RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405675.7

CSNK1E-205, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 2,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-205ENST00000405675 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.78■■■■■ 7.96
CSNK1E-205ENST00000405675 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.46■■■■■ 6.63
CSNK1E-205ENST00000405675 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.35■■■■■ 6.29
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC9O60706 1549 aa53.77■■■■■ 6.2
CSNK1E-205ENST00000405675 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.76■■■■■ 6.2
CSNK1E-205ENST00000405675 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.46■■■■■ 6.15
CSNK1E-205ENST00000405675 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.1■■■■■ 6.09
CSNK1E-205ENST00000405675 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.88■■■■■ 6.06
CSNK1E-205ENST00000405675 NACADO15069 1562 aa52.68■■■■■ 6.02
CSNK1E-205ENST00000405675 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.29■■■■■ 5.96
CSNK1E-205ENST00000405675 SCRIBQ14160 1630 aa52.04■■■■■ 5.92
CSNK1E-205ENST00000405675 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.36■■■■■ 5.81
CSNK1E-205ENST00000405675 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.25■■■■■ 5.79
CSNK1E-205ENST00000405675 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.78■■■■■ 5.72
CSNK1E-205ENST00000405675 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.74■■■■■ 5.71
CSNK1E-205ENST00000405675 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.44■■■■■ 5.66
CSNK1E-205ENST00000405675 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.23■■■■■ 5.63
CSNK1E-205ENST00000405675 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.09■■■■■ 5.61
CSNK1E-205ENST00000405675 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.99■■■■■ 5.59
CSNK1E-205ENST00000405675 SMARCA4P51532 1647 aa49.82■■■■■ 5.57
CSNK1E-205ENST00000405675 WIZO95785 1651 aa49.66■■■■■ 5.54
CSNK1E-205ENST00000405675 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.43■■■■■ 5.5
CSNK1E-205ENST00000405675 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.47
CSNK1E-205ENST00000405675 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.17■■■■■ 5.46
CSNK1E-205ENST00000405675 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.08■■■■■ 5.45
CSNK1E-205ENST00000405675 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.08■■■■■ 5.45
CSNK1E-205ENST00000405675 SMARCA2P51531 1590 aa48.98■■■■■ 5.43
CSNK1E-205ENST00000405675 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
CSNK1E-205ENST00000405675 NCAPD3P42695 1498 aa48.67■■■■■ 5.38
CSNK1E-205ENST00000405675 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.64■■■■■ 5.38
CSNK1E-205ENST00000405675 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.59■■■■■ 5.37
CSNK1E-205ENST00000405675 HMGXB3Q12766 1538 aa48.53■■■■■ 5.36
CSNK1E-205ENST00000405675 TRIM41Q8WV44 630 aa48.11■■■■■ 5.29
CSNK1E-205ENST00000405675 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.71■■■■■ 5.23
CSNK1E-205ENST00000405675 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.68■■■■■ 5.22
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC8Q09428 1581 aa47.6■■■■■ 5.21
CSNK1E-205ENST00000405675 CFTRP13569 1480 aa47.55■■■■■ 5.2
CSNK1E-205ENST00000405675 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.19
CSNK1E-205ENST00000405675 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.44■■■■■ 5.19
CSNK1E-205ENST00000405675 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.26■■■■■ 5.16
CSNK1E-205ENST00000405675 PRDM2Q13029 1718 aa47.17■■■■■ 5.14
CSNK1E-205ENST00000405675 NESP48681 1621 aa47.16■■■■■ 5.14
CSNK1E-205ENST00000405675 SYNJ1O43426 1573 aa47.08■■■■■ 5.13
CSNK1E-205ENST00000405675 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.01■■■■■ 5.12
CSNK1E-205ENST00000405675 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.92■■■■■ 5.1
CSNK1E-205ENST00000405675 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.88■■■■■ 5.1
CSNK1E-205ENST00000405675 TOP2BQ02880 1626 aa46.86■■■■■ 5.09
CSNK1E-205ENST00000405675 SOGA1O94964 1423 aa46.85■■■■■ 5.09
CSNK1E-205ENST00000405675 CUX1P39880 1505 aa46.83■■■■■ 5.09
CSNK1E-205ENST00000405675 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.79■■■■■ 5.08
CSNK1E-205ENST00000405675 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.69■■■■■ 5.06
CSNK1E-205ENST00000405675 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.69■■■■■ 5.06
CSNK1E-205ENST00000405675 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.62■■■■■ 5.05
CSNK1E-205ENST00000405675 EEA1Q15075 1411 aa46.59■■■■■ 5.05
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.5■■■■■ 5.03
CSNK1E-205ENST00000405675 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.48■■■■■ 5.03
CSNK1E-205ENST00000405675 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.41■■■■■ 5.02
CSNK1E-205ENST00000405675 TOPBP1Q92547 1522 aa46.38■■■■■ 5.02
CSNK1E-205ENST00000405675 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
CSNK1E-205ENST00000405675 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.35■■■■■ 5.01
CSNK1E-205ENST00000405675 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
CSNK1E-205ENST00000405675 PCGF6Q9BYE7 350 aa46.13■■■■■ 4.98
CSNK1E-205ENST00000405675 GOLGA3Q08378 1498 aa46.1■■■■■ 4.97
CSNK1E-205ENST00000405675 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.1■■■■■ 4.97
CSNK1E-205ENST00000405675 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.09■■■■■ 4.97
CSNK1E-205ENST00000405675 ERCC6Q03468 1493 aa46.07■■■■■ 4.97
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF27Q86VH2 1401 aa46.07■■■■■ 4.97
CSNK1E-205ENST00000405675 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.06■■■■■ 4.96
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF21BO75037 1637 aa46.03■■■■■ 4.96
CSNK1E-205ENST00000405675 CUX2O14529 1486 aa46.02■■■■■ 4.96
CSNK1E-205ENST00000405675 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.99■■■■■ 4.95
CSNK1E-205ENST00000405675 CEP162Q5TB80 1403 aa45.96■■■■■ 4.95
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.9■■■■■ 4.94
CSNK1E-205ENST00000405675 WDR62O43379 1518 aa45.85■■■■■ 4.93
CSNK1E-205ENST00000405675 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.82■■■■■ 4.93
CSNK1E-205ENST00000405675 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.81■■■■■ 4.92
CSNK1E-205ENST00000405675 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
CSNK1E-205ENST00000405675 IGF1RP08069 1367 aa45.73■■■■■ 4.91
CSNK1E-205ENST00000405675 WDR97A6NE52 1622 aa45.72■■■■■ 4.91
CSNK1E-205ENST00000405675 PRXQ9BXM0 1461 aa45.71■■■■■ 4.91
CSNK1E-205ENST00000405675 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
CSNK1E-205ENST00000405675 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.64■■■■■ 4.9
CSNK1E-205ENST00000405675 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.58■■■■■ 4.89
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.52■■■■■ 4.88
CSNK1E-205ENST00000405675 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
CSNK1E-205ENST00000405675 IFT140Q96RY7 1462 aa45.5■■■■■ 4.87
CSNK1E-205ENST00000405675 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.49■■■■■ 4.87
CSNK1E-205ENST00000405675 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.49■■■■■ 4.87
CSNK1E-205ENST00000405675 CLIP1P30622 1438 aa45.44■■■■■ 4.87
CSNK1E-205ENST00000405675 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.38■■■■■ 4.861e-6■■■■□ 21.7
CSNK1E-205ENST00000405675 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
CSNK1E-205ENST00000405675 CUL7Q14999 1698 aa45.27■■■■■ 4.84
CSNK1E-205ENST00000405675 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP45.25■■■■■ 4.83
CSNK1E-205ENST00000405675 HRCP23327 699 aa45.24■■■■■ 4.83
CSNK1E-205ENST00000405675 PBRM1Q86U86 1689 aa45.19■■■■■ 4.82
CSNK1E-205ENST00000405675 GRIN2BQ13224 1484 aa45.14■■■■■ 4.82
CSNK1E-205ENST00000405675 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
CSNK1E-205ENST00000405675 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.1■■■■■ 4.81
CSNK1E-205ENST00000405675 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
CSNK1E-205ENST00000405675 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.97■■■■■ 4.79
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