RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000305264.7

HDAC3-201, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDAC3, Length 1,959 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-201ENST00000305264 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.26■■■■■ 7.88
HDAC3-201ENST00000305264 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.7■■■■■ 6.67
HDAC3-201ENST00000305264 ABCC9O60706 1549 aa54.59■■■■■ 6.33
HDAC3-201ENST00000305264 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.77■■■■■ 6.2
HDAC3-201ENST00000305264 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.28■■■■■ 6.12
HDAC3-201ENST00000305264 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.16■■■■■ 6.1
HDAC3-201ENST00000305264 NACADO15069 1562 aa53.03■■■■■ 6.08
HDAC3-201ENST00000305264 MYO15BQ96JP2 1530 aa53■■■■■ 6.07
HDAC3-201ENST00000305264 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.87■■■■■ 6.05
HDAC3-201ENST00000305264 SCRIBQ14160 1630 aa51.91■■■■■ 5.9
HDAC3-201ENST00000305264 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.83■■■■■ 5.89
HDAC3-201ENST00000305264 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.46■■■■■ 5.83
HDAC3-201ENST00000305264 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.31■■■■■ 5.81
HDAC3-201ENST00000305264 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.16■■■■■ 5.78
HDAC3-201ENST00000305264 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.01■■■■■ 5.6
HDAC3-201ENST00000305264 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.86■■■■■ 5.57
HDAC3-201ENST00000305264 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.73■■■■■ 5.55
HDAC3-201ENST00000305264 SMARCA4P51532 1647 aa49.7■■■■■ 5.55
HDAC3-201ENST00000305264 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.6■■■■■ 5.53
HDAC3-201ENST00000305264 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.42■■■■■ 5.5
HDAC3-201ENST00000305264 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.34■■■■■ 5.49
HDAC3-201ENST00000305264 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.2■■■■■ 5.47
HDAC3-201ENST00000305264 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.15■■■■■ 5.46
HDAC3-201ENST00000305264 WIZO95785 1651 aa49.14■■■■■ 5.46
HDAC3-201ENST00000305264 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.14■■■■■ 5.46
HDAC3-201ENST00000305264 SMARCA2P51531 1590 aa49.1■■■■■ 5.45
HDAC3-201ENST00000305264 NCAPD3P42695 1498 aa48.91■■■■■ 5.42
HDAC3-201ENST00000305264 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
HDAC3-201ENST00000305264 HMGXB3Q12766 1538 aa48.81■■■■■ 5.4
HDAC3-201ENST00000305264 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
HDAC3-201ENST00000305264 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
HDAC3-201ENST00000305264 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.04■■■■■ 5.28
HDAC3-201ENST00000305264 NESP48681 1621 aa47.56■■■■■ 5.2
HDAC3-201ENST00000305264 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.55■■■■■ 5.2
HDAC3-201ENST00000305264 CFTRP13569 1480 aa47.5■■■■■ 5.19
HDAC3-201ENST00000305264 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.49■■■■■ 5.19
HDAC3-201ENST00000305264 PRDM2Q13029 1718 aa47.3■■■■■ 5.16
HDAC3-201ENST00000305264 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.1■■■■■ 5.13
HDAC3-201ENST00000305264 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.05■■■■■ 5.12
HDAC3-201ENST00000305264 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.05■■■■■ 5.12
HDAC3-201ENST00000305264 ERCC6Q03468 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
HDAC3-201ENST00000305264 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.89■■■■■ 5.1
HDAC3-201ENST00000305264 ABCC8Q09428 1581 aa46.67■■■■■ 5.06
HDAC3-201ENST00000305264 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.62■■■■■ 5.05
HDAC3-201ENST00000305264 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.61■■■■■ 5.05
HDAC3-201ENST00000305264 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
HDAC3-201ENST00000305264 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.48■■■■■ 5.03
HDAC3-201ENST00000305264 CUX1P39880 1505 aa46.47■■■■■ 5.03
HDAC3-201ENST00000305264 WDR62O43379 1518 aa46.44■■■■■ 5.03
HDAC3-201ENST00000305264 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.44■■■■■ 5.03
HDAC3-201ENST00000305264 TOPBP1Q92547 1522 aa46.42■■■■■ 5.02
HDAC3-201ENST00000305264 SYNJ1O43426 1573 aa46.4■■■■■ 5.02
HDAC3-201ENST00000305264 TOP2BQ02880 1626 aa46.31■■■■■ 5
HDAC3-201ENST00000305264 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.3■■■■■ 5
HDAC3-201ENST00000305264 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.14■■■■■ 4.98
HDAC3-201ENST00000305264 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.14■■■■■ 4.98
HDAC3-201ENST00000305264 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.1■■■■■ 4.97
HDAC3-201ENST00000305264 CUX2O14529 1486 aa46.03■■■■■ 4.96
HDAC3-201ENST00000305264 TRIM41Q8WV44 630 aa46.02■■■■■ 4.96
HDAC3-201ENST00000305264 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.91■■■■■ 4.94
HDAC3-201ENST00000305264 SOGA1O94964 1423 aa45.87■■■■■ 4.93
HDAC3-201ENST00000305264 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
HDAC3-201ENST00000305264 IFT140Q96RY7 1462 aa45.83■■■■■ 4.93
HDAC3-201ENST00000305264 WDR97A6NE52 1622 aa45.76■■■■■ 4.92
HDAC3-201ENST00000305264 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.71■■■■■ 4.91
HDAC3-201ENST00000305264 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
HDAC3-201ENST00000305264 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
HDAC3-201ENST00000305264 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
HDAC3-201ENST00000305264 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.49■■■■■ 4.87
HDAC3-201ENST00000305264 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.875e-7■■■■□ 26.2
HDAC3-201ENST00000305264 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.4■■■■■ 4.86
HDAC3-201ENST00000305264 KIF27Q86VH2 1401 aa45.4■■■■■ 4.86
HDAC3-201ENST00000305264 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.39■■■■■ 4.86
HDAC3-201ENST00000305264 PBRM1Q86U86 1689 aa45.31■■■■■ 4.84
HDAC3-201ENST00000305264 GRIN2BQ13224 1484 aa45.22■■■■■ 4.83
HDAC3-201ENST00000305264 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.17■■■■■ 4.82
HDAC3-201ENST00000305264 EEA1Q15075 1411 aa45.15■■■■■ 4.82
HDAC3-201ENST00000305264 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
HDAC3-201ENST00000305264 IGF1RP08069 1367 aa45.11■■■■■ 4.81
HDAC3-201ENST00000305264 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.08■■■■■ 4.81
HDAC3-201ENST00000305264 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
HDAC3-201ENST00000305264 ADAMTS12P58397 1594 aa44.99■■■■■ 4.79
HDAC3-201ENST00000305264 CUL7Q14999 1698 aa44.97■■■■■ 4.79
HDAC3-201ENST00000305264 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.96■■■■■ 4.79
HDAC3-201ENST00000305264 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.87■■■■■ 4.77
HDAC3-201ENST00000305264 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.85■■■■■ 4.77
HDAC3-201ENST00000305264 SYNJ2O15056 1496 aa44.83■■■■■ 4.77
HDAC3-201ENST00000305264 PRXQ9BXM0 1461 aa44.82■■■■■ 4.76
HDAC3-201ENST00000305264 CHD1O14646 1710 aa44.77■■■■■ 4.76
HDAC3-201ENST00000305264 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.71■■■■■ 4.75
HDAC3-201ENST00000305264 KIF21BO75037 1637 aa44.7■■■■■ 4.75
HDAC3-201ENST00000305264 FBLN2P98095 1184 aa44.7■■■■■ 4.75
HDAC3-201ENST00000305264 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.69■■■■■ 4.74
HDAC3-201ENST00000305264 GRIN2AQ12879 1464 aa44.68■■■■■ 4.74
HDAC3-201ENST00000305264 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.53■■■■■ 4.72
HDAC3-201ENST00000305264 GOLGA3Q08378 1498 aa44.49■■■■■ 4.71
HDAC3-201ENST00000305264 CEP170Q5SW79 1584 aa44.46■■■■■ 4.71
HDAC3-201ENST00000305264 NUP160Q12769 1436 aa44.42■■■■■ 4.7
HDAC3-201ENST00000305264 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.32■■■■■ 4.69
HDAC3-201ENST00000305264 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.29■■■■■ 4.68
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