Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.261e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 36.8□□□□□ -1.324e-7■■■■□ 24
PRPF4O43172 BBC3-205ENST00000598636 900 ntTSL 222.64■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 24
PRPF4O43172 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 323.88■■□□□ 1.413e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.43e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.313e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.923e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 SMCO4-203ENST00000526869 374 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CLN6-205ENST00000564846 1762 ntTSL 219.84■□□□□ 0.773e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 219.59■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 GRB2-207ENST00000577711 555 ntTSL 219.42■□□□□ 0.73e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.513e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 518.17■□□□□ 0.53e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CLN6-212ENST00000636020 894 ntTSL 217.15■□□□□ 0.343e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 RPL18A-207ENST00000602216 907 ntTSL 216.37■□□□□ 0.213e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 516.24■□□□□ 0.193e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.195e-8■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 TRIM32-202ENST00000411410 699 ntTSL 316.15■□□□□ 0.183e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 315.52■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-8■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 MYH10-206ENST00000465458 799 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CLN6-211ENST00000635754 1441 nt14.73□□□□□ -0.053e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)14.62□□□□□ -0.075e-8■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 214.56□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 ACTN1-217ENST00000556203 564 ntTSL 314.43□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 RPL18A-206ENST00000600238 954 ntTSL 210.92□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-210ENST00000443197 4173 ntTSL 510.71□□□□□ -0.693e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 GRB2-210ENST00000582582 584 ntTSL 49.61□□□□□ -0.873e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.93e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.943e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.953e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.973e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 PBRM1-209ENST00000412587 4766 ntTSL 1 (best)8.62□□□□□ -1.033e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.283e-7■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.443e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.463e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 PBRM1-211ENST00000423351 4385 ntTSL 55.27□□□□□ -1.573e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CALD1-214ENST00000466704 903 ntTSL 34.39□□□□□ -1.713e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HNRNPA1-205ENST00000547566 1234 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.044e-9■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.674e-9■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HNRNPA1-211ENST00000551665 925 ntTSL 28.6□□□□□ -1.034e-9■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 416.29■□□□□ 0.22e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-6■■■■□ 23.9
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PRPF4O43172 CTSB-213ENST00000527215 545 ntTSL 415.3■□□□□ 0.042e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-215ENST00000528965 556 ntTSL 314.95□□□□□ -0.022e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 514.48□□□□□ -0.092e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 414.17□□□□□ -0.142e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-231ENST00000534382 764 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 413.81□□□□□ -0.22e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-221ENST00000531502 557 ntTSL 413.65□□□□□ -0.222e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 410.68□□□□□ -0.72e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-212ENST00000526645 559 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 48.28□□□□□ -1.082e-12■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.24e-9■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.54e-9■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.395e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.595e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HOXA3-204ENST00000521401 598 ntTSL 320.45■□□□□ 0.861e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HOXA3-206ENST00000522788 581 ntTSL 320.45■□□□□ 0.861e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-10■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.934e-7■■■■□ 23.9
PRPF4O43172 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.014e-7■■■■□ 23.9
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