Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
C8orf49Q96NF6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C8orf49Q96NF6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms