RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337221.8

SCARA3-202, Transcript of scavenger receptor class A member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARA3, Length 1,910 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3-202ENST00000337221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.9■■■■■ 7.66
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SCARA3-202ENST00000337221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.98■■■■■ 5.91
SCARA3-202ENST00000337221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.79■■■■■ 5.88
SCARA3-202ENST00000337221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.61■■■■■ 5.85
SCARA3-202ENST00000337221 ABCC9O60706 1549 aa51.36■■■■■ 5.81
SCARA3-202ENST00000337221 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.2■■■■■ 5.79
SCARA3-202ENST00000337221 NACADO15069 1562 aa50.78■■■■■ 5.72
SCARA3-202ENST00000337221 SCRIBQ14160 1630 aa50.35■■■■■ 5.65
SCARA3-202ENST00000337221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.25■■■■■ 5.63
SCARA3-202ENST00000337221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.82■■■■■ 5.57
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SCARA3-202ENST00000337221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.96■■■■■ 5.43
SCARA3-202ENST00000337221 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.89■■■■■ 5.42
SCARA3-202ENST00000337221 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.82■■■■■ 5.41
SCARA3-202ENST00000337221 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.64■■■■■ 5.38
SCARA3-202ENST00000337221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.52■■■■■ 5.36
SCARA3-202ENST00000337221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.5■■■■■ 5.36
SCARA3-202ENST00000337221 WIZO95785 1651 aa48.28■■■■■ 5.32
SCARA3-202ENST00000337221 SMARCA4P51532 1647 aa48.27■■■■■ 5.32
SCARA3-202ENST00000337221 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.91■■■■■ 5.26
SCARA3-202ENST00000337221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
SCARA3-202ENST00000337221 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.66■■■■■ 5.22
SCARA3-202ENST00000337221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.38■■■■■ 5.17
SCARA3-202ENST00000337221 SMARCA2P51531 1590 aa47.33■■■■■ 5.17
SCARA3-202ENST00000337221 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.28■■■■■ 5.16
SCARA3-202ENST00000337221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
SCARA3-202ENST00000337221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
SCARA3-202ENST00000337221 NCAPD3P42695 1498 aa46.88■■■■■ 5.1
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SCARA3-202ENST00000337221 TRIM41Q8WV44 630 aa46.78■■■■■ 5.08
SCARA3-202ENST00000337221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.49■■■■■ 5.03
SCARA3-202ENST00000337221 ABCC8Q09428 1581 aa46.43■■■■■ 5.02
SCARA3-202ENST00000337221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.13■■■■■ 4.97
SCARA3-202ENST00000337221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.04■■■■■ 4.96
SCARA3-202ENST00000337221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
SCARA3-202ENST00000337221 CFTRP13569 1480 aa45.97■■■■■ 4.95
SCARA3-202ENST00000337221 SYNJ1O43426 1573 aa45.89■■■■■ 4.94
SCARA3-202ENST00000337221 PRDM2Q13029 1718 aa45.76■■■■■ 4.92
SCARA3-202ENST00000337221 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.71■■■■■ 4.91
SCARA3-202ENST00000337221 TOP2BQ02880 1626 aa45.64■■■■■ 4.9
SCARA3-202ENST00000337221 SOGA1O94964 1423 aa45.64■■■■■ 4.9
SCARA3-202ENST00000337221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.59■■■■■ 4.89
SCARA3-202ENST00000337221 EEA1Q15075 1411 aa45.54■■■■■ 4.88
SCARA3-202ENST00000337221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.47■■■■■ 4.87
SCARA3-202ENST00000337221 CUX1P39880 1505 aa45.45■■■■■ 4.87
SCARA3-202ENST00000337221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.34■■■■■ 4.85
SCARA3-202ENST00000337221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.29■■■■■ 4.84
SCARA3-202ENST00000337221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.28■■■■■ 4.84
SCARA3-202ENST00000337221 NESP48681 1621 aa45.24■■■■■ 4.83
SCARA3-202ENST00000337221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.22■■■■■ 4.83
SCARA3-202ENST00000337221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.22■■■■■ 4.83
SCARA3-202ENST00000337221 KIF21BO75037 1637 aa44.98■■■■■ 4.79
SCARA3-202ENST00000337221 GOLGA3Q08378 1498 aa44.97■■■■■ 4.79
SCARA3-202ENST00000337221 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.93■■■■■ 4.78
SCARA3-202ENST00000337221 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.91■■■■■ 4.78
SCARA3-202ENST00000337221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.89■■■■■ 4.78
SCARA3-202ENST00000337221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.87■■■■■ 4.77
SCARA3-202ENST00000337221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.83■■■■■ 4.77
SCARA3-202ENST00000337221 KIF27Q86VH2 1401 aa44.82■■■■■ 4.77
SCARA3-202ENST00000337221 TOPBP1Q92547 1522 aa44.79■■■■■ 4.76
SCARA3-202ENST00000337221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
SCARA3-202ENST00000337221 CEP162Q5TB80 1403 aa44.71■■■■■ 4.75
SCARA3-202ENST00000337221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.69■■■■■ 4.75
SCARA3-202ENST00000337221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.69■■■■■ 4.74
SCARA3-202ENST00000337221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
SCARA3-202ENST00000337221 PRXQ9BXM0 1461 aa44.66■■■■■ 4.74
SCARA3-202ENST00000337221 CUX2O14529 1486 aa44.65■■■■■ 4.74
SCARA3-202ENST00000337221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
SCARA3-202ENST00000337221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.6■■■■■ 4.73
SCARA3-202ENST00000337221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.49■■■■■ 4.71
SCARA3-202ENST00000337221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.48■■■■■ 4.71
SCARA3-202ENST00000337221 IGF1RP08069 1367 aa44.42■■■■■ 4.7
SCARA3-202ENST00000337221 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.38■■■■■ 4.69
SCARA3-202ENST00000337221 WDR97A6NE52 1622 aa44.33■■■■■ 4.69
SCARA3-202ENST00000337221 CLIP1P30622 1438 aa44.27■■■■■ 4.68
SCARA3-202ENST00000337221 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.27■■■■■ 4.68
SCARA3-202ENST00000337221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
SCARA3-202ENST00000337221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.18■■■■■ 4.66
SCARA3-202ENST00000337221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
SCARA3-202ENST00000337221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.11■■■■■ 4.65
SCARA3-202ENST00000337221 WDR62O43379 1518 aa44.04■■■■■ 4.64
SCARA3-202ENST00000337221 CUL7Q14999 1698 aa44.02■■■■■ 4.64
SCARA3-202ENST00000337221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
SCARA3-202ENST00000337221 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.96■■■■■ 4.63
SCARA3-202ENST00000337221 ERCC6Q03468 1493 aa43.94■■■■■ 4.62
SCARA3-202ENST00000337221 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.94■■■■■ 4.62
SCARA3-202ENST00000337221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
SCARA3-202ENST00000337221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
SCARA3-202ENST00000337221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
SCARA3-202ENST00000337221 ARAP1Q96P48 1450 aa43.83■■■■■ 4.61
SCARA3-202ENST00000337221 IFT140Q96RY7 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
SCARA3-202ENST00000337221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa43.74■■■■■ 4.59
SCARA3-202ENST00000337221 PBRM1Q86U86 1689 aa43.72■■■■■ 4.59
SCARA3-202ENST00000337221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
SCARA3-202ENST00000337221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.62■■■■■ 4.57
SCARA3-202ENST00000337221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.59■■■■■ 4.57
SCARA3-202ENST00000337221 GRIN2BQ13224 1484 aa43.55■■■■■ 4.56
SCARA3-202ENST00000337221 ADAMTS12P58397 1594 aa43.49■■■■■ 4.55
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