Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 OBSCN-213ENST00000636476 7835 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 RPAP1-207ENST00000565035 601 ntTSL 413□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 TRAPPC9-209ENST00000521167 545 ntTSL 412.98□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SNX1-212ENST00000560861 850 ntTSL 312.94□□□□□ -0.348e-16■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 FAF1-205ENST00000494400 2127 ntTSL 211.42□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SNX1-202ENST00000380285 8119 ntTSL 1 (best)10.05□□□□□ -0.88e-16■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.888e-16■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 DNMT1-222ENST00000590619 231 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.942e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 58.81□□□□□ -13e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.162e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.182e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CAMKMT-206ENST00000428993 526 ntTSL 37.31□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.252e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 SEC14L1-210ENST00000568056 424 ntTSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.362e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 C5orf24-205ENST00000507390 269 ntTSL 26.34□□□□□ -1.392e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CCNH-208ENST00000510921 549 ntTSL 45.73□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.532e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.542e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 CCNH-205ENST00000505587 1940 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.592e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 29.9
FMR1Q06787 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.395e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-204ENST00000562169 466 ntTSL 323.18■■□□□ 1.35e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-210ENST00000568849 790 ntTSL 318.01■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.065e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-206ENST00000563468 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 GSPT1-208ENST00000565267 1864 ntTSL 59.25□□□□□ -0.935e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 BCOR-202ENST00000378444 6358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 29.8
FMR1Q06787 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 527.06■■□□□ 1.921e-7■■■■■ 29.7
FMR1Q06787 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 222.54■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 29.7
FMR1Q06787 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 29.7
FMR1Q06787 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.014e-11■■■■■ 29.7
FMR1Q06787 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 29.7
FMR1Q06787 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)8.75□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 29.7
FMR1Q06787 MMS19-206ENST00000434392 882 ntTSL 519.84■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 SYMPK-203ENST00000593899 558 ntTSL 415.46■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 SYMPK-216ENST00000601582 544 ntTSL 415.04■□□□□ -01e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 SYMPK-206ENST00000596518 592 ntTSL 512.96□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 321.77■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-210ENST00000491815 658 ntTSL 214.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-205ENST00000407521 513 ntTSL 414.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-212ENST00000502727 582 ntTSL 412.56□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-211ENST00000502724 541 ntTSL 412.21□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 RBBP4-218ENST00000527118 700 ntTSL 319.95■□□□□ 0.785e-9■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 RBBP4-205ENST00000445722 580 ntTSL 218.16■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 RBBP4-215ENST00000524393 583 ntTSL 315.86■□□□□ 0.135e-9■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 RBBP4-203ENST00000401893 762 ntTSL 215.86■□□□□ 0.135e-9■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 RBBP4-217ENST00000526193 568 ntTSL 410.8□□□□□ -0.685e-9■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 RBBP4-211ENST00000477563 544 ntTSL 510.16□□□□□ -0.785e-9■■■■■ 29.6
FMR1Q06787 NUP188-208ENST00000491502 534 ntTSL 316.36■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 29.5
FMR1Q06787 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.35e-8■■■■■ 29.5
FMR1Q06787 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.315e-8■■■■■ 29.5
FMR1Q06787 ANK1-213ENST00000524069 729 ntTSL 310.77□□□□□ -0.692e-7■■■■■ 29.5
FMR1Q06787 FAM49B-217ENST00000520254 579 ntTSL 423.4■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-208ENST00000518344 554 ntTSL 323.25■■□□□ 1.312e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-216ENST00000520204 699 ntTSL 521.02■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-211ENST00000519070 561 ntTSL 319.98■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 58.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 57.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.259e-10■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 JADE1-205ENST00000504089 567 ntTSL 413.44□□□□□ -0.269e-10■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 JADE1-201ENST00000226319 5772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.319e-10■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 JADE1-203ENST00000452328 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.919e-10■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 RNF213-210ENST00000560083 4212 ntTSL 27.38□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 29.4
FMR1Q06787 KIAA0100-206ENST00000577580 581 ntTSL 312.88□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 KIAA0100-214ENST00000582901 509 ntTSL 39.94□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 29.3
FMR1Q06787 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 29.3
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 64.7 ms