RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559432.5

CRNDE-206, Transcript of colorectal neoplasia differentially expressed, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CRNDE, Length 587 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNDE-206ENST00000559432 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.18■■■■■ 7.54
CRNDE-206ENST00000559432 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.57■■■■■ 6.49
CRNDE-206ENST00000559432 ABCC9O60706 1549 aa55.11■■■■■ 6.41
CRNDE-206ENST00000559432 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.69■■■■■ 6.03
CRNDE-206ENST00000559432 NACADO15069 1562 aa52.44■■■■■ 5.99
CRNDE-206ENST00000559432 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.36■■■■■ 5.97
CRNDE-206ENST00000559432 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.88■■■■■ 5.9
CRNDE-206ENST00000559432 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.64■■■■■ 5.86
CRNDE-206ENST00000559432 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.4■■■■■ 5.82
CRNDE-206ENST00000559432 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.39■■■■■ 5.82
CRNDE-206ENST00000559432 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.38■■■■■ 5.82
CRNDE-206ENST00000559432 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.15■■■■■ 5.78
CRNDE-206ENST00000559432 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.05■■■■■ 5.76
CRNDE-206ENST00000559432 SCRIBQ14160 1630 aa50.69■■■■■ 5.7
CRNDE-206ENST00000559432 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.51■■■■■ 5.68
CRNDE-206ENST00000559432 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.81■■■■■ 5.56
CRNDE-206ENST00000559432 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.78■■■■■ 5.56
CRNDE-206ENST00000559432 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.59■■■■■ 5.53
CRNDE-206ENST00000559432 NCAPD3P42695 1498 aa48.39■■■■■ 5.34
CRNDE-206ENST00000559432 SMARCA4P51532 1647 aa48.39■■■■■ 5.34
CRNDE-206ENST00000559432 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.32■■■■■ 5.33
CRNDE-206ENST00000559432 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.26■■■■■ 5.32
CRNDE-206ENST00000559432 SMARCA2P51531 1590 aa48.25■■■■■ 5.31
CRNDE-206ENST00000559432 HMGXB3Q12766 1538 aa48.09■■■■■ 5.29
CRNDE-206ENST00000559432 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
CRNDE-206ENST00000559432 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.9■■■■■ 5.26
CRNDE-206ENST00000559432 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.9■■■■■ 5.26
CRNDE-206ENST00000559432 ERCC6Q03468 1493 aa47.6■■■■■ 5.21
CRNDE-206ENST00000559432 NESP48681 1621 aa47.45■■■■■ 5.19
CRNDE-206ENST00000559432 WIZO95785 1651 aa47.35■■■■■ 5.17
CRNDE-206ENST00000559432 CUX2O14529 1486 aa47.29■■■■■ 5.16
CRNDE-206ENST00000559432 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.24■■■■■ 5.15
CRNDE-206ENST00000559432 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
CRNDE-206ENST00000559432 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.99■■■■■ 5.11
CRNDE-206ENST00000559432 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.98■■■■■ 5.11
CRNDE-206ENST00000559432 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
CRNDE-206ENST00000559432 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.84■■■■■ 5.09
CRNDE-206ENST00000559432 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
CRNDE-206ENST00000559432 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.66■■■■■ 5.06
CRNDE-206ENST00000559432 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.53■■■■■ 5.04
CRNDE-206ENST00000559432 CFTRP13569 1480 aa46.52■■■■■ 5.04
CRNDE-206ENST00000559432 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.46■■■■■ 5.03
CRNDE-206ENST00000559432 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.44■■■■■ 5.02
CRNDE-206ENST00000559432 WDR62O43379 1518 aa46.36■■■■■ 5.01
CRNDE-206ENST00000559432 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.27■■■■■ 5
CRNDE-206ENST00000559432 PRDM2Q13029 1718 aa46.06■■■■■ 4.96
CRNDE-206ENST00000559432 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
CRNDE-206ENST00000559432 TOPBP1Q92547 1522 aa45.6■■■■■ 4.89
CRNDE-206ENST00000559432 ABCC8Q09428 1581 aa45.59■■■■■ 4.89
CRNDE-206ENST00000559432 IFT140Q96RY7 1462 aa45.51■■■■■ 4.88
CRNDE-206ENST00000559432 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.5■■■■■ 4.87
CRNDE-206ENST00000559432 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
CRNDE-206ENST00000559432 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.33■■■■■ 4.85
CRNDE-206ENST00000559432 OSCARQ8IYS5 282 aa45.25■■■■■ 4.83
CRNDE-206ENST00000559432 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.17■■■■■ 4.82
CRNDE-206ENST00000559432 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
CRNDE-206ENST00000559432 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.12■■■■■ 4.81
CRNDE-206ENST00000559432 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.01■■■■■ 4.82e-8■■■■□ 22.7
CRNDE-206ENST00000559432 SOGA1O94964 1423 aa45.01■■■■■ 4.8
CRNDE-206ENST00000559432 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.98■■■■■ 4.79
CRNDE-206ENST00000559432 CUX1P39880 1505 aa44.98■■■■■ 4.79
CRNDE-206ENST00000559432 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.97■■■■■ 4.79
CRNDE-206ENST00000559432 TRIM41Q8WV44 630 aa44.89■■■■■ 4.78
CRNDE-206ENST00000559432 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
CRNDE-206ENST00000559432 WDR97A6NE52 1622 aa44.75■■■■■ 4.75
CRNDE-206ENST00000559432 FBLN2P98095 1184 aa44.69■■■■■ 4.74
CRNDE-206ENST00000559432 CHD1O14646 1710 aa44.67■■■■■ 4.74
CRNDE-206ENST00000559432 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.58■■■■■ 4.73
CRNDE-206ENST00000559432 GRIN2BQ13224 1484 aa44.55■■■■■ 4.72
CRNDE-206ENST00000559432 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.54■■■■■ 4.72
CRNDE-206ENST00000559432 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.54■■■■■ 4.72
CRNDE-206ENST00000559432 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.54■■■■■ 4.72
CRNDE-206ENST00000559432 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
CRNDE-206ENST00000559432 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.71
CRNDE-206ENST00000559432 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.48■■■■■ 4.71
CRNDE-206ENST00000559432 ARHGEF11O15085 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
CRNDE-206ENST00000559432 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.46■■■■■ 4.71
CRNDE-206ENST00000559432 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
CRNDE-206ENST00000559432 TOP2BQ02880 1626 aa44.42■■■■■ 4.7
CRNDE-206ENST00000559432 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.4■■■■■ 4.7
CRNDE-206ENST00000559432 PBRM1Q86U86 1689 aa44.36■■■■■ 4.69
CRNDE-206ENST00000559432 SYNJ1O43426 1573 aa44.36■■■■■ 4.69
CRNDE-206ENST00000559432 SYNJ2O15056 1496 aa44.34■■■■■ 4.69
CRNDE-206ENST00000559432 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.34■■■■■ 4.69
CRNDE-206ENST00000559432 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.19■■■■■ 4.66
CRNDE-206ENST00000559432 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.15■■■■■ 4.66
CRNDE-206ENST00000559432 ARAP1Q96P48 1450 aa44.06■■■■■ 4.64
CRNDE-206ENST00000559432 ADAMTS12P58397 1594 aa43.99■■■■■ 4.63
CRNDE-206ENST00000559432 GRIN2AQ12879 1464 aa43.96■■■■■ 4.63
CRNDE-206ENST00000559432 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.94■■■■■ 4.63
CRNDE-206ENST00000559432 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.92■■■■■ 4.62
CRNDE-206ENST00000559432 NUP160Q12769 1436 aa43.78■■■■■ 4.6
CRNDE-206ENST00000559432 CEP170Q5SW79 1584 aa43.75■■■■■ 4.59
CRNDE-206ENST00000559432 KIF27Q86VH2 1401 aa43.62■■■■■ 4.57
CRNDE-206ENST00000559432 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
CRNDE-206ENST00000559432 SHROOM2Q13796 1616 aa43.51■■■■■ 4.56
CRNDE-206ENST00000559432 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.5■■■■■ 4.55
CRNDE-206ENST00000559432 IGF1RP08069 1367 aa43.49■■■■■ 4.55
CRNDE-206ENST00000559432 CUL7Q14999 1698 aa43.42■■■■■ 4.54
CRNDE-206ENST00000559432 JPH4Q96JJ6 628 aa43.37■■■■■ 4.53
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