RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620977.1

KCNK3-202, Transcript of potassium two pore domain channel subfamily K member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNK3, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3-202ENST00000620977 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.68■■■■■ 7.14
KCNK3-202ENST00000620977 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.5■■■■■ 5.84
KCNK3-202ENST00000620977 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.32■■■■■ 5.65
KCNK3-202ENST00000620977 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.37■■■■■ 5.49
KCNK3-202ENST00000620977 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.33■■■■■ 5.49
KCNK3-202ENST00000620977 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.99■■■■■ 5.43
KCNK3-202ENST00000620977 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.39■■■■■ 5.34
KCNK3-202ENST00000620977 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
KCNK3-202ENST00000620977 ABCC9O60706 1549 aa47.96■■■■■ 5.27
KCNK3-202ENST00000620977 NACADO15069 1562 aa47.79■■■■■ 5.24
KCNK3-202ENST00000620977 SCRIBQ14160 1630 aa47.56■■■■■ 5.2
KCNK3-202ENST00000620977 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.14■■■■■ 5.14
KCNK3-202ENST00000620977 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
KCNK3-202ENST00000620977 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.46■■■■■ 5.03
KCNK3-202ENST00000620977 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.36■■■■■ 5.01
KCNK3-202ENST00000620977 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.26■■■■■ 5
KCNK3-202ENST00000620977 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.18■■■■■ 4.98
KCNK3-202ENST00000620977 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
KCNK3-202ENST00000620977 WIZO95785 1651 aa45.82■■■■■ 4.93
KCNK3-202ENST00000620977 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.8■■■■■ 4.92
KCNK3-202ENST00000620977 SMARCA4P51532 1647 aa45.65■■■■■ 4.9
KCNK3-202ENST00000620977 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
KCNK3-202ENST00000620977 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.34■■■■■ 4.85
KCNK3-202ENST00000620977 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.07■■■■■ 4.81
KCNK3-202ENST00000620977 TRIM41Q8WV44 630 aa45.02■■■■■ 4.8
KCNK3-202ENST00000620977 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
KCNK3-202ENST00000620977 SMARCA2P51531 1590 aa44.98■■■■■ 4.79
KCNK3-202ENST00000620977 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.95■■■■■ 4.79
KCNK3-202ENST00000620977 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.74■■■■■ 4.75
KCNK3-202ENST00000620977 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.72■■■■■ 4.75
KCNK3-202ENST00000620977 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
KCNK3-202ENST00000620977 ABCC8Q09428 1581 aa44.29■■■■■ 4.68
KCNK3-202ENST00000620977 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
KCNK3-202ENST00000620977 NCAPD3P42695 1498 aa44.17■■■■■ 4.66
KCNK3-202ENST00000620977 HMGXB3Q12766 1538 aa44.13■■■■■ 4.66
KCNK3-202ENST00000620977 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.89■■■■■ 4.62
KCNK3-202ENST00000620977 EEA1Q15075 1411 aa43.73■■■■■ 4.59
KCNK3-202ENST00000620977 SOGA1O94964 1423 aa43.7■■■■■ 4.59
KCNK3-202ENST00000620977 SYNJ1O43426 1573 aa43.68■■■■■ 4.58
KCNK3-202ENST00000620977 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.63■■■■■ 4.58
KCNK3-202ENST00000620977 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.58■■■■■ 4.57
KCNK3-202ENST00000620977 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.49■■■■■ 4.55
KCNK3-202ENST00000620977 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.45■■■■■ 4.55
KCNK3-202ENST00000620977 CFTRP13569 1480 aa43.45■■■■■ 4.55
KCNK3-202ENST00000620977 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.41■■■■■ 4.54
KCNK3-202ENST00000620977 TOP2BQ02880 1626 aa43.4■■■■■ 4.54
KCNK3-202ENST00000620977 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
KCNK3-202ENST00000620977 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.33■■■■■ 4.53
KCNK3-202ENST00000620977 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.26■■■■■ 4.52
KCNK3-202ENST00000620977 GOLGA3Q08378 1498 aa43.17■■■■■ 4.5
KCNK3-202ENST00000620977 HRCP23327 699 aa43.16■■■■■ 4.5
KCNK3-202ENST00000620977 PRDM2Q13029 1718 aa43.16■■■■■ 4.5
KCNK3-202ENST00000620977 KIF21BO75037 1637 aa43.11■■■■■ 4.49
KCNK3-202ENST00000620977 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.1■■■■■ 4.49
KCNK3-202ENST00000620977 CUX1P39880 1505 aa43.1■■■■■ 4.49
KCNK3-202ENST00000620977 CEP162Q5TB80 1403 aa43.08■■■■■ 4.49
KCNK3-202ENST00000620977 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.07■■■■■ 4.49
KCNK3-202ENST00000620977 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.47
KCNK3-202ENST00000620977 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.75■■■■■ 4.43
KCNK3-202ENST00000620977 KIF27Q86VH2 1401 aa42.68■■■■■ 4.42
KCNK3-202ENST00000620977 PRXQ9BXM0 1461 aa42.68■■■■■ 4.42
KCNK3-202ENST00000620977 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
KCNK3-202ENST00000620977 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.61■■■■■ 4.41
KCNK3-202ENST00000620977 CLIP1P30622 1438 aa42.53■■■■■ 4.4
KCNK3-202ENST00000620977 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
KCNK3-202ENST00000620977 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.46■■■■■ 4.39
KCNK3-202ENST00000620977 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.45■■■■■ 4.39
KCNK3-202ENST00000620977 NESP48681 1621 aa42.44■■■■■ 4.38
KCNK3-202ENST00000620977 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.37■■■■■ 4.37
KCNK3-202ENST00000620977 CUX2O14529 1486 aa42.37■■■■■ 4.37
KCNK3-202ENST00000620977 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.3■■■■■ 4.36
KCNK3-202ENST00000620977 IGF1RP08069 1367 aa42.27■■■■■ 4.36
KCNK3-202ENST00000620977 TOPBP1Q92547 1522 aa42.26■■■■■ 4.36
KCNK3-202ENST00000620977 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.18■■■■■ 4.34
KCNK3-202ENST00000620977 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
KCNK3-202ENST00000620977 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.12■■■■■ 4.33
KCNK3-202ENST00000620977 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.11■■■■■ 4.33
KCNK3-202ENST00000620977 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
KCNK3-202ENST00000620977 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
KCNK3-202ENST00000620977 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.04■■■■■ 4.32
KCNK3-202ENST00000620977 ARAP1Q96P48 1450 aa42.03■■■■■ 4.32
KCNK3-202ENST00000620977 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.03■■■■■ 4.32
KCNK3-202ENST00000620977 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
KCNK3-202ENST00000620977 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
KCNK3-202ENST00000620977 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.86■■■■■ 4.29
KCNK3-202ENST00000620977 WDR97A6NE52 1622 aa41.85■■■■■ 4.29
KCNK3-202ENST00000620977 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.85■■■■■ 4.29
KCNK3-202ENST00000620977 APLP2Q06481 763 aa41.84■■■■■ 4.29
KCNK3-202ENST00000620977 CUL7Q14999 1698 aa41.75■■■■■ 4.27
KCNK3-202ENST00000620977 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.68■■■■■ 4.26
KCNK3-202ENST00000620977 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.24
KCNK3-202ENST00000620977 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
KCNK3-202ENST00000620977 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.55■■■■■ 4.24
KCNK3-202ENST00000620977 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
KCNK3-202ENST00000620977 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.52■■■■■ 4.24
KCNK3-202ENST00000620977 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
KCNK3-202ENST00000620977 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
KCNK3-202ENST00000620977 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.41■■■■■ 4.22
KCNK3-202ENST00000620977 MAP3K1Q13233 1512 aa41.4■■■■■ 4.22
KCNK3-202ENST00000620977 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.37■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms