RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.89■■■■■ 7.66
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.73■■■■■ 6.35
CCZ1-201ENST00000325974 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
CCZ1-201ENST00000325974 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52■■■■■ 5.92
CCZ1-201ENST00000325974 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.85■■■■■ 5.89
CCZ1-201ENST00000325974 ABCC9O60706 1549 aa51.54■■■■■ 5.84
CCZ1-201ENST00000325974 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.48■■■■■ 5.83
CCZ1-201ENST00000325974 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.29■■■■■ 5.8
CCZ1-201ENST00000325974 NACADO15069 1562 aa50.92■■■■■ 5.74
CCZ1-201ENST00000325974 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.41■■■■■ 5.66
CCZ1-201ENST00000325974 SCRIBQ14160 1630 aa50.38■■■■■ 5.65
CCZ1-201ENST00000325974 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.65■■■■■ 5.54
CCZ1-201ENST00000325974 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.48■■■■■ 5.51
CCZ1-201ENST00000325974 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.92■■■■■ 5.42
CCZ1-201ENST00000325974 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.89■■■■■ 5.42
CCZ1-201ENST00000325974 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.86■■■■■ 5.41
CCZ1-201ENST00000325974 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.65■■■■■ 5.38
CCZ1-201ENST00000325974 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.61■■■■■ 5.37
CCZ1-201ENST00000325974 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.54■■■■■ 5.36
CCZ1-201ENST00000325974 SMARCA4P51532 1647 aa48.3■■■■■ 5.32
CCZ1-201ENST00000325974 WIZO95785 1651 aa48.24■■■■■ 5.31
CCZ1-201ENST00000325974 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.73■■■■■ 5.23
CCZ1-201ENST00000325974 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.7■■■■■ 5.23
CCZ1-201ENST00000325974 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.67■■■■■ 5.22
CCZ1-201ENST00000325974 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.44■■■■■ 5.19
CCZ1-201ENST00000325974 SMARCA2P51531 1590 aa47.42■■■■■ 5.18
CCZ1-201ENST00000325974 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.24■■■■■ 5.15
CCZ1-201ENST00000325974 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
CCZ1-201ENST00000325974 NCAPD3P42695 1498 aa46.99■■■■■ 5.11
CCZ1-201ENST00000325974 HMGXB3Q12766 1538 aa46.94■■■■■ 5.11
CCZ1-201ENST00000325974 TRIM41Q8WV44 630 aa46.66■■■■■ 5.06
CCZ1-201ENST00000325974 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.65■■■■■ 5.06
CCZ1-201ENST00000325974 ABCC8Q09428 1581 aa46.34■■■■■ 5.01
CCZ1-201ENST00000325974 CFTRP13569 1480 aa46.02■■■■■ 4.96
CCZ1-201ENST00000325974 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.01■■■■■ 4.96
CCZ1-201ENST00000325974 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.86■■■■■ 4.93
CCZ1-201ENST00000325974 PRDM2Q13029 1718 aa45.85■■■■■ 4.93
CCZ1-201ENST00000325974 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.82■■■■■ 4.92
CCZ1-201ENST00000325974 SYNJ1O43426 1573 aa45.82■■■■■ 4.92
CCZ1-201ENST00000325974 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.8■■■■■ 4.92
CCZ1-201ENST00000325974 TOP2BQ02880 1626 aa45.62■■■■■ 4.89
CCZ1-201ENST00000325974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.57■■■■■ 4.89
CCZ1-201ENST00000325974 SOGA1O94964 1423 aa45.51■■■■■ 4.88
CCZ1-201ENST00000325974 EEA1Q15075 1411 aa45.47■■■■■ 4.87
CCZ1-201ENST00000325974 CUX1P39880 1505 aa45.43■■■■■ 4.86
CCZ1-201ENST00000325974 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.4■■■■■ 4.86
CCZ1-201ENST00000325974 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.35■■■■■ 4.85
CCZ1-201ENST00000325974 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.34■■■■■ 4.85
CCZ1-201ENST00000325974 NESP48681 1621 aa45.33■■■■■ 4.85
CCZ1-201ENST00000325974 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.3■■■■■ 4.84
CCZ1-201ENST00000325974 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.21■■■■■ 4.83
CCZ1-201ENST00000325974 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.16■■■■■ 4.82
CCZ1-201ENST00000325974 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.98■■■■■ 4.79
CCZ1-201ENST00000325974 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.98■■■■■ 4.79
CCZ1-201ENST00000325974 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.94■■■■■ 4.79
CCZ1-201ENST00000325974 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.89■■■■■ 4.78
CCZ1-201ENST00000325974 KIF21BO75037 1637 aa44.88■■■■■ 4.78
CCZ1-201ENST00000325974 GOLGA3Q08378 1498 aa44.86■■■■■ 4.77
CCZ1-201ENST00000325974 TOPBP1Q92547 1522 aa44.85■■■■■ 4.77
CCZ1-201ENST00000325974 KIF27Q86VH2 1401 aa44.82■■■■■ 4.77
CCZ1-201ENST00000325974 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.81■■■■■ 4.76
CCZ1-201ENST00000325974 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.77■■■■■ 4.76
CCZ1-201ENST00000325974 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
CCZ1-201ENST00000325974 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
CCZ1-201ENST00000325974 CUX2O14529 1486 aa44.65■■■■■ 4.74
CCZ1-201ENST00000325974 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.65■■■■■ 4.74
CCZ1-201ENST00000325974 PRXQ9BXM0 1461 aa44.59■■■■■ 4.73
CCZ1-201ENST00000325974 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.58■■■■■ 4.73
CCZ1-201ENST00000325974 CEP162Q5TB80 1403 aa44.54■■■■■ 4.72
CCZ1-201ENST00000325974 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.53■■■■■ 4.72
CCZ1-201ENST00000325974 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.5■■■■■ 4.71
CCZ1-201ENST00000325974 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.5■■■■■ 4.71
CCZ1-201ENST00000325974 IGF1RP08069 1367 aa44.4■■■■■ 4.7
CCZ1-201ENST00000325974 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.4■■■■■ 4.7
CCZ1-201ENST00000325974 WDR97A6NE52 1622 aa44.36■■■■■ 4.69
CCZ1-201ENST00000325974 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.18■■■■■ 4.66
CCZ1-201ENST00000325974 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
CCZ1-201ENST00000325974 WDR62O43379 1518 aa44.16■■■■■ 4.66
CCZ1-201ENST00000325974 ERCC6Q03468 1493 aa44.15■■■■■ 4.66
CCZ1-201ENST00000325974 CLIP1P30622 1438 aa44.15■■■■■ 4.66
CCZ1-201ENST00000325974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.13■■■■■ 4.66
CCZ1-201ENST00000325974 CUL7Q14999 1698 aa44.05■■■■■ 4.64
CCZ1-201ENST00000325974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
CCZ1-201ENST00000325974 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.02■■■■■ 4.64
CCZ1-201ENST00000325974 PCGF6Q9BYE7 350 aa44■■■■■ 4.63
CCZ1-201ENST00000325974 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.98■■■■■ 4.63
CCZ1-201ENST00000325974 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.63
CCZ1-201ENST00000325974 IFT140Q96RY7 1462 aa43.9■■■■■ 4.62
CCZ1-201ENST00000325974 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.84■■■■■ 4.61
CCZ1-201ENST00000325974 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.8■■■■■ 4.6
CCZ1-201ENST00000325974 PBRM1Q86U86 1689 aa43.78■■■■■ 4.6
CCZ1-201ENST00000325974 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.72■■■■■ 4.59
CCZ1-201ENST00000325974 ARAP1Q96P48 1450 aa43.69■■■■■ 4.58
CCZ1-201ENST00000325974 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
CCZ1-201ENST00000325974 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.64■■■■■ 4.58
CCZ1-201ENST00000325974 GRIN2BQ13224 1484 aa43.63■■■■■ 4.58
CCZ1-201ENST00000325974 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.61■■■■■ 4.57
CCZ1-201ENST00000325974 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.54■■■■■ 4.56
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