RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609571.5

ATRNL1-209, Transcript of attractin like 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATRNL1, Length 1,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1-209ENST00000609571 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.93■■■■■ 7.34
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ATRNL1-209ENST00000609571 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.94■■■■■ 5.58
ATRNL1-209ENST00000609571 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.67■■■■■ 5.54
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ATRNL1-209ENST00000609571 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.55■■■■■ 5.36
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ATRNL1-209ENST00000609571 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.05■■■■■ 5.12
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ATRNL1-209ENST00000609571 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.78■■■■■ 4.92
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ATRNL1-209ENST00000609571 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.84■■■■■ 4.77
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ATRNL1-209ENST00000609571 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.77■■■■■ 4.76
ATRNL1-209ENST00000609571 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.66■■■■■ 4.74
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ATRNL1-209ENST00000609571 EEA1Q15075 1411 aa44.42■■■■■ 4.7
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ATRNL1-209ENST00000609571 TOP2BQ02880 1626 aa44.27■■■■■ 4.68
ATRNL1-209ENST00000609571 SOGA1O94964 1423 aa44.24■■■■■ 4.67
ATRNL1-209ENST00000609571 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.23■■■■■ 4.67
ATRNL1-209ENST00000609571 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.18■■■■■ 4.66
ATRNL1-209ENST00000609571 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.02■■■■■ 4.64
ATRNL1-209ENST00000609571 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.02■■■■■ 4.64
ATRNL1-209ENST00000609571 CUX1P39880 1505 aa43.97■■■■■ 4.63
ATRNL1-209ENST00000609571 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.84■■■■■ 4.61
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ATRNL1-209ENST00000609571 NESP48681 1621 aa43.52■■■■■ 4.56
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ATRNL1-209ENST00000609571 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.39■■■■■ 4.54
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ATRNL1-209ENST00000609571 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.33■■■■■ 4.53
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ATRNL1-209ENST00000609571 IFT140Q96RY7 1462 aa42.32■■■■■ 4.36
ATRNL1-209ENST00000609571 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.3■■■■■ 4.36
ATRNL1-209ENST00000609571 PBRM1Q86U86 1689 aa42.26■■■■■ 4.36
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ATRNL1-209ENST00000609571 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
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