RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403888.7

KCTD17-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD17, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17-202ENST00000403888 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.5■■■■■ 6.8
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KCTD17-202ENST00000403888 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.65■■■■■ 5.22
KCTD17-202ENST00000403888 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.39■■■■■ 5.18
KCTD17-202ENST00000403888 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.98■■■■■ 5.11
KCTD17-202ENST00000403888 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.75■■■■■ 5.07
KCTD17-202ENST00000403888 NACADO15069 1562 aa46.11■■■■■ 4.97
KCTD17-202ENST00000403888 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
KCTD17-202ENST00000403888 ABCC9O60706 1549 aa46.04■■■■■ 4.96
KCTD17-202ENST00000403888 SCRIBQ14160 1630 aa45.76■■■■■ 4.92
KCTD17-202ENST00000403888 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.46■■■■■ 4.87
KCTD17-202ENST00000403888 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
KCTD17-202ENST00000403888 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.7■■■■■ 4.75
KCTD17-202ENST00000403888 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.56■■■■■ 4.72
KCTD17-202ENST00000403888 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.54■■■■■ 4.72
KCTD17-202ENST00000403888 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.42■■■■■ 4.7
KCTD17-202ENST00000403888 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.35■■■■■ 4.69
KCTD17-202ENST00000403888 WIZO95785 1651 aa44.1■■■■■ 4.65
KCTD17-202ENST00000403888 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.06■■■■■ 4.64
KCTD17-202ENST00000403888 SMARCA4P51532 1647 aa44■■■■■ 4.63
KCTD17-202ENST00000403888 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
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KCTD17-202ENST00000403888 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.5■■■■■ 4.55
KCTD17-202ENST00000403888 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
KCTD17-202ENST00000403888 TRIM41Q8WV44 630 aa43.34■■■■■ 4.53
KCTD17-202ENST00000403888 SMARCA2P51531 1590 aa43.33■■■■■ 4.53
KCTD17-202ENST00000403888 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.26■■■■■ 4.52
KCTD17-202ENST00000403888 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.04■■■■■ 4.48
KCTD17-202ENST00000403888 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.94■■■■■ 4.46
KCTD17-202ENST00000403888 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
KCTD17-202ENST00000403888 ABCC8Q09428 1581 aa42.6■■■■■ 4.41
KCTD17-202ENST00000403888 HMGXB3Q12766 1538 aa42.58■■■■■ 4.41
KCTD17-202ENST00000403888 NCAPD3P42695 1498 aa42.54■■■■■ 4.4
KCTD17-202ENST00000403888 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
KCTD17-202ENST00000403888 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.28■■■■■ 4.36
KCTD17-202ENST00000403888 EEA1Q15075 1411 aa42.27■■■■■ 4.36
KCTD17-202ENST00000403888 SYNJ1O43426 1573 aa42.06■■■■■ 4.32
KCTD17-202ENST00000403888 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
KCTD17-202ENST00000403888 PCGF6Q9BYE7 350 aa41.99■■■■■ 4.31
KCTD17-202ENST00000403888 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
KCTD17-202ENST00000403888 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
KCTD17-202ENST00000403888 CFTRP13569 1480 aa41.85■■■■■ 4.29
KCTD17-202ENST00000403888 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.83■■■■■ 4.29
KCTD17-202ENST00000403888 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.82■■■■■ 4.29
KCTD17-202ENST00000403888 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.77■■■■■ 4.28
KCTD17-202ENST00000403888 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.76■■■■■ 4.28
KCTD17-202ENST00000403888 PRDM2Q13029 1718 aa41.73■■■■■ 4.27
KCTD17-202ENST00000403888 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.73■■■■■ 4.27
KCTD17-202ENST00000403888 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.72■■■■■ 4.27
KCTD17-202ENST00000403888 GOLGA3Q08378 1498 aa41.66■■■■■ 4.26
KCTD17-202ENST00000403888 HRCP23327 699 aa41.65■■■■■ 4.26
KCTD17-202ENST00000403888 KIF21BO75037 1637 aa41.64■■■■■ 4.26
KCTD17-202ENST00000403888 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.58■■■■■ 4.25
KCTD17-202ENST00000403888 CEP162Q5TB80 1403 aa41.52■■■■■ 4.24
KCTD17-202ENST00000403888 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.48■■■■■ 4.23
KCTD17-202ENST00000403888 CUX1P39880 1505 aa41.48■■■■■ 4.23
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KCTD17-202ENST00000403888 KIF27Q86VH2 1401 aa41.15■■■■■ 4.18
KCTD17-202ENST00000403888 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.14■■■■■ 4.18
KCTD17-202ENST00000403888 PRXQ9BXM0 1461 aa41.13■■■■■ 4.17
KCTD17-202ENST00000403888 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.01■■■■■ 4.16
KCTD17-202ENST00000403888 CLIP1P30622 1438 aa40.99■■■■■ 4.15
KCTD17-202ENST00000403888 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.94■■■■■ 4.14
KCTD17-202ENST00000403888 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.87■■■■■ 4.13
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KCTD17-202ENST00000403888 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.8■■■■■ 4.12
KCTD17-202ENST00000403888 CUX2O14529 1486 aa40.78■■■■■ 4.12
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KCTD17-202ENST00000403888 TOPBP1Q92547 1522 aa40.69■■■■■ 4.1
KCTD17-202ENST00000403888 IGF1RP08069 1367 aa40.66■■■■■ 4.1
KCTD17-202ENST00000403888 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.6■■■■■ 4.09
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KCTD17-202ENST00000403888 ARAP1Q96P48 1450 aa40.48■■■■■ 4.07
KCTD17-202ENST00000403888 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.47■■■■■ 4.07
KCTD17-202ENST00000403888 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
KCTD17-202ENST00000403888 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.38■■■■■ 4.05
KCTD17-202ENST00000403888 WDR97A6NE52 1622 aa40.38■■■■■ 4.05
KCTD17-202ENST00000403888 APLP2Q06481 763 aa40.36■■■■■ 4.05
KCTD17-202ENST00000403888 CUL7Q14999 1698 aa40.33■■■■■ 4.05
KCTD17-202ENST00000403888 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.3■■■■■ 4.04
KCTD17-202ENST00000403888 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.3■■■■■ 4.04
KCTD17-202ENST00000403888 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.28■■■■■ 4.04
KCTD17-202ENST00000403888 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
KCTD17-202ENST00000403888 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
KCTD17-202ENST00000403888 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.18■■■■■ 4.02
KCTD17-202ENST00000403888 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
KCTD17-202ENST00000403888 MAP3K1Q13233 1512 aa40.01■■■■■ 4
KCTD17-202ENST00000403888 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.01■■■■□ 3.99
KCTD17-202ENST00000403888 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa39.99■■■■□ 3.99
KCTD17-202ENST00000403888 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
KCTD17-202ENST00000403888 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.98■■■■□ 3.99
KCTD17-202ENST00000403888 EFCAB5A4FU69 1503 aa39.98■■■■□ 3.99
KCTD17-202ENST00000403888 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
KCTD17-202ENST00000403888 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.91■■■■□ 3.98
KCTD17-202ENST00000403888 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
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