RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598636.1

BBC3-205, Transcript of BCL2 binding component 3, humanhuman

TSL 2

Gene BBC3, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBC3-205ENST00000598636 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.27■■■■■ 6.92
BBC3-205ENST00000598636 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.89■■■■■ 5.9
BBC3-205ENST00000598636 ABCC9O60706 1549 aa50.73■■■■■ 5.71
BBC3-205ENST00000598636 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.81■■■■■ 5.4
BBC3-205ENST00000598636 NACADO15069 1562 aa48.74■■■■■ 5.39
BBC3-205ENST00000598636 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
BBC3-205ENST00000598636 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.49■■■■■ 5.35
BBC3-205ENST00000598636 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.47■■■■■ 5.35
BBC3-205ENST00000598636 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.24■■■■■ 5.31
BBC3-205ENST00000598636 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.78■■■■■ 5.24
BBC3-205ENST00000598636 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.39■■■■■ 5.18
BBC3-205ENST00000598636 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.32■■■■■ 5.17
BBC3-205ENST00000598636 SCRIBQ14160 1630 aa47.3■■■■■ 5.16
BBC3-205ENST00000598636 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.89■■■■■ 5.1
BBC3-205ENST00000598636 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.56■■■■■ 5.04
BBC3-205ENST00000598636 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
BBC3-205ENST00000598636 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.93■■■■■ 4.94
BBC3-205ENST00000598636 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.6■■■■■ 4.89
BBC3-205ENST00000598636 SMARCA4P51532 1647 aa45.26■■■■■ 4.84
BBC3-205ENST00000598636 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
BBC3-205ENST00000598636 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.98■■■■■ 4.79
BBC3-205ENST00000598636 NCAPD3P42695 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
BBC3-205ENST00000598636 SMARCA2P51531 1590 aa44.94■■■■■ 4.78
BBC3-205ENST00000598636 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.9■■■■■ 4.78
BBC3-205ENST00000598636 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.84■■■■■ 4.77
BBC3-205ENST00000598636 HMGXB3Q12766 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
BBC3-205ENST00000598636 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
BBC3-205ENST00000598636 WIZO95785 1651 aa44.43■■■■■ 4.7
BBC3-205ENST00000598636 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
BBC3-205ENST00000598636 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
BBC3-205ENST00000598636 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
BBC3-205ENST00000598636 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.81■■■■■ 4.6
BBC3-205ENST00000598636 ERCC6Q03468 1493 aa43.71■■■■■ 4.59
BBC3-205ENST00000598636 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.62■■■■■ 4.57
BBC3-205ENST00000598636 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.46■■■■■ 4.55
BBC3-205ENST00000598636 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.44■■■■■ 4.54
BBC3-205ENST00000598636 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.4■■■■■ 4.54
BBC3-205ENST00000598636 CFTRP13569 1480 aa43.38■■■■■ 4.54
BBC3-205ENST00000598636 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
BBC3-205ENST00000598636 CUX2O14529 1486 aa43.32■■■■■ 4.52
BBC3-205ENST00000598636 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.14■■■■■ 4.5
BBC3-205ENST00000598636 PRDM2Q13029 1718 aa43.14■■■■■ 4.5
BBC3-205ENST00000598636 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.1■■■■■ 4.49
BBC3-205ENST00000598636 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.06■■■■■ 4.48
BBC3-205ENST00000598636 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
BBC3-205ENST00000598636 WDR62O43379 1518 aa42.97■■■■■ 4.47
BBC3-205ENST00000598636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
BBC3-205ENST00000598636 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
BBC3-205ENST00000598636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.44■■■■■ 4.38
BBC3-205ENST00000598636 ABCC8Q09428 1581 aa42.41■■■■■ 4.38
BBC3-205ENST00000598636 IFT140Q96RY7 1462 aa42.19■■■■■ 4.34
BBC3-205ENST00000598636 CUX1P39880 1505 aa42.15■■■■■ 4.34
BBC3-205ENST00000598636 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
BBC3-205ENST00000598636 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
BBC3-205ENST00000598636 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
BBC3-205ENST00000598636 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.99■■■■■ 4.31
BBC3-205ENST00000598636 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.95■■■■■ 4.31
BBC3-205ENST00000598636 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
BBC3-205ENST00000598636 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.9■■■■■ 4.3
BBC3-205ENST00000598636 SOGA1O94964 1423 aa41.86■■■■■ 4.29
BBC3-205ENST00000598636 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.8■■■■■ 4.28
BBC3-205ENST00000598636 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.8■■■■■ 4.28
BBC3-205ENST00000598636 SYNJ1O43426 1573 aa41.78■■■■■ 4.28
BBC3-205ENST00000598636 TOP2BQ02880 1626 aa41.77■■■■■ 4.28
BBC3-205ENST00000598636 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.74■■■■■ 4.273e-9■■■■□ 23.8
BBC3-205ENST00000598636 WDR97A6NE52 1622 aa41.74■■■■■ 4.27
BBC3-205ENST00000598636 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
BBC3-205ENST00000598636 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.59■■■■■ 4.25
BBC3-205ENST00000598636 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.48■■■■■ 4.23
BBC3-205ENST00000598636 GRIN2BQ13224 1484 aa41.42■■■■■ 4.22
BBC3-205ENST00000598636 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
BBC3-205ENST00000598636 PBRM1Q86U86 1689 aa41.41■■■■■ 4.22
BBC3-205ENST00000598636 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
BBC3-205ENST00000598636 CHD1O14646 1710 aa41.38■■■■■ 4.22
BBC3-205ENST00000598636 OSCARQ8IYS5 282 aa41.38■■■■■ 4.21
BBC3-205ENST00000598636 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
BBC3-205ENST00000598636 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
BBC3-205ENST00000598636 FBLN2P98095 1184 aa41.15■■■■■ 4.18
BBC3-205ENST00000598636 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.09■■■■■ 4.17
BBC3-205ENST00000598636 ADAMTS12P58397 1594 aa41.09■■■■■ 4.17
BBC3-205ENST00000598636 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
BBC3-205ENST00000598636 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.95■■■■■ 4.15
BBC3-205ENST00000598636 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.93■■■■■ 4.14
BBC3-205ENST00000598636 KIF27Q86VH2 1401 aa40.92■■■■■ 4.14
BBC3-205ENST00000598636 GRIN2AQ12879 1464 aa40.91■■■■■ 4.14
BBC3-205ENST00000598636 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.88■■■■■ 4.13
BBC3-205ENST00000598636 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.88■■■■■ 4.13
BBC3-205ENST00000598636 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.88■■■■■ 4.13
BBC3-205ENST00000598636 ARHGEF11O15085 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
BBC3-205ENST00000598636 NUP160Q12769 1436 aa40.75■■■■■ 4.11
BBC3-205ENST00000598636 IGF1RP08069 1367 aa40.74■■■■■ 4.11
BBC3-205ENST00000598636 CEP170Q5SW79 1584 aa40.74■■■■■ 4.11
BBC3-205ENST00000598636 CUL7Q14999 1698 aa40.73■■■■■ 4.11
BBC3-205ENST00000598636 TRIM41Q8WV44 630 aa40.67■■■■■ 4.1
BBC3-205ENST00000598636 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.55■■■■■ 4.08
BBC3-205ENST00000598636 ARAP1Q96P48 1450 aa40.53■■■■■ 4.08
BBC3-205ENST00000598636 SHROOM2Q13796 1616 aa40.49■■■■■ 4.07
BBC3-205ENST00000598636 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.48■■■■■ 4.07
BBC3-205ENST00000598636 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.36■■■■■ 4.05
BBC3-205ENST00000598636 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.33■■■■■ 4.05
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