Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNHIT3Q15649 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNHIT3Q15649 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNHIT3Q15649 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNHIT3Q15649 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNHIT3Q15649 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNHIT3Q15649 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNHIT3Q15649 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNHIT3Q15649 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNHIT3Q15649 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNHIT3Q15649 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNHIT3Q15649 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNHIT3Q15649 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNHIT3Q15649 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNHIT3Q15649 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNHIT3Q15649 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNHIT3Q15649 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNHIT3Q15649 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNHIT3Q15649 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNHIT3Q15649 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNHIT3Q15649 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNHIT3Q15649 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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