Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOCADQ5VW36 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOCADQ5VW36 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOCADQ5VW36 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOCADQ5VW36 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOCADQ5VW36 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOCADQ5VW36 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOCADQ5VW36 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOCADQ5VW36 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
FOCADQ5VW36 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOCADQ5VW36 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOCADQ5VW36 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOCADQ5VW36 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOCADQ5VW36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
FOCADQ5VW36 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOCADQ5VW36 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOCADQ5VW36 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOCADQ5VW36 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
FOCADQ5VW36 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FOCADQ5VW36 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FOCADQ5VW36 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOCADQ5VW36 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
FOCADQ5VW36 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOCADQ5VW36 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOCADQ5VW36 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
FOCADQ5VW36 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOCADQ5VW36 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FOCADQ5VW36 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
FOCADQ5VW36 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOCADQ5VW36 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOCADQ5VW36 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOCADQ5VW36 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOCADQ5VW36 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOCADQ5VW36 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
FOCADQ5VW36 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FOCADQ5VW36 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FOCADQ5VW36 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOCADQ5VW36 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOCADQ5VW36 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FOCADQ5VW36 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOCADQ5VW36 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FOCADQ5VW36 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FOCADQ5VW36 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms