RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329451.7

LMNTD2-201, Transcript of lamin tail domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMNTD2, Length 2,084 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2-201ENST00000329451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.13■■■■■ 7.22
LMNTD2-201ENST00000329451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.89■■■■■ 5.9
LMNTD2-201ENST00000329451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
LMNTD2-201ENST00000329451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.83■■■■■ 5.57
LMNTD2-201ENST00000329451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.66■■■■■ 5.54
LMNTD2-201ENST00000329451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.54■■■■■ 5.52
LMNTD2-201ENST00000329451 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.72■■■■■ 5.39
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCC9O60706 1549 aa48.44■■■■■ 5.34
LMNTD2-201ENST00000329451 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
LMNTD2-201ENST00000329451 NACADO15069 1562 aa48.18■■■■■ 5.3
LMNTD2-201ENST00000329451 SCRIBQ14160 1630 aa47.98■■■■■ 5.27
LMNTD2-201ENST00000329451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.56■■■■■ 5.2
LMNTD2-201ENST00000329451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
LMNTD2-201ENST00000329451 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.8■■■■■ 5.08
LMNTD2-201ENST00000329451 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.71■■■■■ 5.07
LMNTD2-201ENST00000329451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.62■■■■■ 5.05
LMNTD2-201ENST00000329451 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.53■■■■■ 5.04
LMNTD2-201ENST00000329451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
LMNTD2-201ENST00000329451 WIZO95785 1651 aa46.18■■■■■ 4.98
LMNTD2-201ENST00000329451 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.15■■■■■ 4.98
LMNTD2-201ENST00000329451 SMARCA4P51532 1647 aa46.01■■■■■ 4.96
LMNTD2-201ENST00000329451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.94■■■■■ 4.95
LMNTD2-201ENST00000329451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.69■■■■■ 4.9
LMNTD2-201ENST00000329451 TRIM41Q8WV44 630 aa45.42■■■■■ 4.86
LMNTD2-201ENST00000329451 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.38■■■■■ 4.86
LMNTD2-201ENST00000329451 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.31■■■■■ 4.84
LMNTD2-201ENST00000329451 SMARCA2P51531 1590 aa45.3■■■■■ 4.84
LMNTD2-201ENST00000329451 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
LMNTD2-201ENST00000329451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.1■■■■■ 4.81
LMNTD2-201ENST00000329451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.07■■■■■ 4.81
LMNTD2-201ENST00000329451 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
LMNTD2-201ENST00000329451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCC8Q09428 1581 aa44.64■■■■■ 4.74
LMNTD2-201ENST00000329451 NCAPD3P42695 1498 aa44.52■■■■■ 4.72
LMNTD2-201ENST00000329451 HMGXB3Q12766 1538 aa44.48■■■■■ 4.71
LMNTD2-201ENST00000329451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.25■■■■■ 4.67
LMNTD2-201ENST00000329451 EEA1Q15075 1411 aa44.06■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.04■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 SOGA1O94964 1423 aa44.04■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 SYNJ1O43426 1573 aa44.01■■■■■ 4.64
LMNTD2-201ENST00000329451 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.98■■■■■ 4.63
LMNTD2-201ENST00000329451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.82■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.82■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.8■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 CFTRP13569 1480 aa43.79■■■■■ 4.6
LMNTD2-201ENST00000329451 TOP2BQ02880 1626 aa43.73■■■■■ 4.59
LMNTD2-201ENST00000329451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
LMNTD2-201ENST00000329451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.64■■■■■ 4.58
LMNTD2-201ENST00000329451 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.58■■■■■ 4.57
LMNTD2-201ENST00000329451 GOLGA3Q08378 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
LMNTD2-201ENST00000329451 PRDM2Q13029 1718 aa43.49■■■■■ 4.55
LMNTD2-201ENST00000329451 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.47■■■■■ 4.55
LMNTD2-201ENST00000329451 HRCP23327 699 aa43.44■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 CUX1P39880 1505 aa43.44■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.42■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 CEP162Q5TB80 1403 aa43.42■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF21BO75037 1637 aa43.41■■■■■ 4.54
LMNTD2-201ENST00000329451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.36■■■■■ 4.53
LMNTD2-201ENST00000329451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.08■■■■■ 4.49
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF27Q86VH2 1401 aa43.04■■■■■ 4.48
LMNTD2-201ENST00000329451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.99■■■■■ 4.47
LMNTD2-201ENST00000329451 PRXQ9BXM0 1461 aa42.98■■■■■ 4.47
LMNTD2-201ENST00000329451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.96■■■■■ 4.47
LMNTD2-201ENST00000329451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
LMNTD2-201ENST00000329451 CLIP1P30622 1438 aa42.88■■■■■ 4.45
LMNTD2-201ENST00000329451 NESP48681 1621 aa42.82■■■■■ 4.44
LMNTD2-201ENST00000329451 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.82■■■■■ 4.44
LMNTD2-201ENST00000329451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.81■■■■■ 4.44
LMNTD2-201ENST00000329451 CUX2O14529 1486 aa42.74■■■■■ 4.43
LMNTD2-201ENST00000329451 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.72■■■■■ 4.43
LMNTD2-201ENST00000329451 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.62■■■■■ 4.41
LMNTD2-201ENST00000329451 TOPBP1Q92547 1522 aa42.61■■■■■ 4.41
LMNTD2-201ENST00000329451 IGF1RP08069 1367 aa42.61■■■■■ 4.41
LMNTD2-201ENST00000329451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.56■■■■■ 4.4
LMNTD2-201ENST00000329451 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.5■■■■■ 4.39
LMNTD2-201ENST00000329451 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.44■■■■■ 4.39
LMNTD2-201ENST00000329451 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.4■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
LMNTD2-201ENST00000329451 ARAP1Q96P48 1450 aa42.33■■■■■ 4.37
LMNTD2-201ENST00000329451 APLP2Q06481 763 aa42.27■■■■■ 4.36
LMNTD2-201ENST00000329451 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.22■■■■■ 4.35
LMNTD2-201ENST00000329451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.16■■■■■ 4.34
LMNTD2-201ENST00000329451 WDR97A6NE52 1622 aa42.16■■■■■ 4.34
LMNTD2-201ENST00000329451 CUL7Q14999 1698 aa42.09■■■■■ 4.33
LMNTD2-201ENST00000329451 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.99■■■■■ 4.31
LMNTD2-201ENST00000329451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.91■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.89■■■■■ 4.3
LMNTD2-201ENST00000329451 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
LMNTD2-201ENST00000329451 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP41.85■■■■■ 4.29
LMNTD2-201ENST00000329451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
LMNTD2-201ENST00000329451 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.73■■■■■ 4.27
LMNTD2-201ENST00000329451 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.69■■■■■ 4.27
LMNTD2-201ENST00000329451 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.68■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms