RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523211.5

NKAIN3-202, Transcript of sodium/potassium transporting ATPase interacting 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene NKAIN3, Length 1,988 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3-202ENST00000523211 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.46■■■■■ 6.31
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NKAIN3-202ENST00000523211 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
NKAIN3-202ENST00000523211 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.28■■■■■ 4.84
NKAIN3-202ENST00000523211 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.97■■■■■ 4.79
NKAIN3-202ENST00000523211 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.65■■■■■ 4.74
NKAIN3-202ENST00000523211 NACADO15069 1562 aa44.64■■■■■ 4.74
NKAIN3-202ENST00000523211 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.44■■■■■ 4.7
NKAIN3-202ENST00000523211 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.08■■■■■ 4.65
NKAIN3-202ENST00000523211 SCRIBQ14160 1630 aa43.93■■■■■ 4.62
NKAIN3-202ENST00000523211 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.6■■■■■ 4.57
NKAIN3-202ENST00000523211 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.13■■■■■ 4.5
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NKAIN3-202ENST00000523211 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
NKAIN3-202ENST00000523211 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.08■■■■■ 4.33
NKAIN3-202ENST00000523211 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.32
NKAIN3-202ENST00000523211 SMARCA4P51532 1647 aa42.03■■■■■ 4.32
NKAIN3-202ENST00000523211 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
NKAIN3-202ENST00000523211 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
NKAIN3-202ENST00000523211 WIZO95785 1651 aa41.73■■■■■ 4.27
NKAIN3-202ENST00000523211 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.48■■■■■ 4.23
NKAIN3-202ENST00000523211 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.47■■■■■ 4.23
NKAIN3-202ENST00000523211 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.45■■■■■ 4.23
NKAIN3-202ENST00000523211 SMARCA2P51531 1590 aa41.42■■■■■ 4.22
NKAIN3-202ENST00000523211 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
NKAIN3-202ENST00000523211 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
NKAIN3-202ENST00000523211 NCAPD3P42695 1498 aa41.19■■■■■ 4.19
NKAIN3-202ENST00000523211 HMGXB3Q12766 1538 aa41.1■■■■■ 4.17
NKAIN3-202ENST00000523211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.01■■■■■ 4.16
NKAIN3-202ENST00000523211 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.81■■■■■ 4.12
NKAIN3-202ENST00000523211 CFTRP13569 1480 aa40.12■■■■■ 4.01
NKAIN3-202ENST00000523211 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.11■■■■■ 4.01
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NKAIN3-202ENST00000523211 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.93■■■■□ 3.98
NKAIN3-202ENST00000523211 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.87■■■■□ 3.97
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCC8Q09428 1581 aa39.8■■■■□ 3.96
NKAIN3-202ENST00000523211 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.7■■■■□ 3.95
NKAIN3-202ENST00000523211 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.62■■■■□ 3.93
NKAIN3-202ENST00000523211 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.57■■■■□ 3.93
NKAIN3-202ENST00000523211 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.56■■■■□ 3.92
NKAIN3-202ENST00000523211 TRIM41Q8WV44 630 aa39.55■■■■□ 3.92
NKAIN3-202ENST00000523211 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.51■■■■□ 3.92
NKAIN3-202ENST00000523211 SYNJ1O43426 1573 aa39.46■■■■□ 3.91
NKAIN3-202ENST00000523211 CUX1P39880 1505 aa39.38■■■■□ 3.9
NKAIN3-202ENST00000523211 ERCC6Q03468 1493 aa39.35■■■■□ 3.89
NKAIN3-202ENST00000523211 TOP2BQ02880 1626 aa39.32■■■■□ 3.88
NKAIN3-202ENST00000523211 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.29■■■■□ 3.88
NKAIN3-202ENST00000523211 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
NKAIN3-202ENST00000523211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.22■■■■□ 3.87
NKAIN3-202ENST00000523211 TOPBP1Q92547 1522 aa39.2■■■■□ 3.87
NKAIN3-202ENST00000523211 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.17■■■■□ 3.86
NKAIN3-202ENST00000523211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.06■■■■□ 3.84
NKAIN3-202ENST00000523211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
NKAIN3-202ENST00000523211 WDR62O43379 1518 aa39■■■■□ 3.83
NKAIN3-202ENST00000523211 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
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NKAIN3-202ENST00000523211 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.82
NKAIN3-202ENST00000523211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.86■■■■□ 3.81
NKAIN3-202ENST00000523211 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.8■■■■□ 3.8
NKAIN3-202ENST00000523211 CUX2O14529 1486 aa38.73■■■■□ 3.79
NKAIN3-202ENST00000523211 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.66■■■■□ 3.78
NKAIN3-202ENST00000523211 WDR97A6NE52 1622 aa38.64■■■■□ 3.78
NKAIN3-202ENST00000523211 KIF27Q86VH2 1401 aa38.6■■■■□ 3.77
NKAIN3-202ENST00000523211 EEA1Q15075 1411 aa38.58■■■■□ 3.77
NKAIN3-202ENST00000523211 IFT140Q96RY7 1462 aa38.58■■■■□ 3.77
NKAIN3-202ENST00000523211 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.53■■■■□ 3.76
NKAIN3-202ENST00000523211 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.5■■■■□ 3.75
NKAIN3-202ENST00000523211 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
NKAIN3-202ENST00000523211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.43■■■■□ 3.74
NKAIN3-202ENST00000523211 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.42■■■■□ 3.74
NKAIN3-202ENST00000523211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.4■■■■□ 3.74
NKAIN3-202ENST00000523211 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.38■■■■□ 3.73
NKAIN3-202ENST00000523211 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.37■■■■□ 3.73
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NKAIN3-202ENST00000523211 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.31■■■■□ 3.72
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NKAIN3-202ENST00000523211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.2■■■■□ 3.71
NKAIN3-202ENST00000523211 KIF21BO75037 1637 aa38.18■■■■□ 3.7
NKAIN3-202ENST00000523211 PRXQ9BXM0 1461 aa38.17■■■■□ 3.7
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NKAIN3-202ENST00000523211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.14■■■■□ 3.7
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NKAIN3-202ENST00000523211 CUL7Q14999 1698 aa38.1■■■■□ 3.69
NKAIN3-202ENST00000523211 GOLGA3Q08378 1498 aa38.08■■■■□ 3.69
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NKAIN3-202ENST00000523211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.93■■■■□ 3.66
NKAIN3-202ENST00000523211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
NKAIN3-202ENST00000523211 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.81■■■■□ 3.64
NKAIN3-202ENST00000523211 SYNJ2O15056 1496 aa37.78■■■■□ 3.64
NKAIN3-202ENST00000523211 FBLN2P98095 1184 aa37.77■■■■□ 3.64
NKAIN3-202ENST00000523211 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
NKAIN3-202ENST00000523211 GRIN2AQ12879 1464 aa37.71■■■■□ 3.63
NKAIN3-202ENST00000523211 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
NKAIN3-202ENST00000523211 CHD1O14646 1710 aa37.63■■■■□ 3.62
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