RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393451.7

ST7-208, Transcript of suppression of tumorigenicity 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ST7, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST7-208ENST00000393451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.72■■■■■ 6.67
ST7-208ENST00000393451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.21■■■■■ 5.31
ST7-208ENST00000393451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.14■■■■■ 5.3
ST7-208ENST00000393451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.13■■■■■ 5.29
ST7-208ENST00000393451 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
ST7-208ENST00000393451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.82■■■■■ 5.09
ST7-208ENST00000393451 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.69■■■■■ 5.07
ST7-208ENST00000393451 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.58■■■■■ 5.05
ST7-208ENST00000393451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.21■■■■■ 4.99
ST7-208ENST00000393451 HRCP23327 699 aa46.18■■■■■ 4.98
ST7-208ENST00000393451 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.54■■■■■ 4.88
ST7-208ENST00000393451 ABCC9O60706 1549 aa45.52■■■■■ 4.88
ST7-208ENST00000393451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.06■■■■■ 4.8
ST7-208ENST00000393451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
ST7-208ENST00000393451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
ST7-208ENST00000393451 SCRIBQ14160 1630 aa44.85■■■■■ 4.77
ST7-208ENST00000393451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
ST7-208ENST00000393451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.71■■■■■ 4.75
ST7-208ENST00000393451 TRIM41Q8WV44 630 aa44.39■■■■■ 4.7
ST7-208ENST00000393451 NACADO15069 1562 aa44.37■■■■■ 4.69
ST7-208ENST00000393451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
ST7-208ENST00000393451 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.98■■■■■ 4.63
ST7-208ENST00000393451 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.98■■■■■ 4.63
ST7-208ENST00000393451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
ST7-208ENST00000393451 WIZO95785 1651 aa43.74■■■■■ 4.59
ST7-208ENST00000393451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
ST7-208ENST00000393451 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
ST7-208ENST00000393451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
ST7-208ENST00000393451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.09■■■■■ 4.49
ST7-208ENST00000393451 SMARCA4P51532 1647 aa43.09■■■■■ 4.49
ST7-208ENST00000393451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.07■■■■■ 4.489e-6■■■■■ 50.1
ST7-208ENST00000393451 SMARCA2P51531 1590 aa42.98■■■■■ 4.47
ST7-208ENST00000393451 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.95■■■■■ 4.47
ST7-208ENST00000393451 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
ST7-208ENST00000393451 ABCC8Q09428 1581 aa42.85■■■■■ 4.45
ST7-208ENST00000393451 EEA1Q15075 1411 aa42.85■■■■■ 4.45
ST7-208ENST00000393451 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.76■■■■■ 4.44
ST7-208ENST00000393451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.73■■■■■ 4.43
ST7-208ENST00000393451 CEP162Q5TB80 1403 aa42.73■■■■■ 4.43
ST7-208ENST00000393451 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
ST7-208ENST00000393451 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
ST7-208ENST00000393451 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
ST7-208ENST00000393451 SOGA1O94964 1423 aa42.57■■■■■ 4.4
ST7-208ENST00000393451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.46■■■■■ 4.39
ST7-208ENST00000393451 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.43■■■■■ 4.38
ST7-208ENST00000393451 GOLGA3Q08378 1498 aa42.4■■■■■ 4.38
ST7-208ENST00000393451 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
ST7-208ENST00000393451 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.28■■■■■ 4.36
ST7-208ENST00000393451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.22■■■■■ 4.35
ST7-208ENST00000393451 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
ST7-208ENST00000393451 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.2■■■■■ 4.35
ST7-208ENST00000393451 KIF21BO75037 1637 aa42.18■■■■■ 4.34
ST7-208ENST00000393451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
ST7-208ENST00000393451 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.13■■■■■ 4.34
ST7-208ENST00000393451 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
ST7-208ENST00000393451 NEUROD1Q13562 356 aa42.02■■■■■ 4.32
ST7-208ENST00000393451 SYNJ1O43426 1573 aa41.99■■■■■ 4.31
ST7-208ENST00000393451 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
ST7-208ENST00000393451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
ST7-208ENST00000393451 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
ST7-208ENST00000393451 CLIP1P30622 1438 aa41.84■■■■■ 4.29
ST7-208ENST00000393451 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.81■■■■■ 4.28
ST7-208ENST00000393451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.81■■■■■ 4.28
ST7-208ENST00000393451 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa41.65■■■■■ 4.26
ST7-208ENST00000393451 TOP2BQ02880 1626 aa41.58■■■■■ 4.25
ST7-208ENST00000393451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.57■■■■■ 4.25
ST7-208ENST00000393451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.48■■■■■ 4.23
ST7-208ENST00000393451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.45■■■■■ 4.23
ST7-208ENST00000393451 APLP2Q06481 763 aa41.44■■■■■ 4.22
ST7-208ENST00000393451 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
ST7-208ENST00000393451 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.34■■■■■ 4.21
ST7-208ENST00000393451 PRXQ9BXM0 1461 aa41.29■■■■■ 4.2
ST7-208ENST00000393451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.2■■■■■ 4.19
ST7-208ENST00000393451 MIER1Q8N108 512 aa41.16■■■■■ 4.18
ST7-208ENST00000393451 ARAP1Q96P48 1450 aa41.14■■■■■ 4.18
ST7-208ENST00000393451 HMGXB3Q12766 1538 aa41.12■■■■■ 4.17
ST7-208ENST00000393451 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
ST7-208ENST00000393451 NCAPD3P42695 1498 aa41.01■■■■■ 4.16
ST7-208ENST00000393451 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
ST7-208ENST00000393451 MYT1Q01538 1121 aa40.94■■■■■ 4.14
ST7-208ENST00000393451 CUX1P39880 1505 aa40.94■■■■■ 4.14
ST7-208ENST00000393451 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
ST7-208ENST00000393451 KIF27Q86VH2 1401 aa40.93■■■■■ 4.14
ST7-208ENST00000393451 CUX2O14529 1486 aa40.93■■■■■ 4.14
ST7-208ENST00000393451 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
ST7-208ENST00000393451 CFTRP13569 1480 aa40.79■■■■■ 4.12
ST7-208ENST00000393451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
ST7-208ENST00000393451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.74■■■■■ 4.11
ST7-208ENST00000393451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.7■■■■■ 4.11
ST7-208ENST00000393451 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.65■■■■■ 4.1
ST7-208ENST00000393451 MAP3K1Q13233 1512 aa40.63■■■■■ 4.1
ST7-208ENST00000393451 PRDM2Q13029 1718 aa40.62■■■■■ 4.09
ST7-208ENST00000393451 TIAM1Q13009 1591 aa40.43■■■■■ 4.06
ST7-208ENST00000393451 IGF1RP08069 1367 aa40.38■■■■■ 4.05
ST7-208ENST00000393451 MAPKBP1O60336 1514 aa40.29■■■■■ 4.04
ST7-208ENST00000393451 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.27■■■■■ 4.04
ST7-208ENST00000393451 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.23■■■■■ 4.03
ST7-208ENST00000393451 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.2■■■■■ 4.03
ST7-208ENST00000393451 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.19■■■■■ 4.02
ST7-208ENST00000393451 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.18■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms