RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.52■■■■■ 7.44
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.57■■■■■ 6.17
MSRB2-201ENST00000376510 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.68■■■■■ 5.86
MSRB2-201ENST00000376510 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.94■■■■■ 5.74
MSRB2-201ENST00000376510 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.85■■■■■ 5.73
MSRB2-201ENST00000376510 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
MSRB2-201ENST00000376510 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.38■■■■■ 5.66
MSRB2-201ENST00000376510 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.18■■■■■ 5.62
MSRB2-201ENST00000376510 NACADO15069 1562 aa49.88■■■■■ 5.58
MSRB2-201ENST00000376510 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.44■■■■■ 5.51
MSRB2-201ENST00000376510 SCRIBQ14160 1630 aa49.32■■■■■ 5.49
MSRB2-201ENST00000376510 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.6■■■■■ 5.37
MSRB2-201ENST00000376510 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.41■■■■■ 5.34
MSRB2-201ENST00000376510 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.86■■■■■ 5.25
MSRB2-201ENST00000376510 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
MSRB2-201ENST00000376510 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.78■■■■■ 5.24
MSRB2-201ENST00000376510 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.74■■■■■ 5.23
MSRB2-201ENST00000376510 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.53■■■■■ 5.2
MSRB2-201ENST00000376510 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
MSRB2-201ENST00000376510 SMARCA4P51532 1647 aa47.26■■■■■ 5.16
MSRB2-201ENST00000376510 WIZO95785 1651 aa47.18■■■■■ 5.14
MSRB2-201ENST00000376510 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
MSRB2-201ENST00000376510 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.64■■■■■ 5.06
MSRB2-201ENST00000376510 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.54■■■■■ 5.04
MSRB2-201ENST00000376510 SMARCA2P51531 1590 aa46.45■■■■■ 5.03
MSRB2-201ENST00000376510 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
MSRB2-201ENST00000376510 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.45■■■■■ 5.03
MSRB2-201ENST00000376510 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
MSRB2-201ENST00000376510 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.22■■■■■ 4.99
MSRB2-201ENST00000376510 NCAPD3P42695 1498 aa46.01■■■■■ 4.96
MSRB2-201ENST00000376510 HMGXB3Q12766 1538 aa45.96■■■■■ 4.95
MSRB2-201ENST00000376510 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.74■■■■■ 4.91
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM41Q8WV44 630 aa45.7■■■■■ 4.91
MSRB2-201ENST00000376510 ABCC8Q09428 1581 aa45.3■■■■■ 4.84
MSRB2-201ENST00000376510 CFTRP13569 1480 aa45.04■■■■■ 4.8
MSRB2-201ENST00000376510 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.8
MSRB2-201ENST00000376510 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.88■■■■■ 4.78
MSRB2-201ENST00000376510 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
MSRB2-201ENST00000376510 PRDM2Q13029 1718 aa44.85■■■■■ 4.77
MSRB2-201ENST00000376510 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.8■■■■■ 4.76
MSRB2-201ENST00000376510 SYNJ1O43426 1573 aa44.78■■■■■ 4.76
MSRB2-201ENST00000376510 TOP2BQ02880 1626 aa44.6■■■■■ 4.73
MSRB2-201ENST00000376510 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.55■■■■■ 4.72
MSRB2-201ENST00000376510 SOGA1O94964 1423 aa44.48■■■■■ 4.71
MSRB2-201ENST00000376510 EEA1Q15075 1411 aa44.48■■■■■ 4.71
MSRB2-201ENST00000376510 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.47■■■■■ 4.71
MSRB2-201ENST00000376510 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.46■■■■■ 4.71
MSRB2-201ENST00000376510 CUX1P39880 1505 aa44.43■■■■■ 4.7
MSRB2-201ENST00000376510 NESP48681 1621 aa44.41■■■■■ 4.7
MSRB2-201ENST00000376510 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.39■■■■■ 4.7
MSRB2-201ENST00000376510 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.29■■■■■ 4.68
MSRB2-201ENST00000376510 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.25■■■■■ 4.67
MSRB2-201ENST00000376510 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.24■■■■■ 4.67
MSRB2-201ENST00000376510 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.15■■■■■ 4.66
MSRB2-201ENST00000376510 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.11■■■■■ 4.65
MSRB2-201ENST00000376510 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.01■■■■■ 4.64
MSRB2-201ENST00000376510 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.95■■■■■ 4.63
MSRB2-201ENST00000376510 TOPBP1Q92547 1522 aa43.91■■■■■ 4.62
MSRB2-201ENST00000376510 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.89■■■■■ 4.62
MSRB2-201ENST00000376510 KIF27Q86VH2 1401 aa43.89■■■■■ 4.62
MSRB2-201ENST00000376510 GOLGA3Q08378 1498 aa43.87■■■■■ 4.61
MSRB2-201ENST00000376510 KIF21BO75037 1637 aa43.85■■■■■ 4.61
MSRB2-201ENST00000376510 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
MSRB2-201ENST00000376510 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.76■■■■■ 4.6
MSRB2-201ENST00000376510 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.75■■■■■ 4.59
MSRB2-201ENST00000376510 CUX2O14529 1486 aa43.72■■■■■ 4.59
MSRB2-201ENST00000376510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
MSRB2-201ENST00000376510 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.58■■■■■ 4.57
MSRB2-201ENST00000376510 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.57■■■■■ 4.57
MSRB2-201ENST00000376510 PRXQ9BXM0 1461 aa43.57■■■■■ 4.56
MSRB2-201ENST00000376510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.56■■■■■ 4.56
MSRB2-201ENST00000376510 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.53■■■■■ 4.56
MSRB2-201ENST00000376510 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.53■■■■■ 4.56
MSRB2-201ENST00000376510 CEP162Q5TB80 1403 aa43.53■■■■■ 4.56
MSRB2-201ENST00000376510 IGF1RP08069 1367 aa43.44■■■■■ 4.55
MSRB2-201ENST00000376510 ERCC6Q03468 1493 aa43.4■■■■■ 4.54
MSRB2-201ENST00000376510 WDR97A6NE52 1622 aa43.36■■■■■ 4.53
MSRB2-201ENST00000376510 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.27■■■■■ 4.52
MSRB2-201ENST00000376510 WDR62O43379 1518 aa43.26■■■■■ 4.52
MSRB2-201ENST00000376510 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
MSRB2-201ENST00000376510 CLIP1P30622 1438 aa43.18■■■■■ 4.5
MSRB2-201ENST00000376510 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.17■■■■■ 4.5
MSRB2-201ENST00000376510 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
MSRB2-201ENST00000376510 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.12■■■■■ 4.49
MSRB2-201ENST00000376510 CUL7Q14999 1698 aa43.12■■■■■ 4.49
MSRB2-201ENST00000376510 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
MSRB2-201ENST00000376510 IFT140Q96RY7 1462 aa43.04■■■■■ 4.48
MSRB2-201ENST00000376510 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
MSRB2-201ENST00000376510 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.95■■■■■ 4.47
MSRB2-201ENST00000376510 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
MSRB2-201ENST00000376510 PBRM1Q86U86 1689 aa42.86■■■■■ 4.45
MSRB2-201ENST00000376510 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.85■■■■■ 4.45
MSRB2-201ENST00000376510 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.8■■■■■ 4.44
MSRB2-201ENST00000376510 GRIN2BQ13224 1484 aa42.77■■■■■ 4.44
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
MSRB2-201ENST00000376510 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
MSRB2-201ENST00000376510 ARAP1Q96P48 1450 aa42.67■■■■■ 4.42
MSRB2-201ENST00000376510 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.67■■■■■ 4.42
MSRB2-201ENST00000376510 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.66■■■■■ 4.42
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms