Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HLA-DPA1P20036 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HLA-DPA1P20036 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
HLA-DPA1P20036 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HLA-DPA1P20036 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HLA-DPA1P20036 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
HLA-DPA1P20036 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HLA-DPA1P20036 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HLA-DPA1P20036 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HLA-DPA1P20036 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HLA-DPA1P20036 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HLA-DPA1P20036 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HLA-DPA1P20036 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
HLA-DPA1P20036 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HLA-DPA1P20036 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HLA-DPA1P20036 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HLA-DPA1P20036 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
HLA-DPA1P20036 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
HLA-DPA1P20036 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
HLA-DPA1P20036 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HLA-DPA1P20036 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HLA-DPA1P20036 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HLA-DPA1P20036 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HLA-DPA1P20036 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HLA-DPA1P20036 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HLA-DPA1P20036 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HLA-DPA1P20036 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HLA-DPA1P20036 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
HLA-DPA1P20036 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HLA-DPA1P20036 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HLA-DPA1P20036 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HLA-DPA1P20036 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HLA-DPA1P20036 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
HLA-DPA1P20036 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HLA-DPA1P20036 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HLA-DPA1P20036 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLA-DPA1P20036 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HLA-DPA1P20036 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLA-DPA1P20036 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLA-DPA1P20036 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
HLA-DPA1P20036 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HLA-DPA1P20036 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HLA-DPA1P20036 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
HLA-DPA1P20036 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HLA-DPA1P20036 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HLA-DPA1P20036 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HLA-DPA1P20036 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HLA-DPA1P20036 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HLA-DPA1P20036 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
HLA-DPA1P20036 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HLA-DPA1P20036 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HLA-DPA1P20036 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HLA-DPA1P20036 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HLA-DPA1P20036 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HLA-DPA1P20036 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
HLA-DPA1P20036 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HLA-DPA1P20036 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HLA-DPA1P20036 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HLA-DPA1P20036 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HLA-DPA1P20036 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HLA-DPA1P20036 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HLA-DPA1P20036 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HLA-DPA1P20036 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HLA-DPA1P20036 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HLA-DPA1P20036 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HLA-DPA1P20036 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HLA-DPA1P20036 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HLA-DPA1P20036 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HLA-DPA1P20036 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HLA-DPA1P20036 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HLA-DPA1P20036 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HLA-DPA1P20036 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HLA-DPA1P20036 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HLA-DPA1P20036 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HLA-DPA1P20036 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HLA-DPA1P20036 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HLA-DPA1P20036 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HLA-DPA1P20036 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HLA-DPA1P20036 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HLA-DPA1P20036 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HLA-DPA1P20036 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HLA-DPA1P20036 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HLA-DPA1P20036 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HLA-DPA1P20036 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HLA-DPA1P20036 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HLA-DPA1P20036 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HLA-DPA1P20036 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HLA-DPA1P20036 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HLA-DPA1P20036 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HLA-DPA1P20036 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLA-DPA1P20036 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLA-DPA1P20036 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HLA-DPA1P20036 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HLA-DPA1P20036 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
HLA-DPA1P20036 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HLA-DPA1P20036 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HLA-DPA1P20036 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HLA-DPA1P20036 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HLA-DPA1P20036 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HLA-DPA1P20036 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms