RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271688.10

CERS2-201, Transcript of ceramide synthase 2, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CERS2, Length 2,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CERS2-201	ENST00000271688	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		57.92	■■■■■ 6.86
CERS2-201	ENST00000271688	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.36	■■■■■ 5.49
CERS2-201	ENST00000271688	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		49.26	■■■■■ 5.48
CERS2-201	ENST00000271688	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.93	■■■■■ 5.42
CERS2-201	ENST00000271688	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		48.19	■■■■■ 5.3
CERS2-201	ENST00000271688	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	48.16	■■■■■ 5.3
CERS2-201	ENST00000271688	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		47.47	■■■■■ 5.19
CERS2-201	ENST00000271688	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		46.66	■■■■■ 5.06
CERS2-201	ENST00000271688	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.44	■■■■■ 5.02
CERS2-201	ENST00000271688	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.29	■■■■■ 5
CERS2-201	ENST00000271688	ABCC9	O60706	1549 aa		46.12	■■■■■ 4.97
CERS2-201	ENST00000271688	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.74	■■■■■ 4.91
CERS2-201	ENST00000271688	NACAD	O15069	1562 aa		45.69	■■■■■ 4.91
CERS2-201	ENST00000271688	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		45.32	■■■■■ 4.85
CERS2-201	ENST00000271688	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		45.25	■■■■■ 4.83
CERS2-201	ENST00000271688	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.25	■■■■■ 4.83
CERS2-201	ENST00000271688	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.05	■■■■■ 4.8
CERS2-201	ENST00000271688	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		44.94	■■■■■ 4.78
CERS2-201	ENST00000271688	TRIM41	Q8WV44	630 aa		44.84	■■■■■ 4.77
CERS2-201	ENST00000271688	WIZ	O95785	1651 aa		44.82	■■■■■ 4.77
CERS2-201	ENST00000271688	HRC	P23327	699 aa		44.68	■■■■■ 4.74
CERS2-201	ENST00000271688	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	44.53	■■■■■ 4.72
CERS2-201	ENST00000271688	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	44.49	■■■■■ 4.71
CERS2-201	ENST00000271688	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		44.45	■■■■■ 4.71
CERS2-201	ENST00000271688	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		44.2	■■■■■ 4.67
CERS2-201	ENST00000271688	SMARCA4	P51532	1647 aa		44.19	■■■■■ 4.66
CERS2-201	ENST00000271688	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	44.1	■■■■■ 4.65
CERS2-201	ENST00000271688	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.05	■■■■■ 4.64
CERS2-201	ENST00000271688	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.04	■■■■■ 4.64
CERS2-201	ENST00000271688	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	44	■■■■■ 4.63
CERS2-201	ENST00000271688	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	43.91	■■■■■ 4.62
CERS2-201	ENST00000271688	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.9	■■■■■ 4.62
CERS2-201	ENST00000271688	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		43.86	■■■■■ 4.61
CERS2-201	ENST00000271688	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.83	■■■■■ 4.61
CERS2-201	ENST00000271688	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.73	■■■■■ 4.59
CERS2-201	ENST00000271688	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.31	■■■■■ 4.52
CERS2-201	ENST00000271688	SOGA1	O94964	1423 aa		43.24	■■■■■ 4.51
CERS2-201	ENST00000271688	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CERS2-201	ENST00000271688	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.07	■■■■■ 4.49
CERS2-201	ENST00000271688	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
CERS2-201	ENST00000271688	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.97	■■■■■ 4.47
CERS2-201	ENST00000271688	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CERS2-201	ENST00000271688	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
CERS2-201	ENST00000271688	CEP162	Q5TB80	1403 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CERS2-201	ENST00000271688	EEA1	Q15075	1411 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CERS2-201	ENST00000271688	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CERS2-201	ENST00000271688	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CERS2-201	ENST00000271688	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
CERS2-201	ENST00000271688	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
CERS2-201	ENST00000271688	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CERS2-201	ENST00000271688	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
CERS2-201	ENST00000271688	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.4	■■■■■ 4.38
CERS2-201	ENST00000271688	KIF21B	O75037	1637 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CERS2-201	ENST00000271688	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
CERS2-201	ENST00000271688	NCAPD3	P42695	1498 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CERS2-201	ENST00000271688	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CERS2-201	ENST00000271688	HMGXB3	Q12766	1538 aa		42.26	■■■■■ 4.35
CERS2-201	ENST00000271688	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.19	■■■■■ 4.35
CERS2-201	ENST00000271688	CLIP1	P30622	1438 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CERS2-201	ENST00000271688	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.12	■■■■■ 4.33
CERS2-201	ENST00000271688	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	42.07	■■■■■ 4.33
CERS2-201	ENST00000271688	CUX1	P39880	1505 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CERS2-201	ENST00000271688	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		41.9	■■■■■ 4.3
CERS2-201	ENST00000271688	CFTR	P13569	1480 aa		41.89	■■■■■ 4.3
CERS2-201	ENST00000271688	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.77	■■■■■ 4.28
CERS2-201	ENST00000271688	APLP2	Q06481	763 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CERS2-201	ENST00000271688	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.71	■■■■■ 4.27
CERS2-201	ENST00000271688	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.68	■■■■■ 4.26
CERS2-201	ENST00000271688	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.65	■■■■■ 4.26
CERS2-201	ENST00000271688	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.56	■■■■■ 4.24
CERS2-201	ENST00000271688	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.51	■■■■■ 4.24
CERS2-201	ENST00000271688	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.48	■■■■■ 4.23
CERS2-201	ENST00000271688	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		41.44	■■■■■ 4.22
CERS2-201	ENST00000271688	CUX2	O14529	1486 aa		41.35	■■■■■ 4.21
CERS2-201	ENST00000271688	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	41.29	■■■■■ 4.2
CERS2-201	ENST00000271688	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	41.28	■■■■■ 4.2
CERS2-201	ENST00000271688	IGF1R	P08069	1367 aa		41.25	■■■■■ 4.19
CERS2-201	ENST00000271688	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		41.25	■■■■■ 4.19
CERS2-201	ENST00000271688	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CERS2-201	ENST00000271688	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.1	■■■■■ 4.17
CERS2-201	ENST00000271688	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.07	■■■■■ 4.16
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
CERS2-201	ENST00000271688	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	41	■■■■■ 4.15
CERS2-201	ENST00000271688	NES	P48681	1621 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CERS2-201	ENST00000271688	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.9	■■■■■ 4.14
CERS2-201	ENST00000271688	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
CERS2-201	ENST00000271688	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.85	■■■■■ 4.13
CERS2-201	ENST00000271688	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CERS2-201	ENST00000271688	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
CERS2-201	ENST00000271688	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
CERS2-201	ENST00000271688	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CERS2-201	ENST00000271688	NEUROD1	Q13562	356 aa		40.73	■■■■■ 4.11
CERS2-201	ENST00000271688	P3H3	Q8IVL6	736 aa		40.73	■■■■■ 4.11
CERS2-201	ENST00000271688	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CERS2-201	ENST00000271688	ITGAE	P38570	1179 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CERS2-201	ENST00000271688	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.71	■■■■■ 4.11
CERS2-201	ENST00000271688	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CERS2-201	ENST00000271688	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CERS2-201	ENST00000271688	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		40.57	■■■■■ 4.08
CERS2-201	ENST00000271688	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.56	■■■■■ 4.08

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