RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.76■■■■■ 7.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC9O60706 1549 aa58.42■■■■■ 6.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.14■■■■■ 6.9
CAPNS1-211ENST00000590874 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.46■■■■■ 6.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NACADO15069 1562 aa55.03■■■■■ 6.4
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55■■■■■ 6.4
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.71■■■■■ 6.35
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.36■■■■■ 6.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.22■■■■■ 6.27
CAPNS1-211ENST00000590874 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.18■■■■■ 6.26
CAPNS1-211ENST00000590874 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.91■■■■■ 6.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.65■■■■■ 6.18
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.46■■■■■ 6.15
CAPNS1-211ENST00000590874 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.11■■■■■ 6.09
CAPNS1-211ENST00000590874 SCRIBQ14160 1630 aa53.03■■■■■ 6.08
CAPNS1-211ENST00000590874 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.73■■■■■ 6.03
CAPNS1-211ENST00000590874 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.63■■■■■ 6.01
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
CAPNS1-211ENST00000590874 NCAPD3P42695 1498 aa50.84■■■■■ 5.73
CAPNS1-211ENST00000590874 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.67■■■■■ 5.7
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.58■■■■■ 5.69
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCA4P51532 1647 aa50.55■■■■■ 5.68
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCA2P51531 1590 aa50.47■■■■■ 5.67
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGXB3Q12766 1538 aa50.43■■■■■ 5.66
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC6Q03468 1493 aa50.41■■■■■ 5.66
CAPNS1-211ENST00000590874 CUX2O14529 1486 aa50.39■■■■■ 5.66
CAPNS1-211ENST00000590874 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.26■■■■■ 5.64
CAPNS1-211ENST00000590874 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.15■■■■■ 5.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NESP48681 1621 aa50.14■■■■■ 5.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.06■■■■■ 5.6
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.93■■■■■ 5.58
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.7■■■■■ 5.55
CAPNS1-211ENST00000590874 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.65■■■■■ 5.54
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.42■■■■■ 5.5
CAPNS1-211ENST00000590874 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.42■■■■■ 5.5
CAPNS1-211ENST00000590874 WIZO95785 1651 aa49.29■■■■■ 5.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.28■■■■■ 5.48
CAPNS1-211ENST00000590874 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.04■■■■■ 5.44
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR62O43379 1518 aa48.93■■■■■ 5.42
CAPNS1-211ENST00000590874 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.82■■■■■ 5.41
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.8■■■■■ 5.4
CAPNS1-211ENST00000590874 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.74■■■■■ 5.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CFTRP13569 1480 aa48.69■■■■■ 5.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.66■■■■■ 5.38
CAPNS1-211ENST00000590874 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.37■■■■■ 5.33
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM41Q8WV44 630 aa48.3■■■■■ 5.32
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.12■■■■■ 5.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM2Q13029 1718 aa48.08■■■■■ 5.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OSCARQ8IYS5 282 aa48.03■■■■■ 5.28
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT140Q96RY7 1462 aa47.82■■■■■ 5.25
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
CAPNS1-211ENST00000590874 TOPBP1Q92547 1522 aa47.8■■■■■ 5.24
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC8Q09428 1581 aa47.61■■■■■ 5.21
CAPNS1-211ENST00000590874 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.58■■■■■ 5.21
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.46■■■■■ 5.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.46■■■■■ 5.19
CAPNS1-211ENST00000590874 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.46■■■■■ 5.19
CAPNS1-211ENST00000590874 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.38■■■■■ 5.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.33■■■■■ 5.178e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF11O15085 1522 aa47.31■■■■■ 5.16
CAPNS1-211ENST00000590874 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.14■■■■■ 5.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD1O14646 1710 aa47.14■■■■■ 5.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SOGA1O94964 1423 aa47.06■■■■■ 5.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FBLN2P98095 1184 aa47.03■■■■■ 5.12
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.02■■■■■ 5.12
CAPNS1-211ENST00000590874 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.98■■■■■ 5.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.95■■■■■ 5.11
CAPNS1-211ENST00000590874 CUX1P39880 1505 aa46.92■■■■■ 5.1
CAPNS1-211ENST00000590874 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.86■■■■■ 5.09
CAPNS1-211ENST00000590874 ARAP1Q96P48 1450 aa46.85■■■■■ 5.09
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR97A6NE52 1622 aa46.83■■■■■ 5.09
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.69■■■■■ 5.06
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIN2BQ13224 1484 aa46.67■■■■■ 5.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.66■■■■■ 5.06
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNJ1O43426 1573 aa46.57■■■■■ 5.05
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNJ2O15056 1496 aa46.55■■■■■ 5.04
CAPNS1-211ENST00000590874 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
CAPNS1-211ENST00000590874 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.48■■■■■ 5.03
CAPNS1-211ENST00000590874 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
CAPNS1-211ENST00000590874 PBRM1Q86U86 1689 aa46.44■■■■■ 5.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.43■■■■■ 5.02
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.38■■■■■ 5.01
CAPNS1-211ENST00000590874 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIN2AQ12879 1464 aa46.09■■■■■ 4.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TOP2BQ02880 1626 aa46.07■■■■■ 4.97
CAPNS1-211ENST00000590874 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.07■■■■■ 4.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS12P58397 1594 aa46.05■■■■■ 4.96
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP160Q12769 1436 aa45.95■■■■■ 4.95
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP170Q5SW79 1584 aa45.95■■■■■ 4.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.95■■■■■ 4.95
CAPNS1-211ENST00000590874 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.89■■■■■ 4.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.82■■■■■ 4.92
CAPNS1-211ENST00000590874 SHROOM2Q13796 1616 aa45.74■■■■■ 4.91
CAPNS1-211ENST00000590874 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
CAPNS1-211ENST00000590874 JPH4Q96JJ6 628 aa45.44■■■■■ 4.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.41■■■■■ 4.86
CAPNS1-211ENST00000590874 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms