RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522788.5

HOXA3-206, Transcript of homeobox A3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA3, Length 581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-206ENST00000522788 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.22■■■■■ 6.11
HOXA3-206ENST00000522788 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.38■■■■■ 5.18
HOXA3-206ENST00000522788 ABCC9O60706 1549 aa46.94■■■■■ 5.1
HOXA3-206ENST00000522788 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.86■■■■■ 4.77
HOXA3-206ENST00000522788 NACADO15069 1562 aa44.73■■■■■ 4.75
HOXA3-206ENST00000522788 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.65■■■■■ 4.74
HOXA3-206ENST00000522788 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.36■■■■■ 4.69
HOXA3-206ENST00000522788 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
HOXA3-206ENST00000522788 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.99■■■■■ 4.63
HOXA3-206ENST00000522788 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.85■■■■■ 4.61
HOXA3-206ENST00000522788 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.78■■■■■ 4.6
HOXA3-206ENST00000522788 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.64■■■■■ 4.58
HOXA3-206ENST00000522788 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.62■■■■■ 4.57
HOXA3-206ENST00000522788 SCRIBQ14160 1630 aa43.26■■■■■ 4.52
HOXA3-206ENST00000522788 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.05■■■■■ 4.48
HOXA3-206ENST00000522788 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
HOXA3-206ENST00000522788 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.4■■■■■ 4.38
HOXA3-206ENST00000522788 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.23■■■■■ 4.35
HOXA3-206ENST00000522788 NCAPD3P42695 1498 aa41.36■■■■■ 4.21
HOXA3-206ENST00000522788 SMARCA4P51532 1647 aa41.34■■■■■ 4.21
HOXA3-206ENST00000522788 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.32■■■■■ 4.2
HOXA3-206ENST00000522788 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
HOXA3-206ENST00000522788 SMARCA2P51531 1590 aa41.16■■■■■ 4.18
HOXA3-206ENST00000522788 HMGXB3Q12766 1538 aa41.04■■■■■ 4.16
HOXA3-206ENST00000522788 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.03■■■■■ 4.16
HOXA3-206ENST00000522788 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.98■■■■■ 4.15
HOXA3-206ENST00000522788 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
HOXA3-206ENST00000522788 NESP48681 1621 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXA3-206ENST00000522788 WIZO95785 1651 aa40.5■■■■■ 4.07
HOXA3-206ENST00000522788 ERCC6Q03468 1493 aa40.44■■■■■ 4.06
HOXA3-206ENST00000522788 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
HOXA3-206ENST00000522788 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.25■■■■■ 4.03
HOXA3-206ENST00000522788 CUX2O14529 1486 aa40.2■■■■■ 4.03
HOXA3-206ENST00000522788 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.13■■■■■ 4.02
HOXA3-206ENST00000522788 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
HOXA3-206ENST00000522788 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.04■■■■■ 4
HOXA3-206ENST00000522788 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
HOXA3-206ENST00000522788 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.88■■■■□ 3.97
HOXA3-206ENST00000522788 CFTRP13569 1480 aa39.79■■■■□ 3.96
HOXA3-206ENST00000522788 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.66■■■■□ 3.94
HOXA3-206ENST00000522788 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXA3-206ENST00000522788 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.64■■■■□ 3.94
HOXA3-206ENST00000522788 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXA3-206ENST00000522788 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.6■■■■□ 3.93
HOXA3-206ENST00000522788 WDR62O43379 1518 aa39.55■■■■□ 3.92
HOXA3-206ENST00000522788 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
HOXA3-206ENST00000522788 PRDM2Q13029 1718 aa39.23■■■■□ 3.87
HOXA3-206ENST00000522788 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.03■■■■□ 3.84
HOXA3-206ENST00000522788 TOPBP1Q92547 1522 aa38.95■■■■□ 3.83
HOXA3-206ENST00000522788 ABCC8Q09428 1581 aa38.87■■■■□ 3.81
HOXA3-206ENST00000522788 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.82■■■■□ 3.81
HOXA3-206ENST00000522788 IFT140Q96RY7 1462 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXA3-206ENST00000522788 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
HOXA3-206ENST00000522788 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.61■■■■□ 3.77
HOXA3-206ENST00000522788 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
HOXA3-206ENST00000522788 CUX1P39880 1505 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXA3-206ENST00000522788 OSCARQ8IYS5 282 aa38.5■■■■□ 3.75
HOXA3-206ENST00000522788 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXA3-206ENST00000522788 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
HOXA3-206ENST00000522788 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.45■■■■□ 3.75
HOXA3-206ENST00000522788 SOGA1O94964 1423 aa38.45■■■■□ 3.75
HOXA3-206ENST00000522788 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.43■■■■□ 3.74
HOXA3-206ENST00000522788 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
HOXA3-206ENST00000522788 WDR97A6NE52 1622 aa38.15■■■■□ 3.7
HOXA3-206ENST00000522788 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.08■■■■□ 3.69
HOXA3-206ENST00000522788 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXA3-206ENST00000522788 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.05■■■■□ 3.68
HOXA3-206ENST00000522788 TRIM41Q8WV44 630 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXA3-206ENST00000522788 FBLN2P98095 1184 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXA3-206ENST00000522788 GRIN2BQ13224 1484 aa38.03■■■■□ 3.68
HOXA3-206ENST00000522788 CHD1O14646 1710 aa38■■■■□ 3.67
HOXA3-206ENST00000522788 TOP2BQ02880 1626 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXA3-206ENST00000522788 SYNJ1O43426 1573 aa37.99■■■■□ 3.67
HOXA3-206ENST00000522788 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.97■■■■□ 3.67
HOXA3-206ENST00000522788 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.96■■■■□ 3.67
HOXA3-206ENST00000522788 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
HOXA3-206ENST00000522788 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.89■■■■□ 3.66
HOXA3-206ENST00000522788 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-206ENST00000522788 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-206ENST00000522788 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-206ENST00000522788 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.87■■■■□ 3.65
HOXA3-206ENST00000522788 ARHGEF11O15085 1522 aa37.85■■■■□ 3.65
HOXA3-206ENST00000522788 SYNJ2O15056 1496 aa37.83■■■■□ 3.65
HOXA3-206ENST00000522788 PBRM1Q86U86 1689 aa37.79■■■■□ 3.64
HOXA3-206ENST00000522788 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.69■■■■□ 3.62
HOXA3-206ENST00000522788 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.57■■■■□ 3.6
HOXA3-206ENST00000522788 ADAMTS12P58397 1594 aa37.56■■■■□ 3.6
HOXA3-206ENST00000522788 ARAP1Q96P48 1450 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXA3-206ENST00000522788 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXA3-206ENST00000522788 GRIN2AQ12879 1464 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXA3-206ENST00000522788 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXA3-206ENST00000522788 NUP160Q12769 1436 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXA3-206ENST00000522788 CEP170Q5SW79 1584 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXA3-206ENST00000522788 KIF27Q86VH2 1401 aa37.3■■■■□ 3.56
HOXA3-206ENST00000522788 IGF1RP08069 1367 aa37.29■■■■□ 3.56
HOXA3-206ENST00000522788 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.17■■■■□ 3.54
HOXA3-206ENST00000522788 SHROOM2Q13796 1616 aa37.12■■■■□ 3.53
HOXA3-206ENST00000522788 JPH4Q96JJ6 628 aa37.06■■■■□ 3.52
HOXA3-206ENST00000522788 CUL7Q14999 1698 aa37.04■■■■□ 3.52
HOXA3-206ENST00000522788 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms