RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.9■■■■■ 8.14
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.39■■■■■ 6.94
FAAP20-204ENST00000400919 ABCC9O60706 1549 aa56.99■■■■■ 6.71
FAAP20-204ENST00000400919 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.14■■■■■ 6.42
FAAP20-204ENST00000400919 NACADO15069 1562 aa54.94■■■■■ 6.39
FAAP20-204ENST00000400919 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.93■■■■■ 6.38
FAAP20-204ENST00000400919 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.92■■■■■ 6.38
FAAP20-204ENST00000400919 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.71■■■■■ 6.35
FAAP20-204ENST00000400919 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.54■■■■■ 6.32
FAAP20-204ENST00000400919 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.45■■■■■ 6.15
FAAP20-204ENST00000400919 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.36■■■■■ 6.13
FAAP20-204ENST00000400919 SCRIBQ14160 1630 aa53.33■■■■■ 6.13
FAAP20-204ENST00000400919 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.14■■■■■ 6.1
FAAP20-204ENST00000400919 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.75■■■■■ 6.04
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.07■■■■■ 5.93
FAAP20-204ENST00000400919 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.8■■■■■ 5.88
FAAP20-204ENST00000400919 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.5■■■■■ 5.83
FAAP20-204ENST00000400919 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.29■■■■■ 5.8
FAAP20-204ENST00000400919 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.08■■■■■ 5.77
FAAP20-204ENST00000400919 SMARCA4P51532 1647 aa51.02■■■■■ 5.76
FAAP20-204ENST00000400919 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.75■■■■■ 5.72
FAAP20-204ENST00000400919 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.75■■■■■ 5.72
FAAP20-204ENST00000400919 SMARCA2P51531 1590 aa50.73■■■■■ 5.71
FAAP20-204ENST00000400919 NCAPD3P42695 1498 aa50.72■■■■■ 5.71
FAAP20-204ENST00000400919 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.54■■■■■ 5.68
FAAP20-204ENST00000400919 HMGXB3Q12766 1538 aa50.43■■■■■ 5.66
FAAP20-204ENST00000400919 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.38■■■■■ 5.66
FAAP20-204ENST00000400919 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.33■■■■■ 5.65
FAAP20-204ENST00000400919 WIZO95785 1651 aa50.17■■■■■ 5.62
FAAP20-204ENST00000400919 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.72■■■■■ 5.55
FAAP20-204ENST00000400919 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
FAAP20-204ENST00000400919 NESP48681 1621 aa49.34■■■■■ 5.49
FAAP20-204ENST00000400919 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.3■■■■■ 5.48
FAAP20-204ENST00000400919 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.29■■■■■ 5.48
FAAP20-204ENST00000400919 ERCC6Q03468 1493 aa49.18■■■■■ 5.46
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.17■■■■■ 5.46
FAAP20-204ENST00000400919 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.07■■■■■ 5.45
FAAP20-204ENST00000400919 CFTRP13569 1480 aa49.01■■■■■ 5.44
FAAP20-204ENST00000400919 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.69■■■■■ 5.38
FAAP20-204ENST00000400919 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.67■■■■■ 5.38
FAAP20-204ENST00000400919 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.6■■■■■ 5.37
FAAP20-204ENST00000400919 CUX2O14529 1486 aa48.52■■■■■ 5.36
FAAP20-204ENST00000400919 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
FAAP20-204ENST00000400919 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.47■■■■■ 5.35
FAAP20-204ENST00000400919 PRDM2Q13029 1718 aa48.45■■■■■ 5.35
FAAP20-204ENST00000400919 WDR62O43379 1518 aa48.25■■■■■ 5.31
FAAP20-204ENST00000400919 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
FAAP20-204ENST00000400919 ABCC8Q09428 1581 aa48.01■■■■■ 5.28
FAAP20-204ENST00000400919 TOPBP1Q92547 1522 aa47.91■■■■■ 5.26
FAAP20-204ENST00000400919 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.85■■■■■ 5.25
FAAP20-204ENST00000400919 CUX1P39880 1505 aa47.6■■■■■ 5.21
FAAP20-204ENST00000400919 IFT140Q96RY7 1462 aa47.6■■■■■ 5.21
FAAP20-204ENST00000400919 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
FAAP20-204ENST00000400919 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
FAAP20-204ENST00000400919 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.44■■■■■ 5.19
FAAP20-204ENST00000400919 SOGA1O94964 1423 aa47.41■■■■■ 5.18
FAAP20-204ENST00000400919 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.31■■■■■ 5.16
FAAP20-204ENST00000400919 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.28■■■■■ 5.16
FAAP20-204ENST00000400919 TOP2BQ02880 1626 aa47.26■■■■■ 5.16
FAAP20-204ENST00000400919 SYNJ1O43426 1573 aa47.23■■■■■ 5.15
FAAP20-204ENST00000400919 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.2■■■■■ 5.15
FAAP20-204ENST00000400919 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.132e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-204ENST00000400919 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
FAAP20-204ENST00000400919 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
FAAP20-204ENST00000400919 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.01■■■■■ 5.12
FAAP20-204ENST00000400919 WDR97A6NE52 1622 aa46.99■■■■■ 5.11
FAAP20-204ENST00000400919 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.83■■■■■ 5.09
FAAP20-204ENST00000400919 GRIN2BQ13224 1484 aa46.8■■■■■ 5.08
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.79■■■■■ 5.08
FAAP20-204ENST00000400919 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.71■■■■■ 5.07
FAAP20-204ENST00000400919 OSCARQ8IYS5 282 aa46.68■■■■■ 5.06
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM41Q8WV44 630 aa46.65■■■■■ 5.06
FAAP20-204ENST00000400919 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.64■■■■■ 5.06
FAAP20-204ENST00000400919 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
FAAP20-204ENST00000400919 FBLN2P98095 1184 aa46.61■■■■■ 5.05
FAAP20-204ENST00000400919 PBRM1Q86U86 1689 aa46.54■■■■■ 5.04
FAAP20-204ENST00000400919 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
FAAP20-204ENST00000400919 KIF27Q86VH2 1401 aa46.52■■■■■ 5.04
FAAP20-204ENST00000400919 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.45■■■■■ 5.03
FAAP20-204ENST00000400919 SYNJ2O15056 1496 aa46.45■■■■■ 5.03
FAAP20-204ENST00000400919 CHD1O14646 1710 aa46.35■■■■■ 5.01
FAAP20-204ENST00000400919 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.32■■■■■ 5.01
FAAP20-204ENST00000400919 IGF1RP08069 1367 aa46.27■■■■■ 5
FAAP20-204ENST00000400919 ADAMTS12P58397 1594 aa46.25■■■■■ 5
FAAP20-204ENST00000400919 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.17■■■■■ 4.98
FAAP20-204ENST00000400919 GRIN2AQ12879 1464 aa46.17■■■■■ 4.98
FAAP20-204ENST00000400919 CUL7Q14999 1698 aa46.03■■■■■ 4.96
FAAP20-204ENST00000400919 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.03■■■■■ 4.96
FAAP20-204ENST00000400919 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.02■■■■■ 4.96
FAAP20-204ENST00000400919 NUP160Q12769 1436 aa45.94■■■■■ 4.95
FAAP20-204ENST00000400919 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.94■■■■■ 4.94
FAAP20-204ENST00000400919 CEP170Q5SW79 1584 aa45.85■■■■■ 4.93
FAAP20-204ENST00000400919 EEA1Q15075 1411 aa45.8■■■■■ 4.92
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGEF11O15085 1522 aa45.77■■■■■ 4.92
FAAP20-204ENST00000400919 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.75■■■■■ 4.91
FAAP20-204ENST00000400919 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.74■■■■■ 4.91
FAAP20-204ENST00000400919 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.67■■■■■ 4.9
FAAP20-204ENST00000400919 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.67■■■■■ 4.9
FAAP20-204ENST00000400919 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.67■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms