RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295767.9

CHCHD4-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHCHD4, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4-201ENST00000295767 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.82■■■■■ 8.13
CHCHD4-201ENST00000295767 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.16■■■■■ 6.9
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCC9O60706 1549 aa55.98■■■■■ 6.55
CHCHD4-201ENST00000295767 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.04■■■■■ 6.4
CHCHD4-201ENST00000295767 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.56■■■■■ 6.33
CHCHD4-201ENST00000295767 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.47■■■■■ 6.31
CHCHD4-201ENST00000295767 NACADO15069 1562 aa54.39■■■■■ 6.3
CHCHD4-201ENST00000295767 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.33■■■■■ 6.29
CHCHD4-201ENST00000295767 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.24■■■■■ 6.27
CHCHD4-201ENST00000295767 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.2■■■■■ 6.11
CHCHD4-201ENST00000295767 SCRIBQ14160 1630 aa53.17■■■■■ 6.1
CHCHD4-201ENST00000295767 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.62■■■■■ 6.01
CHCHD4-201ENST00000295767 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.59■■■■■ 6.01
CHCHD4-201ENST00000295767 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.43■■■■■ 5.98
CHCHD4-201ENST00000295767 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.19■■■■■ 5.79
CHCHD4-201ENST00000295767 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.14■■■■■ 5.78
CHCHD4-201ENST00000295767 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.95■■■■■ 5.75
CHCHD4-201ENST00000295767 SMARCA4P51532 1647 aa50.92■■■■■ 5.74
CHCHD4-201ENST00000295767 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.78■■■■■ 5.72
CHCHD4-201ENST00000295767 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.71■■■■■ 5.71
CHCHD4-201ENST00000295767 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.5■■■■■ 5.67
CHCHD4-201ENST00000295767 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.48■■■■■ 5.67
CHCHD4-201ENST00000295767 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.37■■■■■ 5.65
CHCHD4-201ENST00000295767 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.34■■■■■ 5.65
CHCHD4-201ENST00000295767 SMARCA2P51531 1590 aa50.34■■■■■ 5.65
CHCHD4-201ENST00000295767 WIZO95785 1651 aa50.33■■■■■ 5.65
CHCHD4-201ENST00000295767 NCAPD3P42695 1498 aa50.14■■■■■ 5.62
CHCHD4-201ENST00000295767 HMGXB3Q12766 1538 aa50.04■■■■■ 5.6
CHCHD4-201ENST00000295767 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.99■■■■■ 5.59
CHCHD4-201ENST00000295767 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.9■■■■■ 5.58
CHCHD4-201ENST00000295767 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
CHCHD4-201ENST00000295767 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.17■■■■■ 5.46
CHCHD4-201ENST00000295767 NESP48681 1621 aa48.74■■■■■ 5.39
CHCHD4-201ENST00000295767 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.73■■■■■ 5.39
CHCHD4-201ENST00000295767 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.72■■■■■ 5.39
CHCHD4-201ENST00000295767 CFTRP13569 1480 aa48.66■■■■■ 5.38
CHCHD4-201ENST00000295767 PRDM2Q13029 1718 aa48.54■■■■■ 5.36
CHCHD4-201ENST00000295767 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.3■■■■■ 5.32
CHCHD4-201ENST00000295767 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.28■■■■■ 5.32
CHCHD4-201ENST00000295767 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.22■■■■■ 5.31
CHCHD4-201ENST00000295767 ERCC6Q03468 1493 aa48.14■■■■■ 5.3
CHCHD4-201ENST00000295767 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.07■■■■■ 5.29
CHCHD4-201ENST00000295767 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.83■■■■■ 5.25
CHCHD4-201ENST00000295767 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.8■■■■■ 5.24
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCC8Q09428 1581 aa47.75■■■■■ 5.23
CHCHD4-201ENST00000295767 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
CHCHD4-201ENST00000295767 WDR62O43379 1518 aa47.64■■■■■ 5.22
CHCHD4-201ENST00000295767 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.61■■■■■ 5.21
CHCHD4-201ENST00000295767 CUX1P39880 1505 aa47.58■■■■■ 5.21
CHCHD4-201ENST00000295767 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.57■■■■■ 5.21
CHCHD4-201ENST00000295767 TOPBP1Q92547 1522 aa47.57■■■■■ 5.21
CHCHD4-201ENST00000295767 SYNJ1O43426 1573 aa47.49■■■■■ 5.19
CHCHD4-201ENST00000295767 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.44■■■■■ 5.18
CHCHD4-201ENST00000295767 TOP2BQ02880 1626 aa47.42■■■■■ 5.18
CHCHD4-201ENST00000295767 CUX2O14529 1486 aa47.27■■■■■ 5.16
CHCHD4-201ENST00000295767 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.25■■■■■ 5.15
CHCHD4-201ENST00000295767 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.22■■■■■ 5.15
CHCHD4-201ENST00000295767 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.11■■■■■ 5.13
CHCHD4-201ENST00000295767 TRIM41Q8WV44 630 aa47.05■■■■■ 5.12
CHCHD4-201ENST00000295767 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
CHCHD4-201ENST00000295767 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.01■■■■■ 5.12
CHCHD4-201ENST00000295767 SOGA1O94964 1423 aa47■■■■■ 5.11
CHCHD4-201ENST00000295767 IFT140Q96RY7 1462 aa46.99■■■■■ 5.11
CHCHD4-201ENST00000295767 WDR97A6NE52 1622 aa46.91■■■■■ 5.1
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.82■■■■■ 5.09
CHCHD4-201ENST00000295767 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
CHCHD4-201ENST00000295767 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
CHCHD4-201ENST00000295767 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
CHCHD4-201ENST00000295767 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.61■■■■■ 5.05
CHCHD4-201ENST00000295767 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.59■■■■■ 5.05
CHCHD4-201ENST00000295767 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.5■■■■■ 5.03
CHCHD4-201ENST00000295767 KIF27Q86VH2 1401 aa46.47■■■■■ 5.03
CHCHD4-201ENST00000295767 PBRM1Q86U86 1689 aa46.47■■■■■ 5.03
CHCHD4-201ENST00000295767 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.43■■■■■ 5.02
CHCHD4-201ENST00000295767 GRIN2BQ13224 1484 aa46.35■■■■■ 5.01
CHCHD4-201ENST00000295767 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.27■■■■■ 5
CHCHD4-201ENST00000295767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.2■■■■■ 4.99
CHCHD4-201ENST00000295767 EEA1Q15075 1411 aa46.19■■■■■ 4.99
CHCHD4-201ENST00000295767 IGF1RP08069 1367 aa46.16■■■■■ 4.98
CHCHD4-201ENST00000295767 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
CHCHD4-201ENST00000295767 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
CHCHD4-201ENST00000295767 ADAMTS12P58397 1594 aa46.09■■■■■ 4.97
CHCHD4-201ENST00000295767 CUL7Q14999 1698 aa46.09■■■■■ 4.97
CHCHD4-201ENST00000295767 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.99■■■■■ 4.95
CHCHD4-201ENST00000295767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.97■■■■■ 4.95
CHCHD4-201ENST00000295767 CHD1O14646 1710 aa45.95■■■■■ 4.95
CHCHD4-201ENST00000295767 SYNJ2O15056 1496 aa45.95■■■■■ 4.95
CHCHD4-201ENST00000295767 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.92■■■■■ 4.94
CHCHD4-201ENST00000295767 PRXQ9BXM0 1461 aa45.85■■■■■ 4.93
CHCHD4-201ENST00000295767 FBLN2P98095 1184 aa45.81■■■■■ 4.92
CHCHD4-201ENST00000295767 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
CHCHD4-201ENST00000295767 GRIN2AQ12879 1464 aa45.79■■■■■ 4.92
CHCHD4-201ENST00000295767 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.77■■■■■ 4.92
CHCHD4-201ENST00000295767 KIF21BO75037 1637 aa45.74■■■■■ 4.91
CHCHD4-201ENST00000295767 CEP170Q5SW79 1584 aa45.57■■■■■ 4.89
CHCHD4-201ENST00000295767 NUP160Q12769 1436 aa45.52■■■■■ 4.88
CHCHD4-201ENST00000295767 GOLGA3Q08378 1498 aa45.5■■■■■ 4.87
CHCHD4-201ENST00000295767 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.47■■■■■ 4.87
CHCHD4-201ENST00000295767 OSCARQ8IYS5 282 aa45.44■■■■■ 4.86
CHCHD4-201ENST00000295767 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa45.43■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms