Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNHIT3Q15649 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ZNHIT3Q15649 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ZNHIT3Q15649 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNHIT3Q15649 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNHIT3Q15649 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZNHIT3Q15649 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZNHIT3Q15649 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZNHIT3Q15649 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZNHIT3Q15649 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZNHIT3Q15649 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZNHIT3Q15649 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNHIT3Q15649 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ZNHIT3Q15649 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNHIT3Q15649 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNHIT3Q15649 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZNHIT3Q15649 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNHIT3Q15649 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNHIT3Q15649 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNHIT3Q15649 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNHIT3Q15649 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNHIT3Q15649 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNHIT3Q15649 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNHIT3Q15649 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNHIT3Q15649 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNHIT3Q15649 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNHIT3Q15649 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNHIT3Q15649 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNHIT3Q15649 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNHIT3Q15649 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNHIT3Q15649 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNHIT3Q15649 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNHIT3Q15649 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNHIT3Q15649 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNHIT3Q15649 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNHIT3Q15649 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZNHIT3Q15649 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNHIT3Q15649 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNHIT3Q15649 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNHIT3Q15649 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNHIT3Q15649 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNHIT3Q15649 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNHIT3Q15649 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNHIT3Q15649 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNHIT3Q15649 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNHIT3Q15649 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNHIT3Q15649 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNHIT3Q15649 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNHIT3Q15649 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNHIT3Q15649 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNHIT3Q15649 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ZNHIT3Q15649 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNHIT3Q15649 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ZNHIT3Q15649 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ZNHIT3Q15649 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ZNHIT3Q15649 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNHIT3Q15649 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNHIT3Q15649 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNHIT3Q15649 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNHIT3Q15649 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNHIT3Q15649 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNHIT3Q15649 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNHIT3Q15649 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNHIT3Q15649 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNHIT3Q15649 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNHIT3Q15649 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNHIT3Q15649 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNHIT3Q15649 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNHIT3Q15649 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNHIT3Q15649 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNHIT3Q15649 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNHIT3Q15649 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNHIT3Q15649 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNHIT3Q15649 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNHIT3Q15649 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZNHIT3Q15649 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNHIT3Q15649 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNHIT3Q15649 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNHIT3Q15649 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNHIT3Q15649 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNHIT3Q15649 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNHIT3Q15649 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNHIT3Q15649 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNHIT3Q15649 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNHIT3Q15649 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNHIT3Q15649 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNHIT3Q15649 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNHIT3Q15649 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNHIT3Q15649 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNHIT3Q15649 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNHIT3Q15649 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNHIT3Q15649 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNHIT3Q15649 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNHIT3Q15649 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNHIT3Q15649 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNHIT3Q15649 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNHIT3Q15649 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNHIT3Q15649 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNHIT3Q15649 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
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