RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261947.4

RNF130-201, Transcript of ring finger protein 130, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF130, Length 1,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF130-201ENST00000261947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.75■■■■■ 7.8
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RNF130-201ENST00000261947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
RNF130-201ENST00000261947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.84■■■■■ 6.05
RNF130-201ENST00000261947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.75■■■■■ 6.04
RNF130-201ENST00000261947 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.44■■■■■ 5.99
RNF130-201ENST00000261947 NACADO15069 1562 aa52.35■■■■■ 5.97
RNF130-201ENST00000261947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.09■■■■■ 5.93
RNF130-201ENST00000261947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.34■■■■■ 5.81
RNF130-201ENST00000261947 SCRIBQ14160 1630 aa51.33■■■■■ 5.81
RNF130-201ENST00000261947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.04■■■■■ 5.76
RNF130-201ENST00000261947 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.52■■■■■ 5.68
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RNF130-201ENST00000261947 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.21■■■■■ 5.47
RNF130-201ENST00000261947 SMARCA4P51532 1647 aa49.19■■■■■ 5.47
RNF130-201ENST00000261947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.12■■■■■ 5.45
RNF130-201ENST00000261947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
RNF130-201ENST00000261947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.01■■■■■ 5.44
RNF130-201ENST00000261947 WIZO95785 1651 aa48.77■■■■■ 5.4
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RNF130-201ENST00000261947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.56■■■■■ 5.36
RNF130-201ENST00000261947 SMARCA2P51531 1590 aa48.55■■■■■ 5.36
RNF130-201ENST00000261947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.54■■■■■ 5.36
RNF130-201ENST00000261947 NCAPD3P42695 1498 aa48.3■■■■■ 5.32
RNF130-201ENST00000261947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.32
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RNF130-201ENST00000261947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.82■■■■■ 5.08
RNF130-201ENST00000261947 PRDM2Q13029 1718 aa46.78■■■■■ 5.08
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RNF130-201ENST00000261947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.46■■■■■ 5.03
RNF130-201ENST00000261947 ABCC8Q09428 1581 aa46.45■■■■■ 5.03
RNF130-201ENST00000261947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.45■■■■■ 5.03
RNF130-201ENST00000261947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.3■■■■■ 5
RNF130-201ENST00000261947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
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RNF130-201ENST00000261947 SYNJ1O43426 1573 aa46.11■■■■■ 4.97
RNF130-201ENST00000261947 ERCC6Q03468 1493 aa46.07■■■■■ 4.96
RNF130-201ENST00000261947 CUX1P39880 1505 aa46.06■■■■■ 4.96
RNF130-201ENST00000261947 TOP2BQ02880 1626 aa46.02■■■■■ 4.96
RNF130-201ENST00000261947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46■■■■■ 4.95
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RNF130-201ENST00000261947 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.89■■■■■ 4.94
RNF130-201ENST00000261947 TOPBP1Q92547 1522 aa45.88■■■■■ 4.94
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RNF130-201ENST00000261947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.41■■■■■ 4.86
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RNF130-201ENST00000261947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.28■■■■■ 4.84
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RNF130-201ENST00000261947 WDR97A6NE52 1622 aa45.23■■■■■ 4.83
RNF130-201ENST00000261947 IFT140Q96RY7 1462 aa45.21■■■■■ 4.83
RNF130-201ENST00000261947 EEA1Q15075 1411 aa45.19■■■■■ 4.82
RNF130-201ENST00000261947 KIF27Q86VH2 1401 aa45.18■■■■■ 4.82
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RNF130-201ENST00000261947 GRIN2BQ13224 1484 aa44.71■■■■■ 4.75
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RNF130-201ENST00000261947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
RNF130-201ENST00000261947 GRIN2AQ12879 1464 aa44.15■■■■■ 4.66
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RNF130-201ENST00000261947 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.02■■■■■ 4.64
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