RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412228.1

AL109917.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AL109917.1, Length 906 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL109917.1-201ENST00000412228 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.85■■■■■ 8.29
AL109917.1-201ENST00000412228 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.4■■■■■ 7.1
AL109917.1-201ENST00000412228 ABCC9O60706 1549 aa58.66■■■■■ 6.98
AL109917.1-201ENST00000412228 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.29■■■■■ 6.6
AL109917.1-201ENST00000412228 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.16■■■■■ 6.58
AL109917.1-201ENST00000412228 NACADO15069 1562 aa56.01■■■■■ 6.56
AL109917.1-201ENST00000412228 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.57■■■■■ 6.49
AL109917.1-201ENST00000412228 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.5■■■■■ 6.47
AL109917.1-201ENST00000412228 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.19■■■■■ 6.43
AL109917.1-201ENST00000412228 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.89■■■■■ 6.38
AL109917.1-201ENST00000412228 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.86■■■■■ 6.37
AL109917.1-201ENST00000412228 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.5■■■■■ 6.31
AL109917.1-201ENST00000412228 SCRIBQ14160 1630 aa54.36■■■■■ 6.29
AL109917.1-201ENST00000412228 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.27■■■■■ 6.28
AL109917.1-201ENST00000412228 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.73■■■■■ 6.19
AL109917.1-201ENST00000412228 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.07■■■■■ 6.09
AL109917.1-201ENST00000412228 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.96■■■■■ 6.07
AL109917.1-201ENST00000412228 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.69■■■■■ 6.03
AL109917.1-201ENST00000412228 SMARCA4P51532 1647 aa51.9■■■■■ 5.9
AL109917.1-201ENST00000412228 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.79■■■■■ 5.88
AL109917.1-201ENST00000412228 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.75■■■■■ 5.88
AL109917.1-201ENST00000412228 NCAPD3P42695 1498 aa51.73■■■■■ 5.87
AL109917.1-201ENST00000412228 SMARCA2P51531 1590 aa51.6■■■■■ 5.85
AL109917.1-201ENST00000412228 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.57■■■■■ 5.85
AL109917.1-201ENST00000412228 HMGXB3Q12766 1538 aa51.37■■■■■ 5.81
AL109917.1-201ENST00000412228 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.33■■■■■ 5.81
AL109917.1-201ENST00000412228 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.3■■■■■ 5.8
AL109917.1-201ENST00000412228 WIZO95785 1651 aa50.99■■■■■ 5.75
AL109917.1-201ENST00000412228 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.88■■■■■ 5.74
AL109917.1-201ENST00000412228 NESP48681 1621 aa50.68■■■■■ 5.7
AL109917.1-201ENST00000412228 ERCC6Q03468 1493 aa50.55■■■■■ 5.68
AL109917.1-201ENST00000412228 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.36■■■■■ 5.65
AL109917.1-201ENST00000412228 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.36■■■■■ 5.65
AL109917.1-201ENST00000412228 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.27■■■■■ 5.64
AL109917.1-201ENST00000412228 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.11■■■■■ 5.61
AL109917.1-201ENST00000412228 CUX2O14529 1486 aa50.01■■■■■ 5.6
AL109917.1-201ENST00000412228 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.96■■■■■ 5.59
AL109917.1-201ENST00000412228 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.88■■■■■ 5.58
AL109917.1-201ENST00000412228 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.87■■■■■ 5.57
AL109917.1-201ENST00000412228 CFTRP13569 1480 aa49.86■■■■■ 5.57
AL109917.1-201ENST00000412228 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
AL109917.1-201ENST00000412228 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.68■■■■■ 5.54
AL109917.1-201ENST00000412228 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.61■■■■■ 5.53
AL109917.1-201ENST00000412228 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.59■■■■■ 5.53
AL109917.1-201ENST00000412228 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
AL109917.1-201ENST00000412228 WDR62O43379 1518 aa49.39■■■■■ 5.5
AL109917.1-201ENST00000412228 PRDM2Q13029 1718 aa49.31■■■■■ 5.48
AL109917.1-201ENST00000412228 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
AL109917.1-201ENST00000412228 TOPBP1Q92547 1522 aa48.83■■■■■ 5.41
AL109917.1-201ENST00000412228 ABCC8Q09428 1581 aa48.77■■■■■ 5.4
AL109917.1-201ENST00000412228 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.7■■■■■ 5.39
AL109917.1-201ENST00000412228 IFT140Q96RY7 1462 aa48.57■■■■■ 5.37
AL109917.1-201ENST00000412228 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.46■■■■■ 5.35
AL109917.1-201ENST00000412228 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.4■■■■■ 5.34
AL109917.1-201ENST00000412228 CUX1P39880 1505 aa48.37■■■■■ 5.33
AL109917.1-201ENST00000412228 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.29■■■■■ 5.32
AL109917.1-201ENST00000412228 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.29■■■■■ 5.32
AL109917.1-201ENST00000412228 SOGA1O94964 1423 aa48.27■■■■■ 5.32
AL109917.1-201ENST00000412228 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.26■■■■■ 5.32
AL109917.1-201ENST00000412228 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.19■■■■■ 5.31
AL109917.1-201ENST00000412228 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
AL109917.1-201ENST00000412228 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
AL109917.1-201ENST00000412228 OSCARQ8IYS5 282 aa48.07■■■■■ 5.29
AL109917.1-201ENST00000412228 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.97■■■■■ 5.27
AL109917.1-201ENST00000412228 SYNJ1O43426 1573 aa47.84■■■■■ 5.25
AL109917.1-201ENST00000412228 TOP2BQ02880 1626 aa47.82■■■■■ 5.25
AL109917.1-201ENST00000412228 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.78■■■■■ 5.24
AL109917.1-201ENST00000412228 FBLN2P98095 1184 aa47.78■■■■■ 5.24
AL109917.1-201ENST00000412228 WDR97A6NE52 1622 aa47.76■■■■■ 5.24
AL109917.1-201ENST00000412228 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.73■■■■■ 5.23
AL109917.1-201ENST00000412228 GRIN2BQ13224 1484 aa47.67■■■■■ 5.22
AL109917.1-201ENST00000412228 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.66■■■■■ 5.22
AL109917.1-201ENST00000412228 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.66■■■■■ 5.22
AL109917.1-201ENST00000412228 TRIM41Q8WV44 630 aa47.65■■■■■ 5.22
AL109917.1-201ENST00000412228 CHD1O14646 1710 aa47.6■■■■■ 5.21
AL109917.1-201ENST00000412228 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
AL109917.1-201ENST00000412228 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
AL109917.1-201ENST00000412228 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.52■■■■■ 5.2
AL109917.1-201ENST00000412228 PBRM1Q86U86 1689 aa47.48■■■■■ 5.19
AL109917.1-201ENST00000412228 SYNJ2O15056 1496 aa47.38■■■■■ 5.17
AL109917.1-201ENST00000412228 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.2■■■■■ 5.15
AL109917.1-201ENST00000412228 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.2■■■■■ 5.15
AL109917.1-201ENST00000412228 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.2■■■■■ 5.15
AL109917.1-201ENST00000412228 ARHGEF11O15085 1522 aa47.17■■■■■ 5.14
AL109917.1-201ENST00000412228 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.13■■■■■ 5.14
AL109917.1-201ENST00000412228 ADAMTS12P58397 1594 aa47.1■■■■■ 5.13
AL109917.1-201ENST00000412228 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.08■■■■■ 5.13
AL109917.1-201ENST00000412228 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.07■■■■■ 5.13
AL109917.1-201ENST00000412228 GRIN2AQ12879 1464 aa47.05■■■■■ 5.12
AL109917.1-201ENST00000412228 KIF27Q86VH2 1401 aa46.99■■■■■ 5.11
AL109917.1-201ENST00000412228 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.94■■■■■ 5.1
AL109917.1-201ENST00000412228 IGF1RP08069 1367 aa46.9■■■■■ 5.1
AL109917.1-201ENST00000412228 NUP160Q12769 1436 aa46.83■■■■■ 5.09
AL109917.1-201ENST00000412228 CEP170Q5SW79 1584 aa46.82■■■■■ 5.09
AL109917.1-201ENST00000412228 ARAP1Q96P48 1450 aa46.79■■■■■ 5.08
AL109917.1-201ENST00000412228 CUL7Q14999 1698 aa46.61■■■■■ 5.05
AL109917.1-201ENST00000412228 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.6■■■■■ 5.05
AL109917.1-201ENST00000412228 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.58■■■■■ 5.05
AL109917.1-201ENST00000412228 JPH4Q96JJ6 628 aa46.51■■■■■ 5.04
AL109917.1-201ENST00000412228 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.51■■■■■ 5.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms