Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HLA-DPA1P20036 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HLA-DPA1P20036 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HLA-DPA1P20036 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DPA1P20036 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DPA1P20036 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HLA-DPA1P20036 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HLA-DPA1P20036 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HLA-DPA1P20036 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HLA-DPA1P20036 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HLA-DPA1P20036 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HLA-DPA1P20036 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HLA-DPA1P20036 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HLA-DPA1P20036 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-DPA1P20036 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HLA-DPA1P20036 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DPA1P20036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DPA1P20036 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DPA1P20036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DPA1P20036 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HLA-DPA1P20036 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HLA-DPA1P20036 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HLA-DPA1P20036 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HLA-DPA1P20036 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DPA1P20036 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HLA-DPA1P20036 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HLA-DPA1P20036 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HLA-DPA1P20036 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HLA-DPA1P20036 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms