RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.88■■■■■ 7.02
UBP1-201ENST00000283628 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.96■■■■■ 5.75
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.62■■■■■ 5.53
UBP1-201ENST00000283628 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.13■■■■■ 5.46
UBP1-201ENST00000283628 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.66■■■■■ 5.38
UBP1-201ENST00000283628 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.35■■■■■ 5.33
UBP1-201ENST00000283628 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
UBP1-201ENST00000283628 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.79■■■■■ 5.24
UBP1-201ENST00000283628 ABCC9O60706 1549 aa47.58■■■■■ 5.21
UBP1-201ENST00000283628 NACADO15069 1562 aa47.28■■■■■ 5.16
UBP1-201ENST00000283628 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.15■■■■■ 5.14
UBP1-201ENST00000283628 SCRIBQ14160 1630 aa47.03■■■■■ 5.12
UBP1-201ENST00000283628 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.7■■■■■ 5.07
UBP1-201ENST00000283628 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
UBP1-201ENST00000283628 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.88■■■■■ 4.93
UBP1-201ENST00000283628 HRCP23327 699 aa45.87■■■■■ 4.93
UBP1-201ENST00000283628 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.74■■■■■ 4.91
UBP1-201ENST00000283628 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.6■■■■■ 4.89
UBP1-201ENST00000283628 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.55■■■■■ 4.88
UBP1-201ENST00000283628 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.53■■■■■ 4.88
UBP1-201ENST00000283628 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
UBP1-201ENST00000283628 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.37■■■■■ 4.85
UBP1-201ENST00000283628 WIZO95785 1651 aa45.22■■■■■ 4.83
UBP1-201ENST00000283628 TRIM41Q8WV44 630 aa45.13■■■■■ 4.81
UBP1-201ENST00000283628 SMARCA4P51532 1647 aa45.11■■■■■ 4.81
UBP1-201ENST00000283628 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.03■■■■■ 4.8
UBP1-201ENST00000283628 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
UBP1-201ENST00000283628 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
UBP1-201ENST00000283628 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
UBP1-201ENST00000283628 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.51■■■■■ 4.72
UBP1-201ENST00000283628 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
UBP1-201ENST00000283628 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
UBP1-201ENST00000283628 SMARCA2P51531 1590 aa44.36■■■■■ 4.69
UBP1-201ENST00000283628 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.32■■■■■ 4.69
UBP1-201ENST00000283628 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.66
UBP1-201ENST00000283628 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.18■■■■■ 4.66
UBP1-201ENST00000283628 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
UBP1-201ENST00000283628 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.88■■■■■ 4.62
UBP1-201ENST00000283628 ABCC8Q09428 1581 aa43.8■■■■■ 4.6
UBP1-201ENST00000283628 HMGXB3Q12766 1538 aa43.66■■■■■ 4.58
UBP1-201ENST00000283628 NCAPD3P42695 1498 aa43.65■■■■■ 4.58
UBP1-201ENST00000283628 EEA1Q15075 1411 aa43.54■■■■■ 4.56
UBP1-201ENST00000283628 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.49■■■■■ 4.55
UBP1-201ENST00000283628 SOGA1O94964 1423 aa43.38■■■■■ 4.54
UBP1-201ENST00000283628 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.36■■■■■ 4.53
UBP1-201ENST00000283628 CEP162Q5TB80 1403 aa43.33■■■■■ 4.53
UBP1-201ENST00000283628 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.21■■■■■ 4.51
UBP1-201ENST00000283628 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.12■■■■■ 4.49
UBP1-201ENST00000283628 GOLGA3Q08378 1498 aa43.11■■■■■ 4.49
UBP1-201ENST00000283628 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.07■■■■■ 4.49
UBP1-201ENST00000283628 SYNJ1O43426 1573 aa43.07■■■■■ 4.49
UBP1-201ENST00000283628 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
UBP1-201ENST00000283628 KIF21BO75037 1637 aa42.92■■■■■ 4.46
UBP1-201ENST00000283628 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
UBP1-201ENST00000283628 CFTRP13569 1480 aa42.91■■■■■ 4.46
UBP1-201ENST00000283628 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.88■■■■■ 4.46
UBP1-201ENST00000283628 TOP2BQ02880 1626 aa42.81■■■■■ 4.44
UBP1-201ENST00000283628 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.76■■■■■ 4.44
UBP1-201ENST00000283628 PRDM2Q13029 1718 aa42.73■■■■■ 4.43
UBP1-201ENST00000283628 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.59■■■■■ 4.41
UBP1-201ENST00000283628 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.4
UBP1-201ENST00000283628 CUX1P39880 1505 aa42.54■■■■■ 4.4
UBP1-201ENST00000283628 CLIP1P30622 1438 aa42.52■■■■■ 4.4
UBP1-201ENST00000283628 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.42■■■■■ 4.38
UBP1-201ENST00000283628 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.39■■■■■ 4.38
UBP1-201ENST00000283628 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.24■■■■■ 4.35
UBP1-201ENST00000283628 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
UBP1-201ENST00000283628 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
UBP1-201ENST00000283628 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.14■■■■■ 4.34
UBP1-201ENST00000283628 PRXQ9BXM0 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
UBP1-201ENST00000283628 APLP2Q06481 763 aa42.1■■■■■ 4.33
UBP1-201ENST00000283628 KIF27Q86VH2 1401 aa42.05■■■■■ 4.32
UBP1-201ENST00000283628 NESP48681 1621 aa42.04■■■■■ 4.32
UBP1-201ENST00000283628 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.04■■■■■ 4.32
UBP1-201ENST00000283628 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.94■■■■■ 4.3
UBP1-201ENST00000283628 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
UBP1-201ENST00000283628 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
UBP1-201ENST00000283628 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.9■■■■■ 4.3
UBP1-201ENST00000283628 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
UBP1-201ENST00000283628 ARAP1Q96P48 1450 aa41.85■■■■■ 4.29
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.83■■■■■ 4.29
UBP1-201ENST00000283628 CUX2O14529 1486 aa41.8■■■■■ 4.28
UBP1-201ENST00000283628 TOPBP1Q92547 1522 aa41.78■■■■■ 4.28
UBP1-201ENST00000283628 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
UBP1-201ENST00000283628 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
UBP1-201ENST00000283628 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
UBP1-201ENST00000283628 NEUROD1Q13562 356 aa41.68■■■■■ 4.26
UBP1-201ENST00000283628 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.67■■■■■ 4.26
UBP1-201ENST00000283628 IGF1RP08069 1367 aa41.64■■■■■ 4.26
UBP1-201ENST00000283628 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
UBP1-201ENST00000283628 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
UBP1-201ENST00000283628 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.58■■■■■ 4.25
UBP1-201ENST00000283628 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.57■■■■■ 4.25
UBP1-201ENST00000283628 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.52■■■■■ 4.24
UBP1-201ENST00000283628 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.52■■■■■ 4.24
UBP1-201ENST00000283628 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.48■■■■■ 4.23
UBP1-201ENST00000283628 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
UBP1-201ENST00000283628 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.42■■■■■ 4.22
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