RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527407.5

ATRNL1-207, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,583 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-207ENST00000527407 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.23■■■■■ 7.39
ATRNL1-207ENST00000527407 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.2■■■■■ 6.27
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCC9O60706 1549 aa52.85■■■■■ 6.05
ATRNL1-207ENST00000527407 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.19■■■■■ 5.79
ATRNL1-207ENST00000527407 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.08■■■■■ 5.77
ATRNL1-207ENST00000527407 NACADO15069 1562 aa50.93■■■■■ 5.74
ATRNL1-207ENST00000527407 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.91■■■■■ 5.74
ATRNL1-207ENST00000527407 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.7■■■■■ 5.71
ATRNL1-207ENST00000527407 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.63■■■■■ 5.69
ATRNL1-207ENST00000527407 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.69■■■■■ 5.54
ATRNL1-207ENST00000527407 SCRIBQ14160 1630 aa49.6■■■■■ 5.53
ATRNL1-207ENST00000527407 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.5■■■■■ 5.52
ATRNL1-207ENST00000527407 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.35■■■■■ 5.49
ATRNL1-207ENST00000527407 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.82■■■■■ 5.41
ATRNL1-207ENST00000527407 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.21■■■■■ 5.31
ATRNL1-207ENST00000527407 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
ATRNL1-207ENST00000527407 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.76■■■■■ 5.24
ATRNL1-207ENST00000527407 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.71■■■■■ 5.23
ATRNL1-207ENST00000527407 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.43■■■■■ 5.18
ATRNL1-207ENST00000527407 SMARCA4P51532 1647 aa47.42■■■■■ 5.18
ATRNL1-207ENST00000527407 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.22■■■■■ 5.15
ATRNL1-207ENST00000527407 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.11■■■■■ 5.13
ATRNL1-207ENST00000527407 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
ATRNL1-207ENST00000527407 SMARCA2P51531 1590 aa47.04■■■■■ 5.12
ATRNL1-207ENST00000527407 NCAPD3P42695 1498 aa47.01■■■■■ 5.12
ATRNL1-207ENST00000527407 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.92■■■■■ 5.1
ATRNL1-207ENST00000527407 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.82■■■■■ 5.09
ATRNL1-207ENST00000527407 HMGXB3Q12766 1538 aa46.79■■■■■ 5.08
ATRNL1-207ENST00000527407 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
ATRNL1-207ENST00000527407 WIZO95785 1651 aa46.71■■■■■ 5.07
ATRNL1-207ENST00000527407 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
ATRNL1-207ENST00000527407 NESP48681 1621 aa45.83■■■■■ 4.93
ATRNL1-207ENST00000527407 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.72■■■■■ 4.91
ATRNL1-207ENST00000527407 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.7■■■■■ 4.91
ATRNL1-207ENST00000527407 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.7■■■■■ 4.91
ATRNL1-207ENST00000527407 ERCC6Q03468 1493 aa45.54■■■■■ 4.88
ATRNL1-207ENST00000527407 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.53■■■■■ 4.88
ATRNL1-207ENST00000527407 CFTRP13569 1480 aa45.48■■■■■ 4.87
ATRNL1-207ENST00000527407 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.43■■■■■ 4.86
ATRNL1-207ENST00000527407 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.22■■■■■ 4.83
ATRNL1-207ENST00000527407 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.18■■■■■ 4.82
ATRNL1-207ENST00000527407 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.08■■■■■ 4.81
ATRNL1-207ENST00000527407 PRDM2Q13029 1718 aa45.04■■■■■ 4.8
ATRNL1-207ENST00000527407 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
ATRNL1-207ENST00000527407 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.93■■■■■ 4.78
ATRNL1-207ENST00000527407 CUX2O14529 1486 aa44.85■■■■■ 4.77
ATRNL1-207ENST00000527407 WDR62O43379 1518 aa44.74■■■■■ 4.75
ATRNL1-207ENST00000527407 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
ATRNL1-207ENST00000527407 TOPBP1Q92547 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCC8Q09428 1581 aa44.46■■■■■ 4.71
ATRNL1-207ENST00000527407 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.43■■■■■ 4.7
ATRNL1-207ENST00000527407 TRIM41Q8WV44 630 aa44.34■■■■■ 4.69
ATRNL1-207ENST00000527407 CUX1P39880 1505 aa44.27■■■■■ 4.68
ATRNL1-207ENST00000527407 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.15■■■■■ 4.66
ATRNL1-207ENST00000527407 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.66
ATRNL1-207ENST00000527407 IFT140Q96RY7 1462 aa44.11■■■■■ 4.65
ATRNL1-207ENST00000527407 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.08■■■■■ 4.65
ATRNL1-207ENST00000527407 SYNJ1O43426 1573 aa43.99■■■■■ 4.63
ATRNL1-207ENST00000527407 SOGA1O94964 1423 aa43.98■■■■■ 4.63
ATRNL1-207ENST00000527407 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.97■■■■■ 4.63
ATRNL1-207ENST00000527407 TOP2BQ02880 1626 aa43.96■■■■■ 4.63
ATRNL1-207ENST00000527407 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
ATRNL1-207ENST00000527407 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.92■■■■■ 4.62
ATRNL1-207ENST00000527407 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
ATRNL1-207ENST00000527407 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
ATRNL1-207ENST00000527407 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
ATRNL1-207ENST00000527407 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
ATRNL1-207ENST00000527407 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.68■■■■■ 4.58
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.65■■■■■ 4.58
ATRNL1-207ENST00000527407 WDR97A6NE52 1622 aa43.61■■■■■ 4.57
ATRNL1-207ENST00000527407 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.46■■■■■ 4.55
ATRNL1-207ENST00000527407 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
ATRNL1-207ENST00000527407 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.41■■■■■ 4.54
ATRNL1-207ENST00000527407 GRIN2BQ13224 1484 aa43.41■■■■■ 4.54
ATRNL1-207ENST00000527407 EEA1Q15075 1411 aa43.37■■■■■ 4.53
ATRNL1-207ENST00000527407 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.32■■■■■ 4.52
ATRNL1-207ENST00000527407 PBRM1Q86U86 1689 aa43.28■■■■■ 4.52
ATRNL1-207ENST00000527407 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
ATRNL1-207ENST00000527407 FBLN2P98095 1184 aa43.21■■■■■ 4.51
ATRNL1-207ENST00000527407 KIF27Q86VH2 1401 aa43.2■■■■■ 4.51
ATRNL1-207ENST00000527407 OSCARQ8IYS5 282 aa43.14■■■■■ 4.5
ATRNL1-207ENST00000527407 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.12■■■■■ 4.49
ATRNL1-207ENST00000527407 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.12■■■■■ 4.49
ATRNL1-207ENST00000527407 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
ATRNL1-207ENST00000527407 SYNJ2O15056 1496 aa43.07■■■■■ 4.49
ATRNL1-207ENST00000527407 CHD1O14646 1710 aa43.06■■■■■ 4.48
ATRNL1-207ENST00000527407 ADAMTS12P58397 1594 aa42.99■■■■■ 4.47
ATRNL1-207ENST00000527407 IGF1RP08069 1367 aa42.97■■■■■ 4.47
ATRNL1-207ENST00000527407 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.97■■■■■ 4.47
ATRNL1-207ENST00000527407 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.93■■■■■ 4.46
ATRNL1-207ENST00000527407 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.9■■■■■ 4.46
ATRNL1-207ENST00000527407 GRIN2AQ12879 1464 aa42.85■■■■■ 4.45
ATRNL1-207ENST00000527407 CUL7Q14999 1698 aa42.78■■■■■ 4.44
ATRNL1-207ENST00000527407 KIF21BO75037 1637 aa42.75■■■■■ 4.43
ATRNL1-207ENST00000527407 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.75■■■■■ 4.43
ATRNL1-207ENST00000527407 GOLGA3Q08378 1498 aa42.73■■■■■ 4.43
ATRNL1-207ENST00000527407 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.7■■■■■ 4.43
ATRNL1-207ENST00000527407 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.66■■■■■ 4.42
ATRNL1-207ENST00000527407 NUP160Q12769 1436 aa42.62■■■■■ 4.41
ATRNL1-207ENST00000527407 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.61■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms