RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521401.1

HOXA3-204, Transcript of homeobox A3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA3, Length 598 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-204ENST00000521401 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.22■■■■■ 6.11
HOXA3-204ENST00000521401 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.38■■■■■ 5.18
HOXA3-204ENST00000521401 ABCC9O60706 1549 aa46.94■■■■■ 5.1
HOXA3-204ENST00000521401 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.86■■■■■ 4.77
HOXA3-204ENST00000521401 NACADO15069 1562 aa44.73■■■■■ 4.75
HOXA3-204ENST00000521401 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.65■■■■■ 4.74
HOXA3-204ENST00000521401 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.36■■■■■ 4.69
HOXA3-204ENST00000521401 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
HOXA3-204ENST00000521401 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.99■■■■■ 4.63
HOXA3-204ENST00000521401 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.85■■■■■ 4.61
HOXA3-204ENST00000521401 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
HOXA3-204ENST00000521401 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.64■■■■■ 4.58
HOXA3-204ENST00000521401 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.62■■■■■ 4.57
HOXA3-204ENST00000521401 SCRIBQ14160 1630 aa43.26■■■■■ 4.52
HOXA3-204ENST00000521401 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.05■■■■■ 4.48
HOXA3-204ENST00000521401 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
HOXA3-204ENST00000521401 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.4■■■■■ 4.38
HOXA3-204ENST00000521401 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.23■■■■■ 4.35
HOXA3-204ENST00000521401 NCAPD3P42695 1498 aa41.36■■■■■ 4.21
HOXA3-204ENST00000521401 SMARCA4P51532 1647 aa41.34■■■■■ 4.21
HOXA3-204ENST00000521401 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXA3-204ENST00000521401 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
HOXA3-204ENST00000521401 SMARCA2P51531 1590 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXA3-204ENST00000521401 HMGXB3Q12766 1538 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXA3-204ENST00000521401 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXA3-204ENST00000521401 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXA3-204ENST00000521401 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
HOXA3-204ENST00000521401 NESP48681 1621 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXA3-204ENST00000521401 WIZO95785 1651 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXA3-204ENST00000521401 ERCC6Q03468 1493 aa40.44■■■■■ 4.06
HOXA3-204ENST00000521401 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
HOXA3-204ENST00000521401 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.25■■■■■ 4.03
HOXA3-204ENST00000521401 CUX2O14529 1486 aa40.2■■■■■ 4.03
HOXA3-204ENST00000521401 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.13■■■■■ 4.02
HOXA3-204ENST00000521401 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
HOXA3-204ENST00000521401 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.04■■■■■ 4
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HOXA3-204ENST00000521401 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXA3-204ENST00000521401 CFTRP13569 1480 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXA3-204ENST00000521401 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.66■■■■□ 3.94
HOXA3-204ENST00000521401 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXA3-204ENST00000521401 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXA3-204ENST00000521401 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXA3-204ENST00000521401 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXA3-204ENST00000521401 WDR62O43379 1518 aa39.55■■■■□ 3.92
HOXA3-204ENST00000521401 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
HOXA3-204ENST00000521401 PRDM2Q13029 1718 aa39.23■■■■□ 3.87
HOXA3-204ENST00000521401 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
HOXA3-204ENST00000521401 TOPBP1Q92547 1522 aa38.95■■■■□ 3.83
HOXA3-204ENST00000521401 ABCC8Q09428 1581 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXA3-204ENST00000521401 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.82■■■■□ 3.81
HOXA3-204ENST00000521401 IFT140Q96RY7 1462 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXA3-204ENST00000521401 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
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HOXA3-204ENST00000521401 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
HOXA3-204ENST00000521401 CUX1P39880 1505 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXA3-204ENST00000521401 OSCARQ8IYS5 282 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXA3-204ENST00000521401 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXA3-204ENST00000521401 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
HOXA3-204ENST00000521401 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.45■■■■□ 3.75
HOXA3-204ENST00000521401 SOGA1O94964 1423 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXA3-204ENST00000521401 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXA3-204ENST00000521401 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
HOXA3-204ENST00000521401 WDR97A6NE52 1622 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXA3-204ENST00000521401 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
HOXA3-204ENST00000521401 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXA3-204ENST00000521401 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXA3-204ENST00000521401 TRIM41Q8WV44 630 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXA3-204ENST00000521401 FBLN2P98095 1184 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXA3-204ENST00000521401 GRIN2BQ13224 1484 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXA3-204ENST00000521401 CHD1O14646 1710 aa38■■■■□ 3.67
HOXA3-204ENST00000521401 TOP2BQ02880 1626 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXA3-204ENST00000521401 SYNJ1O43426 1573 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXA3-204ENST00000521401 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.97■■■■□ 3.67
HOXA3-204ENST00000521401 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXA3-204ENST00000521401 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
HOXA3-204ENST00000521401 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXA3-204ENST00000521401 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-204ENST00000521401 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-204ENST00000521401 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-204ENST00000521401 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-204ENST00000521401 ARHGEF11O15085 1522 aa37.85■■■■□ 3.65
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HOXA3-204ENST00000521401 PBRM1Q86U86 1689 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXA3-204ENST00000521401 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXA3-204ENST00000521401 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.57■■■■□ 3.6
HOXA3-204ENST00000521401 ADAMTS12P58397 1594 aa37.56■■■■□ 3.6
HOXA3-204ENST00000521401 ARAP1Q96P48 1450 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXA3-204ENST00000521401 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.55■■■■□ 3.6
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HOXA3-204ENST00000521401 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXA3-204ENST00000521401 NUP160Q12769 1436 aa37.44■■■■□ 3.58
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HOXA3-204ENST00000521401 IGF1RP08069 1367 aa37.29■■■■□ 3.56
HOXA3-204ENST00000521401 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.17■■■■□ 3.54
HOXA3-204ENST00000521401 SHROOM2Q13796 1616 aa37.12■■■■□ 3.53
HOXA3-204ENST00000521401 JPH4Q96JJ6 628 aa37.06■■■■□ 3.52
HOXA3-204ENST00000521401 CUL7Q14999 1698 aa37.04■■■■□ 3.52
HOXA3-204ENST00000521401 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.03■■■■□ 3.52
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