RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358022.4

TUSC1-201, Transcript of tumor suppressor candidate 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TUSC1, Length 2,052 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC1-201ENST00000358022 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.72■■■■■ 7.15
TUSC1-201ENST00000358022 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.65■■■■■ 5.86
TUSC1-201ENST00000358022 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.37■■■■■ 5.65
TUSC1-201ENST00000358022 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.47■■■■■ 5.51
TUSC1-201ENST00000358022 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.31■■■■■ 5.48
TUSC1-201ENST00000358022 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.06■■■■■ 5.44
TUSC1-201ENST00000358022 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.37■■■■■ 5.33
TUSC1-201ENST00000358022 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
TUSC1-201ENST00000358022 ABCC9O60706 1549 aa48.15■■■■■ 5.3
TUSC1-201ENST00000358022 NACADO15069 1562 aa47.87■■■■■ 5.25
TUSC1-201ENST00000358022 SCRIBQ14160 1630 aa47.73■■■■■ 5.23
TUSC1-201ENST00000358022 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.27■■■■■ 5.16
TUSC1-201ENST00000358022 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
TUSC1-201ENST00000358022 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.69■■■■■ 5.06
TUSC1-201ENST00000358022 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.54■■■■■ 5.04
TUSC1-201ENST00000358022 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.41■■■■■ 5.02
TUSC1-201ENST00000358022 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.24■■■■■ 4.99
TUSC1-201ENST00000358022 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
TUSC1-201ENST00000358022 WIZO95785 1651 aa45.94■■■■■ 4.95
TUSC1-201ENST00000358022 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.94■■■■■ 4.94
TUSC1-201ENST00000358022 SMARCA4P51532 1647 aa45.77■■■■■ 4.92
TUSC1-201ENST00000358022 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.58■■■■■ 4.89
TUSC1-201ENST00000358022 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.4■■■■■ 4.86
TUSC1-201ENST00000358022 TRIM41Q8WV44 630 aa45.17■■■■■ 4.82
TUSC1-201ENST00000358022 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.13■■■■■ 4.81
TUSC1-201ENST00000358022 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
TUSC1-201ENST00000358022 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.07■■■■■ 4.81
TUSC1-201ENST00000358022 SMARCA2P51531 1590 aa45.05■■■■■ 4.8
TUSC1-201ENST00000358022 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.97■■■■■ 4.79
TUSC1-201ENST00000358022 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.76■■■■■ 4.76
TUSC1-201ENST00000358022 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
TUSC1-201ENST00000358022 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
TUSC1-201ENST00000358022 ABCC8Q09428 1581 aa44.39■■■■■ 4.7
TUSC1-201ENST00000358022 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.32■■■■■ 4.69
TUSC1-201ENST00000358022 HMGXB3Q12766 1538 aa44.22■■■■■ 4.67
TUSC1-201ENST00000358022 NCAPD3P42695 1498 aa44.18■■■■■ 4.66
TUSC1-201ENST00000358022 HRCP23327 699 aa43.95■■■■■ 4.63
TUSC1-201ENST00000358022 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.93■■■■■ 4.62
TUSC1-201ENST00000358022 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
TUSC1-201ENST00000358022 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.89■■■■■ 4.62
TUSC1-201ENST00000358022 SYNJ1O43426 1573 aa43.77■■■■■ 4.6
TUSC1-201ENST00000358022 SOGA1O94964 1423 aa43.7■■■■■ 4.59
TUSC1-201ENST00000358022 EEA1Q15075 1411 aa43.66■■■■■ 4.58
TUSC1-201ENST00000358022 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.59■■■■■ 4.57
TUSC1-201ENST00000358022 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.51■■■■■ 4.56
TUSC1-201ENST00000358022 CFTRP13569 1480 aa43.47■■■■■ 4.55
TUSC1-201ENST00000358022 TOP2BQ02880 1626 aa43.47■■■■■ 4.55
TUSC1-201ENST00000358022 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.45■■■■■ 4.55
TUSC1-201ENST00000358022 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.42■■■■■ 4.54
TUSC1-201ENST00000358022 PRDM2Q13029 1718 aa43.38■■■■■ 4.53
TUSC1-201ENST00000358022 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.29■■■■■ 4.52
TUSC1-201ENST00000358022 CEP162Q5TB80 1403 aa43.19■■■■■ 4.5
TUSC1-201ENST00000358022 GOLGA3Q08378 1498 aa43.18■■■■■ 4.5
TUSC1-201ENST00000358022 CUX1P39880 1505 aa43.17■■■■■ 4.5
TUSC1-201ENST00000358022 KIF21BO75037 1637 aa43.13■■■■■ 4.5
TUSC1-201ENST00000358022 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.11■■■■■ 4.49
TUSC1-201ENST00000358022 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
TUSC1-201ENST00000358022 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
TUSC1-201ENST00000358022 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
TUSC1-201ENST00000358022 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.77■■■■■ 4.44
TUSC1-201ENST00000358022 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
TUSC1-201ENST00000358022 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.69■■■■■ 4.42
TUSC1-201ENST00000358022 KIF27Q86VH2 1401 aa42.67■■■■■ 4.42
TUSC1-201ENST00000358022 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
TUSC1-201ENST00000358022 PRXQ9BXM0 1461 aa42.65■■■■■ 4.42
TUSC1-201ENST00000358022 NESP48681 1621 aa42.59■■■■■ 4.41
TUSC1-201ENST00000358022 CLIP1P30622 1438 aa42.57■■■■■ 4.41
TUSC1-201ENST00000358022 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.56■■■■■ 4.4
TUSC1-201ENST00000358022 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.54■■■■■ 4.4
TUSC1-201ENST00000358022 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.46■■■■■ 4.39
TUSC1-201ENST00000358022 CUX2O14529 1486 aa42.42■■■■■ 4.38
TUSC1-201ENST00000358022 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
TUSC1-201ENST00000358022 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.34■■■■■ 4.37
TUSC1-201ENST00000358022 TOPBP1Q92547 1522 aa42.34■■■■■ 4.37
TUSC1-201ENST00000358022 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.3■■■■■ 4.36
TUSC1-201ENST00000358022 IGF1RP08069 1367 aa42.23■■■■■ 4.35
TUSC1-201ENST00000358022 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
TUSC1-201ENST00000358022 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
TUSC1-201ENST00000358022 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.16■■■■■ 4.34
TUSC1-201ENST00000358022 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.15■■■■■ 4.34
TUSC1-201ENST00000358022 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
TUSC1-201ENST00000358022 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.11■■■■■ 4.33
TUSC1-201ENST00000358022 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.1■■■■■ 4.33
TUSC1-201ENST00000358022 APLP2Q06481 763 aa42.09■■■■■ 4.33
TUSC1-201ENST00000358022 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
TUSC1-201ENST00000358022 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
TUSC1-201ENST00000358022 ARAP1Q96P48 1450 aa42.03■■■■■ 4.32
TUSC1-201ENST00000358022 WDR97A6NE52 1622 aa42.02■■■■■ 4.32
TUSC1-201ENST00000358022 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.02■■■■■ 4.32
TUSC1-201ENST00000358022 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.85■■■■■ 4.29
TUSC1-201ENST00000358022 CUL7Q14999 1698 aa41.85■■■■■ 4.29
TUSC1-201ENST00000358022 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.79■■■■■ 4.28
TUSC1-201ENST00000358022 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
TUSC1-201ENST00000358022 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.61■■■■■ 4.25
TUSC1-201ENST00000358022 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.6■■■■■ 4.25
TUSC1-201ENST00000358022 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
TUSC1-201ENST00000358022 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.57■■■■■ 4.25
TUSC1-201ENST00000358022 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.24
TUSC1-201ENST00000358022 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
TUSC1-201ENST00000358022 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.4■■■■■ 4.22
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