RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404547.5

NRG3-203, Transcript of neuregulin 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NRG3, Length 2,163 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3-203ENST00000404547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.24■■■■■ 6.91
NRG3-203ENST00000404547 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.85■■■■■ 5.57
NRG3-203ENST00000404547 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.47
NRG3-203ENST00000404547 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.96■■■■■ 5.43
NRG3-203ENST00000404547 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.06■■■■■ 5.28
NRG3-203ENST00000404547 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
NRG3-203ENST00000404547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.86■■■■■ 5.25
NRG3-203ENST00000404547 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.83■■■■■ 5.09
NRG3-203ENST00000404547 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.75■■■■■ 5.07
NRG3-203ENST00000404547 ABCC9O60706 1549 aa46.42■■■■■ 5.02
NRG3-203ENST00000404547 SCRIBQ14160 1630 aa46.28■■■■■ 5
NRG3-203ENST00000404547 NACADO15069 1562 aa46.1■■■■■ 4.97
NRG3-203ENST00000404547 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.9■■■■■ 4.94
NRG3-203ENST00000404547 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.5■■■■■ 4.88
NRG3-203ENST00000404547 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.2■■■■■ 4.83
NRG3-203ENST00000404547 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.12■■■■■ 4.81
NRG3-203ENST00000404547 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.11■■■■■ 4.81
NRG3-203ENST00000404547 HRCP23327 699 aa44.96■■■■■ 4.79
NRG3-203ENST00000404547 TRIM41Q8WV44 630 aa44.94■■■■■ 4.78
NRG3-203ENST00000404547 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.9■■■■■ 4.78
NRG3-203ENST00000404547 WIZO95785 1651 aa44.85■■■■■ 4.77
NRG3-203ENST00000404547 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
NRG3-203ENST00000404547 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.49■■■■■ 4.71
NRG3-203ENST00000404547 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.4■■■■■ 4.7
NRG3-203ENST00000404547 SMARCA4P51532 1647 aa44.4■■■■■ 4.7
NRG3-203ENST00000404547 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
NRG3-203ENST00000404547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
NRG3-203ENST00000404547 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
NRG3-203ENST00000404547 SMARCA2P51531 1590 aa44.01■■■■■ 4.64
NRG3-203ENST00000404547 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.01■■■■■ 4.64
NRG3-203ENST00000404547 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.95■■■■■ 4.63
NRG3-203ENST00000404547 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.72■■■■■ 4.59
NRG3-203ENST00000404547 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.69■■■■■ 4.58
NRG3-203ENST00000404547 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
NRG3-203ENST00000404547 ABCC8Q09428 1581 aa43.67■■■■■ 4.58
NRG3-203ENST00000404547 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.64■■■■■ 4.58
NRG3-203ENST00000404547 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
NRG3-203ENST00000404547 EEA1Q15075 1411 aa43.41■■■■■ 4.54
NRG3-203ENST00000404547 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.28■■■■■ 4.52
NRG3-203ENST00000404547 SOGA1O94964 1423 aa43.23■■■■■ 4.51
NRG3-203ENST00000404547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.5
NRG3-203ENST00000404547 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
NRG3-203ENST00000404547 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.14■■■■■ 4.5
NRG3-203ENST00000404547 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.11■■■■■ 4.49
NRG3-203ENST00000404547 CEP162Q5TB80 1403 aa43.05■■■■■ 4.48
NRG3-203ENST00000404547 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.96■■■■■ 4.47
NRG3-203ENST00000404547 GOLGA3Q08378 1498 aa42.92■■■■■ 4.46
NRG3-203ENST00000404547 SYNJ1O43426 1573 aa42.88■■■■■ 4.46
NRG3-203ENST00000404547 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
NRG3-203ENST00000404547 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.74■■■■■ 4.43
NRG3-203ENST00000404547 KIF21BO75037 1637 aa42.72■■■■■ 4.43
NRG3-203ENST00000404547 HMGXB3Q12766 1538 aa42.62■■■■■ 4.41
NRG3-203ENST00000404547 NCAPD3P42695 1498 aa42.58■■■■■ 4.41
NRG3-203ENST00000404547 TOP2BQ02880 1626 aa42.55■■■■■ 4.4
NRG3-203ENST00000404547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.44■■■■■ 4.38
NRG3-203ENST00000404547 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
NRG3-203ENST00000404547 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
NRG3-203ENST00000404547 CLIP1P30622 1438 aa42.33■■■■■ 4.37
NRG3-203ENST00000404547 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.25■■■■■ 4.35
NRG3-203ENST00000404547 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
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NRG3-203ENST00000404547 CFTRP13569 1480 aa42.14■■■■■ 4.34
NRG3-203ENST00000404547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.12■■■■■ 4.33
NRG3-203ENST00000404547 CUX1P39880 1505 aa42.05■■■■■ 4.32
NRG3-203ENST00000404547 PRXQ9BXM0 1461 aa42.04■■■■■ 4.32
NRG3-203ENST00000404547 APLP2Q06481 763 aa41.94■■■■■ 4.3
NRG3-203ENST00000404547 PRDM2Q13029 1718 aa41.92■■■■■ 4.3
NRG3-203ENST00000404547 KIF27Q86VH2 1401 aa41.92■■■■■ 4.3
NRG3-203ENST00000404547 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.68■■■■■ 4.26
NRG3-203ENST00000404547 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
NRG3-203ENST00000404547 ARAP1Q96P48 1450 aa41.65■■■■■ 4.26
NRG3-203ENST00000404547 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
NRG3-203ENST00000404547 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.47■■■■■ 4.23
NRG3-203ENST00000404547 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
NRG3-203ENST00000404547 CUX2O14529 1486 aa41.44■■■■■ 4.22
NRG3-203ENST00000404547 IGF1RP08069 1367 aa41.39■■■■■ 4.22
NRG3-203ENST00000404547 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.35■■■■■ 4.21
NRG3-203ENST00000404547 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.34■■■■■ 4.21
NRG3-203ENST00000404547 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
NRG3-203ENST00000404547 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
NRG3-203ENST00000404547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.23■■■■■ 4.19
NRG3-203ENST00000404547 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.22■■■■■ 4.19
NRG3-203ENST00000404547 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
NRG3-203ENST00000404547 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.18■■■■■ 4.18
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NRG3-203ENST00000404547 MAP3K1Q13233 1512 aa41.09■■■■■ 4.17
NRG3-203ENST00000404547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
NRG3-203ENST00000404547 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.99■■■■■ 4.15
NRG3-203ENST00000404547 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.97■■■■■ 4.15
NRG3-203ENST00000404547 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
NRG3-203ENST00000404547 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
NRG3-203ENST00000404547 TOPBP1Q92547 1522 aa40.95■■■■■ 4.15
NRG3-203ENST00000404547 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
NRG3-203ENST00000404547 TIAM1Q13009 1591 aa40.93■■■■■ 4.14
NRG3-203ENST00000404547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.9■■■■■ 4.14
NRG3-203ENST00000404547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
NRG3-203ENST00000404547 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.83■■■■■ 4.13
NRG3-203ENST00000404547 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.83■■■■■ 4.13
NRG3-203ENST00000404547 CUL7Q14999 1698 aa40.82■■■■■ 4.12
NRG3-203ENST00000404547 NESP48681 1621 aa40.8■■■■■ 4.12
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