81
RASGEF1C-207ENST00000615330 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.09■■■■■ 4.81
RASGEF1C-207ENST00000615330 EEA1Q15075 1411 aa45.02■■■■■ 4.8
RASGEF1C-207ENST00000615330 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.86■■■■■ 4.77
RASGEF1C-207ENST00000615330 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.82■■■■■ 4.77
RASGEF1C-207ENST00000615330 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.82■■■■■ 4.77
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.75■■■■■ 4.76
RASGEF1C-207ENST00000615330 TOPBP1Q92547 1522 aa44.73■■■■■ 4.75
RASGEF1C-207ENST00000615330 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
RASGEF1C-207ENST00000615330 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.71■■■■■ 4.75
RASGEF1C-207ENST00000615330 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIF27Q86VH2 1401 aa44.63■■■■■ 4.73
RASGEF1C-207ENST00000615330 GOLGA3Q08378 1498 aa44.61■■■■■ 4.73
RASGEF1C-207ENST00000615330 CUX2O14529 1486 aa44.6■■■■■ 4.73
RASGEF1C-207ENST00000615330 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.58■■■■■ 4.73
RASGEF1C-207ENST00000615330 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.56■■■■■ 4.72
RASGEF1C-207ENST00000615330 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.54■■■■■ 4.72
RASGEF1C-207ENST00000615330 KIF21BO75037 1637 aa44.52■■■■■ 4.72
RASGEF1C-207ENST00000615330 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.5■■■■■ 4.71
RASGEF1C-207ENST00000615330 CEP162Q5TB80 1403 aa44.41■■■■■ 4.7
RASGEF1C-207ENST00000615330 PRXQ9BXM0 1461 aa44.36■■■■■ 4.69
RASGEF1C-207ENST00000615330 IGF1RP08069 1367 aa44.31■■■■■ 4.68
RASGEF1C-207ENST00000615330 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.27■■■■■ 4.68
RASGEF1C-207ENST00000615330 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.25■■■■■ 4.67
RASGEF1C-207ENST00000615330 ERCC6Q03468 1493 aa44.22■■■■■ 4.67
RASGEF1C-207ENST00000615330 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
RASGEF1C-207ENST00000615330 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.16■■■■■ 4.66
RASGEF1C-207ENST00000615330 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
RASGEF1C-207ENST00000615330 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.1■■■■■ 4.65
RASGEF1C-207ENST00000615330 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.09■■■■■ 4.65
RASGEF1C-207ENST00000615330 WDR97A6NE52 1622 aa44.07■■■■■ 4.65
RASGEF1C-207ENST00000615330 CLIP1P30622 1438 aa44.01■■■■■ 4.64
RASGEF1C-207ENST00000615330 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
RASGEF1C-207ENST00000615330 WDR62O43379 1518 aa43.97■■■■■ 4.63
RASGEF1C-207ENST00000615330 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.92■■■■■ 4.62
RASGEF1C-207ENST00000615330 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.9■■■■■ 4.62
RASGEF1C-207ENST00000615330 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.85■■■■■ 4.61
RASGEF1C-207ENST00000615330 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.83■■■■■ 4.61
RASGEF1C-207ENST00000615330 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
RASGEF1C-207ENST00000615330 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
RASGEF1C-207ENST00000615330 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
RASGEF1C-207ENST00000615330 CUL7Q14999 1698 aa43.71■■■■■ 4.59
RASGEF1C-207ENST00000615330 IFT140Q96RY7 1462 aa43.7■■■■■ 4.59
RASGEF1C-207ENST00000615330 PBRM1Q86U86 1689 aa43.58■■■■■ 4.57
RASGEF1C-207ENST00000615330 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.57■■■■■ 4.57
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARAP1Q96P48 1450 aa43.55■■■■■ 4.56
RASGEF1C-207ENST00000615330 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.52■■■■■ 4.56
RASGEF1C-207ENST00000615330 GRIN2BQ13224 1484 aa43.47■■■■■ 4.55
RASGEF1C-207ENST00000615330 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
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